Exploration de la reconnaissance et de l’adressage cellulaire du domaine ubiquitaire de liaison au peptidoglycan, LysM – PEPLYS

Les protéines de surface bactériennes jouent un rôle crucial dans des processus fondamentaux tels que la croissance cellulaire, la division et les interactions avec l'environnement. Chez les pathogènes, ces protéines sont essentielles pour l'invasion des tissus et l'évasion du système immunitaire de l'hôte. Au cœur de ces fonctions se trouve leur capacité à se lier à la paroi cellulaire bactérienne. Ce projet se concentre sur un domaine protéique appelé LysM (pour Motif Lysin), présent dans toutes les espèces bactériennes. LysM permet l'attachement non covalent des protéines au peptidoglycane (PG), le composant essentiel de l'enveloppe cellulaire bactérienne, qui est la cible de l'antibiotique le plus important jamais découvert : la pénicilline. Ainsi, les enzymes liées aux LysM sont utilisées par les bactéries pour remodeler la paroi cellulaire, construire et détruire les septa, et dans la pathogenèse.
Les domaines LysM possèdent 1 à 12 motifs, chacun d'environ 45 acides aminés, avec un repliement conservé ßaaß. Cependant, les séquences d'acides aminés varient, et l'impact de ces variations sur l'affinité ou la spécificité de la liaison est inconnu. Dans ce projet, nous nous concentrerons sur deux enzymes clés d'Enterococcus faecalis, AtlA et AtlB, qui contiennent des domaines LysM et contribuent au remodelage du PG pendant la croissance.
Le principal défi réside dans la compréhension de la diversité des domaines LysM. Cette recherche vise à explorer comment la composition de la paroi cellulaire et les propriétés des domaines LysM influencent leur localisation. E. faecalis est un pathogène multi-résistant aux médicaments, nos résultats pourraient fournir des informations fondamentales sur les interactions avec la paroi cellulaire bactérienne et conduire à des stratégies innovantes pour lutter contre les infections résistantes aux antibiotiques.