Outils avancés de lipidomique pour une analyse robuste et une caractérisation fine des feuillets membranaires des organites – ACYLOMICS

La lipidomique permet un profilage exhaustif des lipides dans les échantillons biologiques, notamment lors de la mise en œuvre d’une approche non ciblée associant chromatographie liquide et la spectrométrie de masse à haute résolution (LC-HRMS). Actuellement, la lipidomique non ciblée repose fréquemment sur un mode d’acquisition dépendant des données (Data-Dependent Acquisition, DDA), limitant l’analyse aux lipides les plus abondants. En outre, la sur-annotation, où un pic chromatographique est attribué à tort à un seul lipide alors qu’il correspond à plusieurs entités, reste un écueil récurrent dans la littérature. De plus, cette approche classique ne permet pas de distinguer les variations de composition lipidique au niveau des feuillets membranaires des organites. Nous proposons une approche innovante en lipidomique visant à surmonter les limites inhérentes à la DDA, en particulier l’omission des lipides mineurs et la sur-annotation. Par ailleurs, nous développerons une technique permettant de détecter les variations des chaînes acyles de la phosphatidylcholine et de la phosphatidylsérine entre les feuillets membranaires de différents organites. Ces nouveaux outils seront ensuite appliqués pour examiner la régulation métabolique des chaînes acyles lipidiques et leur impact sur la distribution des lipides au sein des cellules. Nos technologies permettront une caractérisation robuste des lipides, offrant des informations inédites sur leur localisation cellulaire et possédant un potentiel pour transformer la recherche des lipides en biologie cellulaire.