Projets financés
Application des plasmas atmosphériques froids comme nouvelle approche thérapeutique de la fibrose hépatique et du remodelage des tissus – FiReCAP
Contexte scientifique La fibrose hépatique est une cicatrisation anormale du foie où le tissu sain est remplacé par une matrice extracellulaire (MEC) rigide et dysfonctionnelle. Elle résulte de lésions chroniques, activant les myofibroblastes, principaux agents de la fibrose, accompagnée d'une réac
Coordination de l’import des protéines et de leur assemblage en complexes protéiques par la voie d'import de la préséquence translocase mitochondriale – MitoAssembly
Les mitochondries sont des organites à double membrane essentiels des cellules eucaryotes. Elles ont un rôle crucial dans la bioénergétique cellulaire, et leurs dysfonctionnements peuvent entrainer des pathologies graves. Les mitochondries sont responsables de la production de la majeure partie de l
Vers une élucidation de la voie de biogenèse de l’ATP synthase mitochondriale humaine – ATPSYNBIO
L'ATP, la monnaie énergétique universelle des organismes vivants, est principalement produite par l'ATP synthase. L'ATP synthase est un nano-moteur rotatif qui couple la translocation des protons à travers la membrane à la synthèse de l'ATP. Dans les cellules eucaryotes, cette machine moléculaire ha
Etude du rôle des Héparanes Sulfates dans les synoviocytes issus de patients arthrosiques: simples biomarqueurs ou acteurs principaux de la sénescence ? – RHEPARANS
L'arthrose est la maladie articulaire la plus répandue, actuellement sans traitement efficace, dont le vieillissement de la population est le principal facteur de risque. Elle est due à une surcharge mécanique endommageant la matrice extracellulaire (MEC) du cartilage articulaire, une altération du
Synthèse enzymatique d'ARN et ADN sur micromatrices – METAL
L'approche chimique de la synthèse des acides nucléiques est actuellement remise en question par une nouvelle technologie qui utilise des enzymes indépendantes de la matrice. Cette approche enzymatique promet de surmonter les limites de la chimie des phosphoramidites et de réduire considérablement l
Imagerie multiplex de cellules vivantes avec des sondes luminescentes à base de lanthanides – MAGELLAN
Le contexte général de ce projet est l'imagerie par microscopie optique de cellules vivantes, et plus particulièrement l'imagerie multiplex, qui consiste à utiliser plusieurs sondes ensemble, chacune émettant à une longueur d'onde différente, afin de différencier et d'identifier diverses sous-struct
Analyse du mécanisme d'action de la 4-F4t-Neuroprostane par chimie biorthogonale – Ima-ClickChe
Les acides gras polyinsaturés oméga-3 (?3-PUFAs) et leurs dérivés jouent un rôle central dans de nombreux processus biologiques, notamment dans le contexte cardiovasculaire. Cependant, les mécanismes responsables de ces effets restent encore à élucider. Mieux comprendre ces mécanismes présente pourt
Contrôle de la fonction des organites par des complexes protéiques dans les sites de contact avec le réticulum endoplasmique – ControlER
Les cellules eucaryotes sont compartimentées en organites distincts aux fonctions spécialisées. Les sites de contact membranaires entre organites (MCS), où les membranes de deux organites sont étroitement apposées, sont désormais reconnus comme des centres essentiels pour l'échange de matériel, la f
Ingénierie enzymatique pour la production microbienne de pyoverdines améliorées pour des applications biomédicales. – PYOCLICK
La biosynthèse combinatoire s’appuie sur des approches d’ingénierie enzymatique et métabolique visant à modifier la production de peptides naturels, notamment en incorporant des acides aminés non canoniques (ncAA) dans leur séquence. Cette stratégie génère des peptides porteurs de groupements foncti
