Projets financés

La méthylation de l’ADN catalysée par les méthyltransférases d’ADN (DNMT) contrôle, de manière réversible, l’expression des gènes. Il a été démontré que les DNMT humaines, i.e. DNMT1, DNMT3A et DNMT3B, sont des cibles thérapeutiques dans diverses pathologies. Néanmoins, seuls deux inhibiteurs de DNM

Le traitement des infections pulmonaires à Mycobacterium abscessus (Mab) représente un défi majeur en raison de l’extrême résistance de ce pathogène à de nombreux antibiotiques. De plus, les mécanismes de la pathogenèse de Mab restent peu compris, notamment ceux impliqués dans l’interaction précoce

Les acides gras (AGs) sont des acides carboxyliques composés d’une chaine aliphatique saturée ou (poly)insaturée. Ils sont les constituants majeurs des lipides bactériens en particulier en tant qu’esters dans les phospholipides membranaires. Les AGs se trouvent également dans l’environnement sous fo

La monoxyde de carbone déshydrogénase à nickel/fer (CODH) est une enzyme multi-métallique complexe et sensible à l'oxygène qui joue un rôle clé dans le métabolisme du carbone dans les micro-organismes anaérobies. Son site actif, constitué d'un centre hétéro-nucléaire NiFe4S4 (connu sous le nom de cl

Le projet CYANOMAN vise à élucider le processus de biominéralisation conduisant à la formation d'inclusions intracellulaires de carbonate de calcium amorphe (iACC) chez les cyanobactéries. Ces inclusions, que l'on trouve dans diverses souches de cyanobactéries, stockent des quantités importantes de

L'oxydation de la méthionine (OM) convertit la méthionine (Met) en sulfoxyde de méthionine (MetO). Dans les protéines, l’OM peut être à double tranchant. Les Met exposées en surface séquestrent les oxydants, protégeant ainsi les résidus clés tels que les sites catalytiques contre les dommages oxydat

Les inclusions lipidiques intrabactériennes (ILI) revêtent une importance cruciale dans le cycle de vie des actinomycètes. Chez les mycobactéries pathogènes, telles que Mycobacterium abscessus, ces organites, gorgées de triglycérides, contribuent à la dissémination bactérienne et à la tolérance aux

Les modifications post-traductionnelles (MPT) des protéines augmentent la diversité fonctionnelle du protéome et influencent presque tous les aspects de la biologie cellulaire et de la pathogenèse. Les voies de signalisation cellulaires sont régulées par les MPT en réponse à de multiples stimuli. Le

L’acétylation de la lysine des protéines est une modification post-traductionnelle majeure qui régule de nombreux processus biologiques. L'acétylation est une modification réversible qui est introduite par les lysines acétyltransférases (KATs) et éliminée par les lysines désacétylases (KDACs). Ces d

Les patients atteints de maladies métaboliques sont caractérisés par une perte d'espèces microbiennes du microbiome intestinale avec un nombre réduit de métabolites détectés dans leur sang, suggèrant que certains métabolites sont des médiateurs de l'interaction entre l'homme et son microbiote intest

Les bactéries détectent et répondent à de nombreuses signaux chimiques et physiques pour survivre et se reproduire. La transduction des signaux chez les procaryotes est dominée par les systèmes à composant unique, où le domaine de détection est directement fusionné au domaine de liaison à l'ADN, une

La réplication et le maintien de l'intégrité du génome sont des tâches primordiales pour tous les organismes. Pour répliquer leur génome exceptionnellement grand, les coronavirus (CoV) utilisent une machinerie unique et sophistiquée de synthèse de l'ARN et de correction des erreurs, composée d’au mo

Les pyrophosphates d'inositol (IPP) ont été récemment caractérisés comme d'importantes molécules de signalisation dans des organismes allant des plantes aux mammifères en passant par les moisissures visqueuses et les champignons. Des recherches approfondies ont été menées sur la voie des IPP, révéla

La machinerie centrale grâce à laquelle les hormones, protéines et neurotransmetteurs sont libérées à partir de vésicules d’exocytose est bien connue. Néanmoins, nous sommes encore loin d’avoir élucidé les mécanismes de régulation qui empêchent que des événements de sécrétion aléatoire surviennent.

