Projets financés
Bases moléculaires du transport des acides mycoliques par MmpL3, une cible thérapeutique prometteuse pour le traitement de la tuberculose – MyTraM
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) l'agent étiologique de la tuberculose (TB) est l'un des pathogènes humain les plus mortels. En dépit des traitements efficaces existants, Mtb a été responsable de la mort de 1,4 million de personnes et de 10 millions de nouvelles infections en 2015 selon l’OMS. Cette
Translocation des protéines aux travers des membranes biologiques – CROSS
En raison de son emplacement unique, la membrane plasmique doit concilier deux tâches apparemment antagonistes, agir comme une barrière protectrice maintenant l'homéostasie cellulaire tout en permettant l'échange de molécules requises pour la viabilité cellulaire ou impliquées dans la signalisation.
Caracterisation structurale et fonctionnelle d’un sous-complexe SKI chez Saccharomyces cerevisiae – SKA
Les ARNm sont soumis à un équilibre entre synthèse et dégradation qui va dicter le niveau de chacun des messagers dans la cellule. Cet équilibre est très régulé puisqu’il varie en fonction des stimuli extérieurs et, par ailleurs, la cellule est soumise à un contrôle-qualité qui va reconnaître les tr
Developement de glycomimétiques non glucidiques contre les lectines bactériennes – GLYCOMIME
Les interactions entre protéines et glycannes jouent un rôle primordial dans de nombreuses fonctions biologiques telles que la fertilisation ou la circulation des cellules du système immunitaires. Elles sont aussi impliquées dans des processus pathologiques tels que l’infection, la migration des c
Microscopie super-résolution par localisation de molécules uniques à température cryogénique. – Cryo-PALM
Une difficulté majeure actuelle dans le développement de la microscopie super-résolution à température cryogénique provient de l'absence de marqueurs fluorescents, notamment de protéines fluorescentes, qui soient phototransformables efficacement à très basse température. Le but principal de ce proje
Marquage des récepteurs endogènes dirigé par des ligands: application à l'étude des hétéromères D1-mGlu5 dans des neurones. – LANTHSLIDER
Ce projet permettra de lier de manière covalente une étiquette fluorescente à des récepteurs endogènes, dans leurs tissus natifs. Notre stratégie repose sur la synthèse d’un complexe composé d’un ligand spécifique du récepteur (qui sert d’appât), fusionné à un fluorophore (Lanthanide) par l‘interméd
Mécanisme de résistance aux peptides antimicrobiens par un transporteur ABC couplé à un système de régulation à deux composants chez Streptococcus pneumoniae – SpABC-TCS
La résistance aux antibiotiques est une menace de santé publique qui concerne tout les pathogènes bactériens ainsi que tous les médicaments thérapeutiques. Les peptides antimicrobiens constituent un élement majeur de défense de la plupart des organismes vivants contre les bactéries qui les infecte
Comprendre les mécanismes senseurs d'hème des pathogènes pour de nouvelles stratégies antibiotiques – HemeDetox
L’hème, le cofacteur de l’hémoglobine, est une molécule essentielle mais toxique pour tous les organismes. Alors que de nombreux pathogènes à Gram positif sont confrontés à la toxicité de l’hème du sang lors du processus infectieux, ceux-ci répondent par l’expression d’un transporteur d’efflux de l’
Conformations fonctionnelles du transporteur de protéines FhaC: ouverture latérale d'un tonneau beta dans une membrane biologique – OPEN_BAR
La voie de sécrétion à deux partenaires est dédiée à l’export de protéines, dont certains facteurs de virulence, à travers la membrane externe de bactéries Gram-négatives. Les protéines TpsB à tonneau ß transmembranaire assurent la sécrétion de leurs protéines substrats à travers cette membrane. Ell