Exploration de la reconnaissance et de l’adressage cellulaire du domaine ubiquitaire de liaison au peptidoglycan, LysM – PEPLYS
Les protéines de surface bactériennes jouent un rôle crucial dans des processus fondamentaux tels que la croissance cellulaire, la division et les interactions avec l'environnement. Chez les pathogènes, ces protéines sont essentielles pour l'invasion des tissus et l'évasion du système immunitaire de
Interaction entre les dérivés lipoprotéines et AzaBODIPY : de la rationalisation à la conception d'une sonde fluorescente NIR spécifique sans biovecteur optimisée – LADY
Les lipides et les lipoprotéines (LPs) jouent un rôle crucial dans plusieurs processus physiologiques et pathologiques, comme l’athérosclérose, le risque cardiovasculaire et le développement du cancer. Les modifications des lipoprotéines de basse densité (LDL), telles que l'oxydation ou la glycation
Altérines, des peptides antimicrobiens modèles pour le renouvellement des antibiotiques – Alterin
Face à l’augmentation dramatique des multirésistances aux antibiotiques et aux prévisions alarmantes pour les décennies à venir, le renouvellement de l’arsenal thérapeutique est un enjeu prioritaire de santé publique mondiale que ce soit en médecine vétérinaire ou humaine.Le projet PAMoramix est un
Mécanismes moléculaires impliqués dans la régulation de l'adipogenèse par le transporteur de céramide CERT – CERADIPO
Le tissu adipeux blanc (TAB) est le principal site de stockage et de libération des graisses. Un déséquilibre de ce processus conduit à l'obésité et aux pathologies associées, notamment le diabète de type 2 (DT2) et les maladies cardiovasculaires. Sous l'effet d'un apport calorique accru, le TAB se
Biogenèse de la Rubisco chez les microalgues, des mécanismes à la surproduction – RubExCES
La Rubisco est une enzyme essentielle à la photosynthèse, car elle permet la fixation du carbone inorganique et joue un rôle primordial dans le cycle global du carbone. L'augmentation des rendements photosynthétiques est une quête de longue haleine qui garantirait la sécurité alimentaire. Dans les m
Plateformes duales pour l'optimisation des performances des CORMs et le suivi cellulaire – POPCORN
Le monoxyde de carbone CO est, a` faibles quantités, une molécule de signalisation cellulaire importante aux applications thérapeutiques potentielles nombreuses. Cependant, une difficulté majeure a` son utilisation clinique repose sur le contrôle de sa délivrance. Les complexes métalliques pouvant l
Ripps synthétisés par enzymes MNIO et séquestrant des métaux – MetalloRIPP
Le cuivre est essentiel mais toxique en excès. Les bactéries, exposées au cuivre notamment dans les phagocytes, ont développé plusieurs mécanismes de défense. Nous avons découvert une nouvelle stratégie de protection, via la biosynthèse de produits naturels appelés bufferines. Ces peptides, modifiés
Développement d'inhibiteurs du récepteur nucléaire DAF-12 pour traiter les maladies parasitaires – DIN-R
Les infections par les nématodes parasites constituent un enjeu sanitaire et économique majeur, causant des maladies graves chez l’homme et des pertes agricoles importantes. Les traitements actuels reposent sur des anthelminthiques dont l'efficacité diminue à cause de l’émergence de résistances sans
Régulation de l'asymétrie des phospholipides de la membrane plasmique : un mécanisme clé pour le contrôle du trafic membranaire cellulaire – TACLE
En plus de leur rôle structurel, les lipides (et principalement phospholipides (PLs)) sont des régulateurs clés de l'exocytose et de l'endocytose vésiculaires, deux processus essentiels à la sécrétion des hormones et des neurotransmetteurs. Une caractéristique de la membrane plasmique (MP) est la di
Absorption d'antibiotiques et Résistance aux Antibiotiques en Conditions de Carence en Fer chez Pseudomonas aeruginosa. – IRON-AMR