Les systèmes de sécrétion de type VI (T6SS) sont des nanomachines contractiles bactériennes utilisant un mécanisme à ressort pour transporter de effecteurs dans les cellules cibles, et participent ainsi à la compétition et à la pathogenèse. Cet appareil est constitué d’une structure tubulaire, le co

Les bactéries Gram-négatives importent activement des nutriments à travers leur enveloppe grâce à des transporteurs dépendants de TonB (TBDT) couplés au complexe TonB qui exploite la force proton motrice (pmf) présente à la membrane interne. Ce complexe TonB est composé du moteur/canal ExbBD localis

Les Nocardioses sont des infections aux bactéries du genre Nocardia. Les Nocardia sont opportunistes et infectent des patients immunodéprimés ou ayant des pathologies sous-jacentes et sont considérées comme des pathogènes émergents. Les foyers d’infections sont notamment les poumons ainsi que le cer

Les vésicules extracellulaires (VE) influencent un large éventail de processus biologiques en jouant un rôle de médiateur dans la communication intercellulaire dans divers contextes physiologiques et pathologiques. Compte tenu de leur abondance dans les fluides biologiques et de leur biocompatibilit

Les anticorps sont des réactifs essentiels pour la recherche ainsi que pour les applications. Les pipelines de découverte d'anticorps se heurtent souvent à un goulot d'étranglement lors de la validation des candidats issus d'expériences de sélection (e.g. présentation sur phages). Nous proposons M

Les champignons infectent un milliard de personnes, 3 millions de manière invasive et la moitié mortellement. Les Candida sont les plus impliquées chez l'homme, contre lesquelles des médicaments antifongiques ont été développés, dont les azoles sont les plus utilisés. Candida devient résistant aux a

UNICORN vise à développer des approches métabolomiques de pointe basées sur la résonance magnétique nucléaire (RMN) afin d'offrir des solutions de pronostic et de diagnostic sans précédent pour la médecine personnalisée, avec une application à l'une des principales causes de décès dans le monde, les

Les machines moléculaires doivent être construites par des facteurs d'assemblage pour remplir leur fonction. Les intermédiaires sont dégradés par des mécanismes de contrôle qualité lorsqu'ils ne peuvent atteindre l'assemblage complet en raison de l'absence d'une sous-unité ou d'un facteur d'assembla

Mon projet vise à développer une plateforme in vitro permettant d'exprimer et d'étudier l'expression génétique chez des bactéries modèles et des bactéries non-modèles, cultivables ou non-cultivables du microbiome intestinal humain. Les organismes non-cultivables représentent la grande majorité des

La résistance des bactéries pathogènes aux antibiotiques (RA), incluant aux polymyxines de dernier recours, est un problème majeur de santé publique, nécessitant de trouver de nouvelles cibles thérapeutiques. Notre projet a pour but d’étudier une nouvelle voie modification du lipopolysaccharide (LPS

Parmi les 300 espèces de champignons pathogènes, le genre Candida est le plus fréquent. C. albicans est la principale espèce de Candida responsable d'environ 100 millions d'infections de muqueuses et d'environ 400 000 infections systémiques par an. De plus, l'augmentation du nombre de souches multir

L'arthrose, une maladie chronique dégénérative des articulations, est l'un des problèmes de santé publique les plus courants et une des principales causes d’handicap chez les adultes de plus de 65 ans. Son diagnostic est souvent posé tardivement, lorsque l’articulation est endommagée de façon irrémé

PhotoROS est un projet de recherche multidisciplinaire visant à développer des outils innovants pour étudier et contrôler l'activité de la MAO-B impliquée dans le stress oxydatif et les maladies inflammatoires, comme l'arthrose. Des études ont démontré que la MAO chondrocytaire produit des espèces r

Les modifications post-traductionnelles de la tubuline représentent un mécanisme important dans la régulation des fonctions des microtubules. Parmi ces modifications, la détyrosination consiste en l'élimination de la tyrosine C-terminale de l'alpha-tubuline. Cette modification est très présente dans

De nombreuses bactéries pathogènes expriment des capsules de polysaccharides, facteurs de virulence qui les protègent du système immunitaire de l’hôte. La capsule K1 des souches d’Escherichia coli responsables de méningites (et d’autres pathogènes) est composée d’acide polysialique (PSA). La chimie

Nous proposons une nouvelle approche systématique pour l'ingénierie de la spécificité de substrat de la catalyse enzymatique, qui reste un problème ouvert sans solution générale, en utilisant les protéases S1A comme système-modèle. La biologie structurale a permis d’identifier des mutations qui sont

La mitophagie est une forme d’autophagie sélective ayant pour rôle la dégradation des mitochondries dans les cellules eucaryotes. Dans une forme de mitophagie dépendante de l’ubiquitine, des protéines de la membrane externe mitochondriale sont ubiquitinées ce qui entraine leur reconnaissance par des

