Projets financés
Pathogènes d’insectes et risques épidémiques dans les fermes de mouches soldats noires – FLYPATH
La bioconversion des déchets organiques par les insectes offre des perspectives innovantes pour une alimentation durable et respectueuse de l'environnement. Toutefois, les élevages d'insectes sont exposés aux risques sanitaires liés aux agents pathogènes qui peuvent affecter la santé et la productiv
Les Coraux et leurs NeuroPeptides – CNP
Le projet franco-taïwanais CNP a pour objectif de mieux comprendre les caractéristiques biologiques des coraux en se concentrant sur leur neurobiologie. Les coraux sont membres de l'embranchement des cnidaires, qui comprend les anémones de mer, les hydres et les méduses. En général, les cnidaires n'
Perception et signalisation systémique de l'homéostasie du fer chez les plantes – IRONSENS
Le fer (Fe) est essentiel au bon rendement des cultures et l'alimentation humaine. Nous (Taïwan) avons découvert deux voies pour améliorer l'assimilation du Fe dans les plantes. La première consiste à augmenter l'expression d'une famille de peptides appelés IRONMAN (IMA) impliqués dans la signalisat
Explorer la diversité génétique d'E. coli pour mieux comprendre comment les protéines anti-adaptatrices modulent la réponse générale au stress. – IrAdapt
La bactérie E. coli est retrouvée dans divers habitats naturels auxquels elle doit s’adapter. La réponse générale au stress est une réponse adaptative majeure médiée par le facteur sigma alternatif RpoS. RpoS contrôle l’expression de ~500 gènes impliqués dans des processus responsables de problèmes
FACTEURS DE TRANSCRIPTION POUR L'ADAPTATION DES LIPIDES EN REPONSE A LA TEMPERATURE CHEZ LA PICOALGUE OSTREOCOCCUS TAURI – PICO-FLIRT
Les microalgues marines produisent des lipides particuliers et valorisables dont les acides graspolyinsaturés à très longues chaines (VLC-PUFAs). Elles sont cruciales dans les systèmes océaniques, contribuent à fixer le CO2 atmosphérique et sont identifiées comme une source durable de biocarburant e
Evolution du Système Immunitaire des Plantes – EPIS
La résistance naturelle des plantes aux maladies repose en grande partie sur un très grand nombre de récepteurs immunitaires (IRs). Ces récepteurs sont codés par des gènes qui ont des caractéristiques particulières : il se dupliquent à un taux très élevé, présentent une diversité nucléotidique parti
Souris des villes, souris des champs : adaptations, résistance, pathogènes et gestion le long d’un gradient d’anthropisation – MiCity
Parmi les espèces synanthropes, la souris domestique (Mus musculus) figure parmi les plus abondantes et les plus proches de l’homme, occasionnant des dommages et représentant un risque majeur en tant que porteuse de pathogènes. La souris fait face à de multiples challenges adaptatifs le long du grad
Devenir, régulation et impact de l'ADN-T dans l'interaction Agrobacterium-Arabidopsis – MOBIL_DNA
Le transfert inter-espèces d'éléments mobiles contribue à l'évolution des génomes eucaryotes. Pourtant, la dynamique, le contrôle et les impacts à court terme de ce processus sont mal connus, car difficiles à étudier. L'ADN-T est un élément mobile transféré de la bactérie Agrobacterium tumefaciens à
Contribution des invaginations nucléaires à l'endoréduplication au cours de la croissance du fruit chez la tomate – NUCLINV
Le projet NUCLINV vise à élucider quand, comment et pourquoi l'enveloppe nucléaire forme des invaginations nucléaires (NI) et de démontrer que celles-ci contribuent à l'endoréduplication (EDR), un processus du développement à l’origine de la polyploïdie somatique chez les plantes. Le but ultime est
Implication des vésicules extracellulaires bactériennes sur l’écologie des phytobactéries – PHYEVE
Les vésicules extracellulaires (VEs) qui sont produites par l’ensemble des organismes permettent le transport de nombreuses molécules à distance de la cellule d’origine. Ces VEs sont maintenant clairement établies comme des acteurs phares de la communication intercellulaire. Toutefois, le rôle des v