La résistance aux antibiotiques constitue une menace croissante pour la santé publique, en particulier pour les bactéries Gram-négatives, plus difficiles à traiter en raison de leur membrane externe protectrice. Cette membrane limite l'entrée des antibiotiques, renforçant ainsi la résistance bactéri
Développement de réactions bioorthogonales click and release faisant intervenir des tétrazines, comme outil théranostique – Thera-Tool
Afin de limiter les effets secondaires des traitements souvent lourds pour les patients, le développement de nouvelles approches thérapeutiques ciblées et efficaces reste à ce jour un défi colossal. Depuis quelques années, la découverte de la chimie bioorthogonale a permis d’élargir le champ des per
Dihydrouridylation de l'ARN ribosomique dans la traduction : Études mécanistiques et fonctionnelles – DREAM-RNA
Le projet DREAM-RNA vise à élucider le mécanisme de la dihydrouridylation de l’ARN ribosomique chez les bactéries et son rôle dans la fidélité de la traduction ainsi que dans l’adaptation des microbes au stress, en se concentrant sur la dihydrouridine en position 2449 (D2449) au niveau du centre pep
Une caisse à outils basée sur des aptamères pour caractériser les fonctions "moonlight" de la protéase MMP12 – ApTrack-N-Control
La multifonctionnalité des protéines est une façon très efficace d’augmenter la capacité codante d’un génome en dotant un même polypeptide de plusieurs fonctions différentes. Cela est illustré par la métallo-protéase MMP12 qui, en plus de son activité protéase extracellulaire, possède des propriétés
Exploiter le mécanisme catalytique de la métalloenzyme IspG en utilisant des outils moléculaires innovants – METALICAT
Le projet METALICAT propose de valider et d'exploiter le mécanisme d’action d’une métalloenzyme bactérienne impliquée dans la voie du méthylérythritol phosphate. Cette enzyme, appelée IspG (ou GcpE), catalyse la conversion du 2-C-méthyl-D-érythritol-2,4-cyclo-diphosphate (MEcPP) en diphosphate de (E
Dynamique structurale des hétérodimères contenant mGlu7 – HeteroDyn
Le principal transmetteur, le glutamate, est non seulement responsable de la transmission synaptique excitatrice rapide au niveau de 80 % des synapses, mais il joue également un rôle modulateur en agissant sur les récepteurs métabotropiques du glutamate (mGluRs). Huit sous-unités mGlu sont exprimées
Complexe Dishevelled/beta-Arrestin : Etude Structurale et Exploration Dynamic – DARC-SIDE
Positionné au carrefour des voies de signalisation WNT, Disheveled (DVL) intervient à la fois dans les voies de signalisation dépendantes et indépendantes de la ß-caténine, orchestrant ainsi des processus vitaux dans le développement embryonnaire. La dérégulation de ces voies de signalisation est di
Décryptage des peptides dérivés de la fibrine par dégradomique pour évaluer l'état inflammatoire de la pulpe dentaire – PULPITOMIC
Actuellement, le traitement des dents cariées présentant une inflammation sévère de la pulpe dentaire repose sur la dévitalisation, c’est-à-dire l'ablation du tissu pulpaire et son remplacement par un matériau inerte. Cette approche fragilise la dent plus fragile et l’expose à un risque accru de réi
Caractérisation d'un système de résistance aux peptides antimicrobiens impliqué dans la virulence de Streptococcus pneumoniae – VIRAMP
Les peptides antimicrobiens constituent un élément important de la première ligne de défense de la plupart des organismes vivants contre les bactéries qui les colonisent et sont actuellement considérés comme des thérapies alternatives prometteuses pour lutter contre les agents pathogènes, en particu
Elucider le mécanisme de régulation de biosynthèse des clusters Fe-S par le couple Frataxine/Ferredoxine-2 afin de définir de nouvelles cibles thérapeutiques pour l'ataxie de Friedreich – FER-FA
