Stress UV et développement: dynamique du génome-épigénome en lien avec la capacité d'endommagement de l'ADN et les mécanismes de réparation – UVchrom

Les plantes utilisent la lumière comme source d'énergie et comme signal pour déclencher des transitions développementales. Cependant certaines longueurs d’ondes de la lumière du
soleil, comme les rayons ultraviolets (UV), affectent l'intégrité cellulaire et génomique. Dans ce projet nous souhaitons élucider les mécanismes de maintien de l’intégrité du génome et
de l'épigénome lorsque les plantes sont très sensibles à la lumière et lorsque le génome nucléaire subit une phase importante de reprogrammation. Cette situation se produit lorsqu'un
semis en germination, adapté à l'obscurité, perçoit la lumière pour la première fois. Lors de l'induction de la photomorphogenèse, le déroulement précis de la dynamique architecturale
nucléaire doit donc faire face à l'effet délétère des UV pour assurer avec exactitude l’augmentation massive de la transcription, l'expansion du noyau, la formation de foyers
hétérochromatiques et les changements dans la topologie 3D du génome. En effet, l'exposition aux UV déclenche, de façon opposée, une relaxation de l'hétérochromatine, interfère
avec la transcription et altère la méthylation de l'ADN. Ainsi, en utilisant le modèle du dé-étiolement, permettant une transition cellulaire hautement contrôlable et indépendante de la
division cellulaire, le projet UVChrom abordera la question ambitieuse des mécanismes liant l'expression du génome et la dynamique de l'épigénome à la capacité de l’ADN à être
endommagé par les UV et aux processus de réparation de l’ADN. En utilisant la génétique, la génomique et la capture de conformation chromosomique, le projet fournira des
informations fonctionnelles, au cours du déroulement du dé-étiolement, sur la dynamique des choix des voies de réparation dans des contextes distincts de séquence, de chromatine et
d’endommagement de l’ADN. Le but étant d’identifier les interactions moléculaires complexes régulant un changement développemental et les réponses au stress au cours d'une
transition cellulaire.