Du sol aux spiritueux : influence de la disponibilité de l'azote dans le sol sur le microbiome racinaire, la composition du raisin et l'arôme du vin dans la région de Cognac en vue d'améliorer les pra – INFINITY
Face au changement climatique, l'évolution des pratiques viticoles implique de relever des défis majeurs du vignoble à la vinification, tout en assurant une qualité de production constante. Les racines de vigne, à l'interface sol-plante, développent des associations étroites avec des communautés mic
Utilisation de la bio-acoustique pour gérer les espèces exotiques envahissantes : le cas du silure glane silurus glanis – BAMAS
En France, de nombreuses pressions pèsent sur les poissons migrateurs amphihalins et engendrent leur déclin, à tel point que tous sont menacés voire en danger d’extinction. Atténuer les pressions qui s’exercent sur ces espèces migratrices constitue donc un enjeu de conservation majeur. Afin de rétab
Evolution des chromosomes sexuels chez les poissons Characoidei – CharaSex
L'évolution des chromosomes sexuels (CS) est une question ancienne en biologie évolutive. Ainsi il y a plus d'un siècle H.J. Muller suggérait déjà que les CS naissent en fixant un nouveau gène déterminant du sexe (DS) sur un autosome ancestral, suivi par l’accumulation d’allèles spécifiques au sexe
Répondre aux menaces du changement climatique pour la production de café : Etude des métabolismes de la proline et énergétique pour une meilleure résilience du caféier à la sécheresse – ACT-COFFEE
La production de café est confrontée à d'importants défis liés à l'augmentation de la température moyenne mondiale et aux changements du régime des précipitations, ayant un impact direct sur la disponibilité de l'eau. Les estimations du Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat
Réponses de l’holobionte de l‘abeille aux perturbations environnementales, en particulier aux bioagresseurs invasifs – holoBEEont
L’abeille Apis mellifera est une espèce emblématique d’importance écosystémique et économique dont les colonies sont menacées mondialement. Le projet HOLOBEEONT vise à étudier la réponse de l'abeille à son environnement abiotique et à ses bioagresseurs, du point de vue de son holobionte, l’unité fon
Régulation redox du développement racinaire chez Arabidopsis en réponse aux variations de nitrate et au stress hydrique – NIDROROX
Subvenir aux besoins alimentaires d’une population humaine en pleine expansion dans un contexte de changement climatique représente un défi majeur pour l’agriculture de demain, qui devra dans le même temps atténuer son impact sur l'environnement. La régulation de l’architecture des systèmes racinair
Ideotypes trans-espèces: Des sorghos ou des maïs "typés sorgho" pour les futurs scénarios de sécheresse et de hautes températures ? – TRIES
Les prévisions climatiques pour l'Europe indiquent que les scénarios de sécheresses sévères combinées à des températures intenses observés durant l'été 2022 risquent de devenir la norme en 2050. Dans ce contexte, le sorgho apparaît comme une alternative au maïs, plus tolérante au stress. Cependant,
Interrelations entre l’environnement ionique de l’apoplaste, et l’architecture des pectines et l’intégrité pariétale dans la tolérance au stress salin chez les végétaux – SOSPECT
La salinité des sols constitue le second stress abiotique (après le stress hydrique) dans le monde, dont les pays européens du pourtour méditerranéen, limitant le rendement des espèces cultivées telles que le riz. L’ion Na+ est la principale cause de stress salin. La capacité des plantes à tolérer l
Effet de l'engrais azoté sur la nutrition et la virulence des phytopathogènes – NitroVir
Depuis les années 1940, il a été montré de nombreuses fois que les engrais azotés impactent la dynamique d’infection de plantes par des pathogènes. Cependant, les réponses varient de pathosystème à pathosystème : pour certains couples plante-pathogène, une limitation en azote accélère la maladie tan
Le métabolisme de l’hydrogène dans le rumen à la croisée des chemins : entre réduction des émissions de méthane et amélioration des fermentations ruminales – H2Rumen