L'ataxie de Friedreich (AF) est une maladie neurodégénérative et cardiaque pour laquelle il n’existe aucun traitement efficace. Elle est causée par un défaut d’expression de la frataxine (FXN), une protéine mitochondriale impliquée dans la biosynthèse des clusters fer-soufre (Fe-S), des cofacteurs p
Analogues Fluorés de l'Angiotensine: vers le dévelopement d'Analogues Contraints Biaisés – FALCon
Les maladies cardiovasculaires sont des maladies non transmissibles considérées aujourd’hui comme la cause de décès la plus importante dans le monde. L’hypertension, reconnue comme l’une des causes majeures de nombreuses maladies cardiovasculaires, est fortement liée au système Renin-Angiotensine (R
électrochimie click pour la fonctionnalisation de protéines, vecteurs viraux et cellules par des sucres complexes – ELEC-TRICK
Les sucres complexes (SC) sont des ligands pertinents pour améliorer les propriétés pharmacologiques des protéines, induire des réponses cellulaires spécifiques et permettre une vectorisation ciblée en biothérapies. Ainsi, il y a un grand intérêt à développer une nouvelle méthode rapide de fonctionn
Outils hybrides chimiogenetiques pour l'imagerie haute résolution du zinc dans le cerveau – HyReZ
Le zinc(II) est présent dans certaines synapses glutamatergiques du cerveau, mais pas toutes, et contribue à la modulation de la transmission synaptique excitatrice et de la plasticité. L'importance du zinc dans le cerveau est désormais bien reconnue, mais il manque encore d'outils adéquats pour étu
Exploration des enzymes impliqués dans la propagation de bactériophages à ADN modifié – BEMOD
Dans le monde vivant, les génomes de bactériophages présentent la plus grande diversité chimique de nucléobases non-canoniques. Certains virus à ADN infectant des hôtes tels que les protéobactéries, les cyanobactéries et les les actinobactéries présentent une substitution totale de l'adénine par l'a
Outils avancés de lipidomique pour une analyse robuste et une caractérisation fine des feuillets membranaires des organites – ACYLOMICS
La lipidomique permet un profilage exhaustif des lipides dans les échantillons biologiques, notamment lors de la mise en œuvre d’une approche non ciblée associant chromatographie liquide et la spectrométrie de masse à haute résolution (LC-HRMS). Actuellement, la lipidomique non ciblée repose fréquem
Découvrir le mécanisme d'action d'une protéine mystérieuse en se concentrant sur ses propriétés physicochimiques uniques – SBSN
Nous étudions une protéine sécrétée dont l’expression est restreinte à quelques tissus, en particulier l’épiderme des mammifères où son absence est corrélée à des formes de dermatitis. Elle est également surexprimée dans le muscle en exercice, lors de l’adaptation à l’hypoxie en haute altitude et en
Suivi par RMN de l'engagement de médicaments sur leur cible en cellule et en organoïdes – LiveDrugsNMR
Nous voulons établir des protocoles pour la détection par RMN de l'interaction de médicaments à leurs cibles enzymatiques dans des cellules vivantes et des sphéroïdes, et illustrer les premières applications de ces protocoles. Les membres de l'équipe, experts en biologie structurale assistée par RM
Révéler et exploiter les caractéristiques biophysiques et évolutives des phages en milieu acellulaire – PHABETA
Les bactériophages jouent un rôle essentiel dans la nature, de l'échelle moléculaire à l'échelle écologique. Notre compréhension de leur cycle de vie est incomplète, en raison des limites des études quantitatives in vivo. Nous développons ici un cadre in vitro minimum plus propice à la quantificatio
Regulation des niveau de polysaccharide de réserve chez Toxoplasma gondii – PSBToxo
Toxoplasma gondii est le parasite responsable de la toxoplasmose. T. gondii fait partie de la famille des parasites apicomplexes qui comprend des parasites d’intérêt médical et vétérinaires. Le cycle de vie de T. gondii repose sur sa capacité à s’enkyster dans certains tissus. Cette étape cruciale d