Prevention des Conflits Transcriptionnels – PrTxConf
La transcription d’un gène est un processus fortement régulé qui obtient un « feu vert » lors d’une phase d’initiation, puis procède par une phase de transcription active extrêmement processive, pour enfin s’arrêter brusquement lors de la phase de terminaison de transcription. De façon générale, la
Electrophysiologie de la Mitochondrie Cardiaque – MITOCARD
L’objectif principal du projet MITOCARD est de conduire à des progrès majeurs dans la compréhension de la physiologie cardiaque, en intégrant les propriétés mitochondriales de signalisation cellulaire dans les mécanismes énergétiques du cœur. Il a été en effet démontré que dans le muscle cardiaque,
Structure et activités des sulfatases extracellulaires SULF – SULFatAS
Les héparanes sulfate (HS) sont des polysaccharides complexes présents en abondance à la surface des cellules et dans les matrices extracellulaires. Ces polysaccharides sont impliqués dans un très grand nombre de processus cellulaires, de par leur capacité à fixer et moduler l’activité d’un vaste ré
Une approche multidisciplinaire et intégrative pour comprendre l'assemblage, la structure et la dynamique d'une plateforme de queue contractile – T6-PLATFORM
Phages et bactéries ont développé des machineries contractiles permettant d'injecter des acides nucléiques ou des protéines dans des cellules cibles. Tandis que les bactériophages délivrent des acides nucléiques pour se multiplier, le système de sécrétion de Type VI (SST6) permet de transporter des
Prise de contrôle des entérobactéries par les phages – TakeoverBac
Au début du processus infectieux, les phages déjouent les mécanismes de défense et détournent les fonctions cellulaires de l'hôte à leur profit. Bien que les phages aient été découverts il y a maintenant un siècle, et qu'ils soient à l'origine de nombreuses avancées scientifiques et biotechnologique
Etude du démarrage de la traduction par cryo-microscopie électronique résolue en temps – TREMTI
Dans toutes les cellules, le démarrage de la traduction permet la sélection précise du premier codon à traduire sur un ARN messager, spécifiant ainsi la phase de lecture pour la synthèse protéique. Cette étape essentielle implique un complexe de démarrage macromoléculaire (IC) comprenant l’ARNm, la
Suivi site-sélectif et fidèle de modifications locales d'acides nucléiques en molécules uniques – SMFLUONA
De nombreux mécanismes cellulaires reposent sur des interactions dynamiques d'ARN ou d'ADN avec des protéines qui induisent des changements locaux et transitoires des acides nucléiques. Bien que la diffraction aux rayons X, la RMN ou la microscopie électronique fournissent des informations précieuse
Structure et fonctions de motifs amyloïdes impliqués dans la transduction du signal – SFAS
Les amyloïdes sont des agrégats de protéines impliqués dans l'étiologie de différentes maladies neurodégénératives fatales comme la maladie d'Alzheimer et la maladie de Parkinson dont l'impact social et médical est dévastateur. De façon remarquable, il est apparu ces dernières années que ce même typ
Mécanismes d’action des peroxirédoxines dans la réponse au stress oxydant et le vieillissement – PrxAGE
A. CONTEXTE Ce projet aborde le stress oxydant et le vieillissement par l’étude des peroxiredoxines (Prx), des peroxydases à cystéine catalytique (CP), impliquées dans la signalisation H2O2. La suroxydation de CP par H2O2 inactive ces fonctions et confère aux Prxs une activité chaperon de type hold
Sondes Protéomiques pour l’Elucidation des Interactions Polyphénol-Protéines – Vers le Développement d’Agents Thérapeutiques à Base de Polyphénols – POLYPHENOLPROT
Les polyphénols présents dans les plantes alimentaires sont reconnus pour exprimer des effets protecteurs sur la santé humaine en raison de leurs capacités à réduire l’incidence des maladies cardiovasculaires, cancers, désordres neurologiques et métaboliques, dégradations de la peau et des os liées