La réduction des émissions de méthane (CH4) des ruminants constitue un enjeu majeur pour le secteur de l’élevage. Une stratégie optimale de réduction du CH4 doit également induire des co-bénéfices tels que l’amélioration de la productivité et de la santé animale. Le CH4 est produit lors de la fermen
COmmunication par des protéines de type MFT pour les caractères de qualité des semences – COMFiSEED
Les protéines MFT (MOTHER-OF-FT-AND-TFL1-like) appartiennent à la famille des PhosphatidylEthanolamine-Binding Proteins sont des très bons candidats pour coordonner certaines signalisations entre les compartiments des graines. Le projet COMFiSEED vise à explorer l'hypothèse selon laquelle les protéi
Les RiPPs fongiques en scène : De nouveaux peptides bioactifs – FRiPPon
Le projet FRiPPon vise à explorer une nouvelle classe de peptides fongiques appelés dikaritines, et à comprendre leur rôle en tant qu'effecteurs chimiques chez les champignons qui interagissent avec les plantes. Les champignons produisent une large gamme de métabolites secondaires (SM) qui agissent
Identification de loci fonctionnels impliqués dans la manipulation de l'hôte et du vecteur par les virus de plantes – PHENOMANI
Avec l'interdiction des pesticides en Europe et les phénomènes récurrents de résistance aux insecticides, la fréquence des maladies virales transmises par les insectes dans les paysages agricoles est en forte augmentation. Les virus de plantes sont déjà responsables de dégâts considérables dans l'ag
Etudier les bases moléculaires de la diversité phénotypique observée chez les charançons du genre Sitophilus et leurs bactéries symbiotiques – ESSENTIAL
La plupart des insectes nuisibles exploitant des milieux nutritionnellement déséquilibrés vivent en association symbiotique avec des bactéries intracellulaires (endosymbiotes) qui complètent leur alimentation, améliorant ainsi leurs pouvoirs adaptatif et invasif. Avec l'augmentation de la résistance
Stress UV et développement: dynamique du génome-épigénome en lien avec la capacité d'endommagement de l'ADN et les mécanismes de réparation – UVchrom
Les plantes utilisent la lumière comme source d'énergie et comme signal pour déclencher des transitions développementales. Cependant certaines longueurs d’ondes de la lumière du soleil, comme les rayons ultraviolets (UV), affectent l'intégrité cellulaire et génomique. Dans ce projet nous souhaitons
Vers une compréhension des mécanismes sous-jacents à la prémunition – ToProtectMe
La co-infection par des micro-organismes a été établie pour presque toutes les plantes hôtes étudiées. Les connaissances sur leurs interactions restent cependant encore limitées, complexifiées par le nombre élevé de micro-organismes présents au sein d’un seul hôte. Un intérêt particulier est porté d
Identification de régulateurs clefs du changement de mode de reproduction chez le puceron – AphiSwitch
Les pucerons comptent parmi les plus importants ravageurs des cultures agronomiques. Un tel succès s’explique en grande partie par leur remarquable capacité à pouvoir s’adapter aux fluctuations de leur environnement. Ils sont en effet capables de mettre en œuvre une plasticité phénotypique extrême (
Rôle de la méthylation du gamète mâle dans la transmission transgénératinnelle du stress thermique chez les poissons – MedHeat
Les poissons présentent une importante plasticité phénotypique face aux variations environnementales. Ils semblent en outre capables de transmettre des informations sur leur histoire de vie à leur descendance, susceptibles de modifier leurs performances. Ces informations, de nature non génétique, so
Dialogue entre signalisation hormonale et métabolisme des pectines pendant la croissance des plantes induite par la température – CROSSING
Identifier les mécanismes régissant la croissance dans le contexte du réchauffement climatique est essentiel pour l’amélioration des plantes. En effet, en réponse à une température élevée les plantes établissent une croissance rapide de certains organes, malheureusement au détriment des rendements.