Cartographie fonctionnelle des réseaux d'interaction des ligases de la famille cullin-RING – CRLnet
Le système ubiquitine est un réseau moléculaire essentiel qui contrôle de nombreuses protéines dans nos cellules. Il fonctionne en attachant une petite protéine appelée ubiquitine à d'autres protéines, soit pour ajuster leur activité, soit pour les marquer en vue de leur dégradation. Ce système joue
De nouvelles voies de biosynthèse pour produire de nouvelles dicétopipérazines – BioSyn
La résistance antimicrobienne représente une menace pour la santé publique, rendant nécessaire la découverte de nouveaux antimicrobiens. Les produits naturels constituent des réservoirs importants pour de telles molécules. Parmi eux, les 2,5-diketopipérazines (DKP) se démarquent par leurs activités
Décrypter la biosynthèse et la sécrétion des N-glycoprotéines chez Chlamydomonas reinhardtii – Secret_Story
Chez les Eucaryotes, les protéines sécrétées qui transitent dans le reticulum endoplasmique (RE) puis dans l’appareil de Golgi (AG) subissent de nombreuses modifications post-traductionnelles dont la N-glycosylation, qui consiste en l’attachement d’un oligosaccharide sur un résidu d’asparagine (N) d
Sélection d'anticorps spécifiques dirigés contre l'ADN i-motif – SEA-iDNA
Les principaux objectifs du consortium sont de sélectionner par phage display des anticorps spécifiques de l'ADN i-motif en utilisant des outils chimiques innovants (i-motif contraints) et de les valider in cellulo. Les i-motifs sont des structures d'ADN à quatre brins dans lesquelles les cytosines
Glycanosomes : Pour l'Avancement de la Glycobiologie – GlycoTAG
Les glycanes sont des acteurs essentiels d’une myriade de processus biologiques. Cependant, en raison de leurs complexes structures et du manque d'outils biologiques pour les étudier spécifiquement, le rôle précis et spécifique des glycanes au sein des cellules/tissus est encore méconnu. La délivran
Comprendre et Exploiter le Glyco-Interactome par le biais d'Outils Chimiques – GlycoInteractome
Il est de plus en plus clair que le fonctionnement des cellules, tant dans contexte physiologique que pathologique, ne se fait pas de manière isolée, mais par le biais d'une communication fine entre les cellules. Au niveau moléculaire, les glycanes complexes (chaînes de monosaccharides), présents à
Dissection moléculaire des partenaires de l'actine chez les Apicomplexes – NETWORK
La malaria est une pathologie responsable d’un demi-million de morts par an. Elle est causée par les parasites Apicomplexes du genre Plasmodium. Chez ces parasites, la motilité et l’invasion des cellules-hôtes reposent sur une actine divergente et très dynamique (Act1) mais aussi sur des myosines no
Imager sélectivement des biomarqueurs avec des sondes fluorescentes excitables a 1 ou 2-photon – I-SEE-U
La combinaison des techniques d’imagerie optique associée à la chirurgie est une voie prometteuse car elle permet de guider le geste du chirurgien. La chirurgie guidée par fluorescence (FGS) offre ainsi une vision plus précise de la cible. Cette approche passe par l’élaboration d’outils spécifiques.
Conception et construction d'un pool d'acétyl-CoA alternatif isolé – 2pOOl
La consommation de sources alternatives de carbone dans les processus biotechnologiques est essentielle pour le développement d'une biotechnologie durable. Une source de carbone intéressante est l'acétate, qui peut être converti en une seule étape en acétyl-CoA, composé central du métabolisme cellul
Expression d'un génome entier dans un système hétérologue acellulaire – ExEGeSyS
La Biologie de Synthèse est un domaine scientifique émergent combinant des connaissances avancées en biologie avec des concepts empruntés à la chimie, l’ingénierie et l’informatique. Son objectif global est de concevoir et de construire des systèmes synthétiques semblables au vivant ou vivants. L’un
