Mécanismes de virulence du virus de la Peste Porcine Africaine – MECHAVIR

La Peste Porcine Africaine (PPA) est une maladie épizootique mortelle qui touche principalement les porcs domestiques et les sangliers sauvages. Sa réémergence en Europe et en Asie ces dernières années représente une menace importante pour l'industrie de l'élevage. En effet, il n'existe actuellement aucun traitement prophylactique ou thérapeutique largement disponible, laissant aux pays affectés une seule option : l'abattage massif des troupeaux infectés. En effet, les souches virulentes du Virus de la Peste Porcine Africaine (VPPA) affichent des taux de mortalité proches de 100 % chez les porcs. Les souches atténuées du VPPA contiennent quant à elles de larges délétions dans leurs génomes qui réduisent considérablement la gravité des symptômes. Le développement de vaccins vivants atténués basés sur ces souches atténuées (de façon naturelle ou génétiquement modifiées) constitue à ce jour le meilleur espoir pour développer un vaccin efficace contre la PPA. Élucider les mécanismes de virulence et d'atténuation du VPPA permettrait de mieux comprendre la protection offerte par ces candidats vaccins et de guider le développement de nouveaux vaccins. Les souches atténuées du VPPA induisent une réponse cytokinique différente de celle des souches virulentes, mais les mécanismes moléculaires responsables de ces différences restent mal compris. Nous émettons l'hypothèse que ces souches virulentes et atténuées du VPPA interfèrent de manière distincte avec la réponse immunitaire innée du porc, ce qui serait responsable des différences de pathogenèse. L'objectif principal du projet MECHAVIR est de caractériser les étapes clés de la réponse immunitaire innée aux souches de VPPA de différents niveaux de virulence. D'abord, nous identifierons quels senseurs de l’immunité innée reconnaissent le VPPA pour initier la réponse de l’immunité innée. Nous déterminerons si des senseurs autres que cGAS/STING sont impliqués, et si des interactions entre les voies de détection peuvent influencer ce processus. Nous étudierons également comment le VPPA active (ou inversement, perturbe) les voies de signalisation NFkB et IRF3, et comment cela affecte la réponse cytokinique en aval. Nous utiliserons pour cela des techniques de microscopie confocale et de transcriptomique à moyen débit. Enfin, nous examinerons comment l'interféron (IFN) bloque le cycle viral du VPPA. Nous mettrons en œuvre une approche originale de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNAseq) pour découvrir quels IFN Stimulated Genes (ISGs) bloquent le cycle de réplication de la PPA. Nous comparerons différentes souches virulentes et atténuées du VPPA tout au long de ce projet afin de mettre en lumière les mécanismes de virulence du VPPA. Ces travaux fourniront les connaissances nécessaires pour la mise au point de futurs vaccins vivants atténués pour le VPPA.