Les niches microbiennes au service de la bioremédiation et de la bioaugmentation – MINI2BIO
Développer des méthodes durables et économiques pour restaurer efficacement les environnements pollués est urgent à l'ère de l'Anthropocène. Les approches de bioremédiation basées sur le métabolisme microbien des polluants organiques ont donné des résultats contrastés jusqu'ici. L’utilisation en con
Réseaux de régulation des ARN non codants contrôlant l'organogenèse des racines latérales chez les Brassicacées. – RESOLAT
Les longs ARN non codants (ARNnc) sont désormais reconnus comme des régulateurs de l'expression des gènes, de la conformation de la chromatine à la traduction des protéines, jouant un rôle clé dans divers processus biologiques. Cependant, leur mode d'action reste mal compris en raison de l'absence d
La polymérisation oxydative phénolique, une facette inexplorée de la formation de la cuticule des plantes – POP-UP
Les cuticules sont l'une des innovations les plus importantes qui ont permis la terrestrialisation des plantes. Souvent considérées comme de simples modifications conférant une imperméabilité à la paroi cellulaire végétale, leurs propriétés et compositions peuvent néanmoins varier considérablement s
L’évolution des éléments transposables comme moteur de la régulation de l’expression des gènes végétaux – SATURN
Les éléments transposables (ET) sont des composants ubiquitaires des génomes eucaryotes. D’abord considérés comme de l’ADN ‘poubelle’, ils sont aujourd’hui reconnus pour leurs impacts fonctionnels, notamment via leur capacité à fournir des éléments cis-régulateurs (ECR) contrôlant l'expression des g
Immunité vasculaire des plantes – VIP
Les pathogènes vasculaires colonisent les vaisseaux des plantes à partir des racines, hydathodes ou blessures et se propagent systémiquement dans tout l’organisme, allant jusqu’à causer la mort de l’hôte ou l’infection des graines. Outre les approches prophylactiques (désinfection des graines, prati
Stress induit par une phéromone d'alarme: facteurs de plasticité et de résilience chez l'abeille domestique – APIS
Les animaux possèdent des mécanismes physiologiques leur permettant de répondre de manière adaptée à des situations naturelles de stress, mais qui peuvent s’épuiser en cas de stress chronique. Cependant, ces mécanismes sont très mal connus chez les insectes. L’abeille domestique est une espèce de gr
Comprendre comment l'infection symbiotique est déclenchée chez les légumineuses à 'Lateral Root Base' nodulation – SymBase
Les légumineuses sont capables d’établir une symbiose fixatrice d’azote avec des rhizobia qui sont hébergés dans les nodules. Certaines légumineuses tropicales forment des nodules exclusivement à la bases de racines latérales (LRB), via la colonisation de couronnes de poils axillaires (ARH). Bien qu
Une étude originale pour comprendre l'adaptation des pathogènes fongiques à leur plante hôte et approfondir nos connaissances sur la durabilité de la résistance végétale. – AdaptAFungus
Les champignons phytopathogènes, tel que Pseudocercospora fijiensis causant la maladie des raies noires du bananier, sont une menace majeure pour la sécurité alimentaire mondiale. Une solution durable pour contrôler ces maladies reposent sur la création de variétés de plantes résistantes, cependant
Étude du rôle des protéines ABC-F dans le processus de traduction chez la cyanobactérie Synechocystis sp. PCC 6803 – ABCF_Cyano
La synthèse protéique consomme 30% des ressources énergétiques des organismes vivants. La régulation de la traduction est donc primordiale pour s’adapter aux changements environnementaux et préserver cette énergie. Cependant, pour le moment, les études sur la régulation de l’expression des gènes ont
Régulation transcriptionnelle de la biosynthèse de la subérine et son rôle dans la qualité des semences en réponse au stress thermique – LIPSTIQ
La qualité des semences, lesquelles sont utilisées pour des usages agroalimentaires et servent de vecteur de propagation chez les plantes cultivées comme chez les espèces sauvages, est conditionnée à la fois par leur contenu (quantité et composition des composés de réserve) et par leurs caractéristi
Modulation inter-organes des réseaux de régulation des gènes chez les plantes : l'exemple des gènes CUP-SHAPED COTYLEDON – Imogen
Les facteurs de transcription CUP-SHAPED COTYLEDON (CUC) sont des acteurs clés, conservés au cours de l'évolution, qui dirigent le développement des organes aériens des plantes. Cependant, les mécanismes cellulaires et moléculaires qui sous-tendent ces rôles développementaux restent encore largement
Intégration multi-signaux en 3D des primordia d'ovule pour étudier la fonction des domaines frontières – LOVE_ME
Au cours du développement des plantes, les domaines frontières (BD) délimitent les organes et orchestrent leur croissance et leur différentiation. Les régulateurs opérant dans les BD sont réutilisés tout au long du développement de la plante, par exemple pour initier les primordia des ovules. Afin d
Mécanismes de virulence du virus de la Peste Porcine Africaine – MECHAVIR
