Etude d’un nouveau type de chaperonne à ARN – RNAchap

Dans tous les domaines du vivant, les ARN non-codants (ARNnc) sont des facteurs clés de la physiologie cellulaire. Ils interviennent dans de multiples processus et notamment dans la régulation de l’expression génique. Leur mécanisme d'action implique la reconnaissance d’homologie et l’appariement des bases de l’ARNnc avec sa cible et cette étape nécessite souvent la présence de chaperons protéiques. Chez les bactéries, la protéine Hfq était considérée comme la seule chaperonne à ARNnc trans-acting, mais nous avons récemment découvert un membre d’une nouvelle famille de chaperonne à ARN impliqué dans le control d’un mécanisme de transfert horizontal de gènes. Chez Legionella pneumophila, nous avons montré que la protéine RocC est la chaperonne à ARN d’un petit ARNnc trans-acting (RocR) qui ciblent les ARNm des gènes codant pour des protéines impliquées dans lors de la transformation génétique naturelle. Le premier objectif du projet est de définir les mécanismes moléculaires impliqués dans l’interaction de cette nouvelle chaperonne à ARN avec son ARNnc et dans la régulation de leurs ARNm cibles. Le deuxième but de ce projet est d’adapter le système RocC/R pour en faire un véritable outil de silencing ciblé. Enfin ce projet visera à mieux appréhender l’intégration du système RocC/R dans la physiologie bactérienne. Ce projet implique une combinaison d’expertises multiples dans les domaines de la microbiologie, génétique, biochimie et biologie structurale afin de mieux comprendre plus généralement les bases moléculaires de l’interaction protéine chaperonne – ARN.