Enzymes de Plasmodium falciparum impliqués dans le métabolisme des purines : conception d'inhibiteurs sur la base des études structure/fonction/activité – PLASMOPUR
Plasmodium falciparum, responsable de la forme mortelle du paludisme avec 600 000 décès par an dans le monde, est la deuxième cause de mortalité après la tuberculose. Avec plus de 215 millions de personnes infectées, cette maladie demeure un problème majeur de santé publique mondial. En dépit d’inte
Biogenèse du chloroplaste: fonction, régulation et structure de l’ARN-polymérase plastidiale et de ses protéines associées PAP – PEPRegulChloro3D
La principale source de bioénergie renouvelable sur Terre provient de la capacité des plantes à convertir l’énergie solaire en énergie chimique dans un processus appelé photosynthèse se produisant dans le chloroplaste. Cette conversion énergétique s’accompagne de la consommation de dioxyde de carbon
Découverte de modulateurs allostériques ciblant les récepteurs nicotiniques alpha5 – NICOFIVE
Les récepteurs nicotiniques de l’acétylcholine (nAChR) sont des récepteur-canaux pentamériques qui assurent la communication excitatrice entre neurones. Dans le cerveau, le nAChR majeur est généré par l’association des sous-unités a4 et ß2, et une sous-population mineure contient également la sous-u
Rôle des partenaires pour définir la fonction cellulaire de la myosine VI – MyoActions
La génération de force par les moteurs moléculaires est essentielle pour de nombreux processus cellulaires. Activés par des partenaires, les moteurs peuvent utiliser cette force pour des rôles mécanistiques distincts, tels que le transport, l'ancrage et l'organisation des filaments d’actine. L'actio
Systèmes d’efflux minimaux pour l’étude fonctionnelle des complexes tripartites de la paroi bactérienne – MISTEC
Des décennies de surutilisation des antibiotiques pour lutter contre les infections bactériennes ont entraîné une augmentation dangereuse des souches pathogènes résistantes à la plupart des antibiotiques disponibles. Face à l’absence de développement de nouvelles molécules, la résistance aux antibio
Coordination des microtubules et de l'actine par les MAPs structurales – MAMAs
Dans les neurones matures, le cytosquelette est essentiel à l’activité des synapses, zones de contact entre cellules nerveuses constituées de compartiments pré- (le bouton axonal) et post-synaptiques (l’épine dendritique). Les fonctions cognitives du cerveau (mémoire, apprentissage) dépendent de la
Etude structurale du mécanisme d'intégration des rétrotransposons de levure dans les gènes transcrits par l'ARN Polymérase III – INstruc
Les rétroéléments se répliquent par transcription inverse de leur génome ARN en un ADN complémentaire qui est intégré de manière stable dans le génome de la cellule hôte par leur intégrase (IN). L'intégration n’est pas aléatoire in vivo. La spécificité d’intégration des rétroéléments dépend principa
Recrutement eIF3-dependant du ribosome par l'ARNm de l'histone H4 – H4translation
Notre laboratoire a montré que la traduction de l’histone H4 (H4 ci-après) combine des caractéristiques canoniques (dépendance vis-à-vis de la coiffe) et la stratégie virale (absence de scanning et recrutement interne des facteurs d'initiation) lors de l’étape d’initiation (Mol. Cell, 2011). L’ARNm
Caractérisation de l’architecture des RCPG à la surface des cellules vivantes par microscopie de force atomique en mode spectroscopie de force à molécule unique – GRApHICS
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs) constituent la plus grande famille de récepteurs de surface et une cible médicamenteuse majeure (~35 % des médicaments commercialisés). Néanmoins, nombre de ces médicaments présente des effets indésirables pouvant limiter leur utilisation. Pour améliore