Les G-quadruplexes (G4s) sont des structures secondaires de l’ADN qui peuvent être ciblées spécifiquement par des petites molécules, ou ligands. Malgré des capacités similaires à interagir avec les G4s in vitro, ces ligands peuvent avoir des effets biologiques très différents, dont une activité cyto

Actuellement, les biomolécules modifiées sont souvent utilisées dans différentes stratégies thérapeutiques. Le but de ce projet est de développer un nouveau type de ligands de ciblage. Plus précisément, nous visons à développer des polycorps thérapeutiques (PB), c'est-à-dire des macromolécules multi

Notre projet a pour but d’élucider un mécanisme moléculaire permettant à la bactérie de détecter la présence de traces d’antibiotiques dans l’environnement. Des rapports alarmants indiquent que des concentrations environnementales d’antibiotiques influencent l’écologie microbienne et favorisent l’ap

Sur la base des propriétés neuroprotectrices de l'activation du récepteur aux cannabinoïdes 1 (CB1R), un certain nombre d'études ont exploré le rôle de ce récepteur dans plusieurs maladies neurodégénératives, dont la maladie d'Alzheimer (MA). La MA est une pathologie neurodégénérative qui entraîne u

TDP-43 est une protéine nucléaire, retrouvée sous forme d’inclusions cytoplasmiques dans les neurones des patients atteints par deux maladies neurodégénératives (SLA ou DLFT) qui n’ont à ce jour aucun traitement curatif efficace. Nous avons récemment démontré que les domaines RRM12 de TDP-43 se lien

Le remaniement du cytosquelette est un processus dynamique régulant la plupart des phénomènes physiologiques et pathologiques. De nombreuses molécules ciblent la dynamique des microtubules, mais elles sont souvent associées à des effets secondaires ou des résistances. Dans ce projet, nous voulons ci

Le projet DynaCycloP vise à développer une stratégie innovante et économique pour l’accès rapide à de larges bibliothèques de peptides cycliques de conformations définies et biologiquement stables. Pour cela, la chimie combinatoire dynamique sera utilisée comme outil pour greffer les chaines latéral

Les ROS mitochondriaux sont nécessaires à la production de cytokines pro-inflammatoires et à l’activité bactéricide des macrophages. La O-GlcNAcylation est une modification post-traductionnelle qui régule l'activité des protéines cytosoliques, nucléaires et mitochondriales. Deux enzymes contrôlent l

Le cholestérol est un lipide indispensable à la vie qui intervient non seulement dans la structuration des membranes, mais qui sert de précurseur à la biosynthèse des hormones stéroïdiennes, des acides biliaires et des oxystérols. Ces derniers sont des produits d'oxydation du cholestérol qui représe

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est la principale cause de bronchiolite et de pneumonie chez les nouveau-nés, mais aussi une cause majeure de mortalité chez les personnes âgées et les patients immunodéprimés. Bien qu'il existe des thérapies préventives (vaccins, anticorps monoclonaux), il n'y

Caulobacter crescentus est un organisme modèle pour l’étude des mécanismes de régulation contrôlant le cycle cellulaire et la différentiation bactérienne. Cette alphaprotéobactérie se divise de manière asymétrique produisant deux cellules filles morphologiquement et fonctionnellement différentes. La

Les modifications post-traductionnelles (PTM) sont cruciales pour réguler les fonctions cellulaires dans tous les organismes vivants, sur des échelles de temps courtes, en particulier chez les bactéries. Cependant, peu de choses sont connues aujourd'hui sur les acteurs impliqués dans l'acétylation d

Le projet POPS vise à élucider le rôle des polyamines dans la virulence bactérienne, en se concentrant sur les deux pathogènes Pseudomonas aeruginosa (Pa) et Staphylococcus aureus (Sa). Ces bactéries sont responsables d’infections respiratoires aiguës et chroniques, notamment chez les patients attei

La principale cause d'échec des candidats médicaments est le manque d'effet thérapeutique par rapport à la toxicité générale. Il convient donc de développer des nouveaux traitements plus efficaces pour dépasser les résistances aux traitements actuels et plus sélectifs pour limiter les effets seconda

Les persisters bactériens intracellulaires représentent une sous-population qui échappent transitoirement aux activités bactéricides des antibiotiques et sont la cause d’échecs thérapeutiques et d’infections récidivantes. Les signaux et les voies de signalisation associées, qui contrôlent l'émergenc