Epigénétique des interactions mycorhiziennes – EpiMyc

Une caractéristique intrinsèque des arbres des écosystèmes forestiers boréaux et tempérés est l'association mutualiste avec des champignons ectomycorhiziens (ECM) du sol au niveau de leurs racines. Les ECM fournissent aux arbres des nutriments et reçoivent en retour des molécules carbonées de la photosynthèse. Ces échanges améliorent la nutrition de l'arbre et ainsi sa croissance et ses performances. Les événements moléculaires au cours de l’interaction mutualiste ont été décrits, mais le rôle de l'épigénétique lors de la mycorhization reste à établir. Une publication de notre consortium suggère que plusieurs gènes de l'hôte et du champignon impliqués dans l'interaction mutualiste sont sous contrôle épigénétique, suggérant un nouveau niveau de régulation des gènes dans des interactions déjà complexes. EpiMyc vise à établir la causalité entre les variations épigénétiques dans l'arbre ou le champignon et la reconnaissance, l'établissement et le fonctionnement de la mycorhization. EpiMyc réunit des disciplines expérimentales et informatiques dans une approche intégrative exploitant le système arbre peuplier (Populus spp.) avec le champignon ECM Laccaria bicolor. EpiMyc rassemble des spécialistes de la mycologie, de l'écophysiologie des arbres et d’épi/génomique pour i) Distinguer les changements épigénétiques constitutifs et inductibles au cours de la mycorhization et voir comment cela peut être étendu à l'établissement du microbiote racinaire, ii) Tester la variabilité génétique naturelle des populations d'arbres quant à leur capacité à établir une ectomycorhization et identifier les variations épi/génomiques associées, iii) Évaluer la plasticité et la signification biologique de l'association ECM en cas de déficit hydrique et iv) Réaliser une analyse intégrative modélisant les relations multi-échelles entre les caractéristiques de la mycorhization et leurs déterminants moléculaires et la validation fonctionnelle de gènes candidats à l'aide de l'édition du génome.