Mécanismes moléculaires des régions C-terminales désordonnées et fonctionnelles des RCPG et impact sur les voies de la signalisation cellulaire dépendantes de l'arrestine – GPCteR
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) constituent la principale famille de récepteurs membranaires responsables de la communication cellulaire. Ils sont impliqués dans la plupart des processus physiologiques et physiopathologiques et constituent, de ce fait, une cible majeure pour des candid
Bases moléculaires et structurales de la biogenèse des centres fer-soufre permettant d'élucider la fonction moléculaire de la frataxine – FRATAXUR
Les centres fer-soufre (Fe-S) sont des groupes prosthétiques de protéines essentiels. Les défauts de synthèse des centres Fe-S conduisent à des maladies humaines graves telles que l'ataxie de Friedreich (FA), une maladie cardiaque et neurodégénérative due à un défaut d'expression de la frataxine. Bi
Echographie opto-acoustique de cellules individuelles ex vivo – EchoCell
Les propriétés mécaniques des cellules ou de leurs composants, telles que la compressibilité ou l’adhésion, sont impliquées dans plusieurs processus biologiques fondamentaux. La compréhension des mécanismes en jeu a fait l’objet d’un nombre de travaux de recherche croissant ces dernières années. Cep
Décrypter le rôle de la poroélasticité dans la dynamique tumorale grâce à une sonde acoustique multi-échelle – PoroTume
Malgré une compréhension raffinée du métabolisme des cancers, 90% des drogues expérimentales échouent lors des essais cliniques par manque d’efficacité. En cause le manque de prédictivité des modèles précliniques utilisés pour concevoir les thérapies génériques, et le peu d’indices physiopathologiqu
Etude d’un nouveau type de chaperonne à ARN – RNAchap
Dans tous les domaines du vivant, les ARN non-codants (ARNnc) sont des facteurs clés de la physiologie cellulaire. Ils interviennent dans de multiples processus et notamment dans la régulation de l’expression génique. Leur mécanisme d'action implique la reconnaissance d’homologie et l’appariement de
Lutter contre l'épidémie mondiale de tuberculose: Exploiter la variation cellule à cellule afin d’entraver la persistance adaptative – PersisTB
La tuberculose est l’infection humaine la plus létale et une des plus graves menaces globales à notre santé, causant presque 2 millions de morts chaque année. A cause de sa modalité de transmission par aérosol, chacun est vulnérable à cette maladie, qui atteint principalement les poumons mais peut a
Rôle de ST8SIA4 et de la polysialylation des protéines des macrophages dans la réponse immunitaire contre une infection par Mycobacterium tuberculosis – MacGlycoTB
CONTEXTE. Mycobacterium tuberculosis (Mtb), agent étiologique de la tuberculose (TB) chez l’homme, est responsable de près de 2 millions de décès par an. La TB est la troisième maladie due à un agent infectieux unique la plus meurtrière au monde, justifiant la nécessité de mieux comprendre les inter
Spécificités structurales et potentiel biotechnologique de la PolD, une ADN polymérase atypique d'archée – ARCHAPOL
Les ADN polymérases (ADNPs) sont des nano-machines capables de synthétiser de l’ADN à partir de nucléotides. Les analyses des séquences et des structures des ADNPs ont permis de les regrouper en sept familles : A, B, C, D, X, Y et la transcriptase-inverse. Au-delà de leurs fonctions biologiques esse
Physique du bourgeonnement des gouttelettes lipidiques – NANODROP
Les gouttelettes lipidiques (LD) sont les organelles régulant l'équilibre énergétique dans les cellules. Ils sont les principaux réservoirs de lipides de la cellule, jouent un rôle majeur dans la biogenèse membranaire et sont impliqués dans un certain nombre de maladies métaboliques et infectieuses.