La Peste Porcine Africaine (PPA) est une maladie épizootique mortelle qui touche principalement les porcs domestiques et les sangliers sauvages. Sa réémergence en Europe et en Asie ces dernières années représente une menace importante pour l'industrie de l'élevage. En effet, il n'existe actuellement
Etude du métabolisme des protéoglycanes et des glycosaminoglycanes dans l'opportunisme bactérien – OPPORTUNITY
Enterococcus faecalis est une bactérie commensale qui colonise de manière précoce le tractus gastro-intestinal de l’Homme et représente 1% de sa flore totale. Cependant, elle peut également devenir opportuniste, et provoquer 10% des infections nosocomiales en France, comme des endocardites, des infe
Phénotypage in vitro de nouvelle génération chez le porc grâce aux cellules souches embryonnaires pluripotentes – STEM4PIGS
Les changements globaux actuels nous obligent à repenser nos systèmes d’élevage pour réduire la pression sur les écosystèmes, augmenter la sécurité alimentaire et sanitaire et mieux prendre en considération le bien-être animal. Pour atteindre ces objectifs globaux, le phénotypage à haut-débit du fon
Identification des gènes requis pour les interactions plante-plante chez le blé hexaploïde – Intera-Wheat
L'avènement de la révolution verte a entraîné des avancées significatives dans la productivité agricole grâce à la sélection de variétés de plante à haut rendement en monoculture dense et à l'utilisation intensive d'engrais et de pesticides. Cependant, ce virage vers la monoculture a accéléré le dév
Rôle du calcium, des ROS et de l'organisation nanométrique de la membrane plasmique dans la réponse immunitaire antivirale chez Arabidopsis – Ca-ROS
Les virus des plantes sont des pathogènes intracellulaires obligatoires qui menacent la sécurité alimentaire et entraînent des milliards de dollars de pertes agroéconomiques chaque année. La compréhension de la nature moléculaire de la résistance de l'hôte et des mécanismes de défense viraux est cru
Des métabolites spécialisés timides : Un rôle pour les effecteurs non-protéiques dans les interactions plante-champignon ? – ShySM
Le projet ANR-JCJC ShySM a pour but de comprendre le rôle joué par les métabolites spécialisés que produisent les champignons phytopathogènes hémibiotrophes spécifiquement au cours l’infection. Le projet se focalisera sur les molécules produites au cours de la phase biotrophe, là où leur rôle est su
Rôle des longs ARN non codants symbiotiques dans le contrôle de l'expression génique au cours du développement nodulaire – ISLAND
Les plantes peuvent établir des associations symbiotiques pour acquérir les nutriments essentiels à leur croissance. Les symbioses entre légumineuses et bactéries du sol conduit au développement nouveaux organes racinaires appelés nodules, hébergeant les bactéries de manière intracellulaire permetta
Sur la piste des processus ancestraux de polarité cellulaire DIX-domain-dépendants dans les symbioses nodulaires des racines des plantes – ADDORE
Certaines plantes sont capables d'établir des symbioses racinaires avec des bactéries du sol pour acquérir de l'azote, nutriment essentiel à leur croissance. Les bactéries fournissent de l'azote à leur hôte au sein de nouveaux organes racinaires spécialisés, appelés nodules, formés par la dédifféren
Evolution des chromosomes sexuels et des systèmes de déterminisme du sexe chez l'igname – EvoSexYam
Les trajectoires évolutives divergentes des chromosomes sexuels et du déterminisme sexuel au sein d'une même famille de plantes ont longtemps suscité l'intérêt de la communauté scientifique. Chez les ignames (Dioscorea spp.), plantes à tubercules d'importance économique alimentant plus de 500 millio
Epigénétique des interactions mycorhiziennes – EpiMyc
Une caractéristique intrinsèque des arbres des écosystèmes forestiers boréaux et tempérés est l'association mutualiste avec des champignons ectomycorhiziens (ECM) du sol au niveau de leurs racines. Les ECM fournissent aux arbres des nutriments et reçoivent en retour des molécules carbonées de la pho
Décryptage des voies de biosynthèse et du rôle biologique des n-alca(è)nes chez les algues brunes – BROWN_ALKAENES
Les alcanes et les alcènes sont des hydrocarbures acycliques synthétisés par un grand nombre d'organismes, y compris les algues des lignées verte, rouge et brune. Malgré cette distribution ubiquitaire au sein de la diversité algale, les voies de biosynthèse des alca(è)nes restent très méconnues chez
Comprendre comment des signaux symbiotiques de rhizobium reprogramment des tissus internes de la racine en lien avec la nutrition – INSIDER
Les plantes de la famille des légumineuses sont capables de s’associer avec des bactéries du sol fixatrices d’azote appelées rhizobia. Cette association symbiotique conduit à la formation de nodosités pour héberger les bactéries au niveau des racines. Lors de la mise en place de cette association, l
Mécanismes immunitaires impliquant des NLRs résilients à température élevée – NLResET
Les maladies des plantes constituent une menace majeure pour la production agricole. Les récepteurs immunitaires végétaux qui appartiennent à la famille Nod-like receptors (NLRs) assurent une protection efficace contre des agents pathogènes spécifiques. Cependant, l'immunité médiée par les NLRs est