Structure et fonction de complexes du ribosome humain – HumanRibosome
Le ribosome est une machinerie moléculaire composée de deux sous-unités composées d'ARN et de protéines. La petite sous-unité est responsable du décodage des ARN messagers alors que la grande catalyse la formation de liaisons peptidiques. L'obtention de diverses structures de ribosomes pro- et eucar
Presentation de l'antigene par le CMHII dans les cellules dendritiques de type 1 – Help2Kill
L’activation des lymphocytes T CD8+ cytotoxiques est une composante essentielle des réponses immunitaires protectrices contre les virus et les tumeurs. Ce processus est activé par la présentation des antigènes associés au CMHI par les cellules dendritiques de type 1 (CD1s) après la phagocytose de pa
Le rôle de l'histone H1 et de CENP-C dans la structure et les propriétés épigénétiques de la chromatine – Chrom3D
L'objectif à long terme de ce projet est d'élucider la structure des formes conventionnelles (non centromériques) et centromériques de la chromatine. Nous avons quatre objectifs principaux: Objectif 1: comprendre comment l'histone de liaison H1 interagit avec un nucléosome isolé. Plus spécifiquement
Cristallisation in vivo: une nouvelle stratégie pour étudier la structure et la dynamique des protéines dans les lasers à électrons libres et les synchrotrons. – X-in-vivo
L’avènement des lasers à électrons libres (XFELs) a révolutionné la biologie structurale, autorisant la détermination de structures macromoléculaires à partir de cristaux nanométriques et des études résolues en temps ultracourts (fs-ps). Le projet X-in-vivo vise le développement d’une méthode de nan
Nouveaux inhibiteurs de Pfrab6 et PfpyrK1 ciblant le paludisme – NINTARMAL
Plasmodium est le parasite protozoaire responsable du paludisme, première cause de mortalité parasitaire dans le monde. Selon le rapport de l’OMS 2015 sur le paludisme, 214 millions de personnes ont été infectées par Plasmodium en 2014, ce qui a entraîné 438 000 décès, dont environ 88% en Afrique, p
Etude cinétique du cycle des pentoses phosphates par méthodes de polarisation nucléaire dynamique avec dissolution (D-DNP) – enzypol
L’étude de la cinétique enzymatique et du métabolisme cellulaire est centrale pour la compréhension de la fonction cellulaire et des maladies métaboliques. Dans les cas d’affections génétiques, la capacité d’adaptation des enzymes cellulaires détermine souvent la sévérité de la maladie. Plus de 500
Production de protéines membranaires recombinantes insérées dans les membranes de cavéoles hétérologues – CAVEOTANK
Les protéines membranaires (PMs) jouent un rôle crucial dans une grande variété de processus cellulaires; elles sont impliquées dans de nombreuses pathologies et constituent des cibles pharmacologiques majeures. Leur surproduction dans des systèmes hétérologues est indispensable pour une analyse str
Carb2zyme: Nouvelle chimie pour la formation de liaisons carbone-carbone par une classe émergente de métallo-enzymes – Carb2zyme
La formation de liaisons carbone-carbone est un enjeu majeur pour l’industrie chimique. Néanmoins, seules quelques méthodologies sont disponibles pour la formation de liaisons carbone-carbone (C-C) sur des atomes de carbone non activés. Ces méthodes nécessitent le plus souvent l’utilisation de métau
d’une Nox bactérienne à la conception d’outil de criblage – BANDIT
Les NADPH OXydases sont de protéines transmembranaires qui assurent le transport des électrons à travers la membrane jusqu’à l’oxygène moléculaire induisant la production de superoxydes, précurseur des ROS. Les NOX sont impliquées dans divers processus physiologiques et pathologiques qui les ont pla
Des bicouches lipidiques stables au delà du point d'ébullition de l'eau – ArchaeoMembranes
On relie deux innovations majeures avec l'adaptation des membranes plasmiques aux pH et températures extrêmes: la synthèse de lipides transmembranaires bipolaires et la liaison éther des chaînes carbonées sur la molécule de glycérol. Les lipides bipolaires forment des monocouches avec une tête polai
allostérie, dynamique conformationnelle et signalisation via les RCPG – allosig
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) constituent la principale famille de récepteurs membranaires responsables de la communication cellulaire. Ils sont impliqués dans la plupart des processus physiologiques et patho-physiologiques et constituent une cible majeure pour des candidats médicame
Études mécanistiques de la réduction du CO2: exploration de la biodiversité des CO déshydrogénases – MeCO2Bio
Les CO déshydrogénases (CODHs) sont des métalloenzymes qui catalysent la réduction réversible de CO2 en CO, avec de hautes fréquences de turnover, en requérant de petites surtensions, et avec une très grande spécificité quant au produit de la réaction (seul du CO est produit, pas de formiate ni d’ox
Le clustering moléculaire: un nouvel outil pour la signalisation – MCS
Les réseaux de signalisation jouent un rôle fondamental pour la vie: pour qu’on puisse déchiffrer la manière dont les organismes accomplissent plusieurs tâches vitales, nous devons comprendre les principes des chemins de signalisation qui sont à la base de ces réseaux. Un mécanisme général pour cont