Projets financés

Les ATPases à boîte DEAD (DDX) constituent une grande famille de protéines dont les fonctions dans le métabolisme des ARN peuvent à première vue sembler parfois similaires. Cependant, l'évolution a probablement maintenu cette diversité de protéines apparentées pour accomplir des tâches spécifiques d

Les R-loops sont des structures où l'ARN naissant se lie au brin matrice pendant la transcription. Ces structures peuvent causer une instabilité génomique, mais jouent aussi des rôles physiologiques importants. Toutefois, plusieurs aspects de la biologie des R-loops, tels que leur formation, fonctio

Le but de ce projet est de comprendre comment est régulé l'équilibre entre les voies mutagène et fidèle de tolérance des lésions, en utilisant Escherichia coli comme modèle. • Contexte Le génome de tout organisme est constamment menacé par de nombreux agents qui endommagent l'ADN. Lorsqu'une lés

La maladie de Huntington (MH), la plus fréquente des maladies neurodégénératives génétiques causées par une expansion instable de répétitions CAG, entraîne une dégénérescence sélective de neurones, en particulier des neurones de projection épineux (SPN) dans le striatum. Ainsi, le striatum est princ

Les bactériophages, entités biologiques les plus abondantes, sont une source sous-exploitée de nucléotides modifiés. Parmi ces modifications, la 2-aminoadénine (Z), découverte en 1977 dans le cyanophage S-2L et récemment identifiée dans de nombreux phages infectant des bactéries à Gram positif et né

Les éléments transposables (ET), par leur capacité à se répliquer et de se déplacer dans les génomes, peuvent jouer un rôle clé dans leur évolution. Bien qu'ils constituent la majeure partie du génome de nombreux organismes eucaryotes , la plupart sont des fossiles inactifs, ne laissant qu'une petit

L'acquisition et la domestication d'ADN étranger sont des aspects fondamentaux de l'évolution bactérienne. Cependant, les mécanismes régulateurs et évolutifs favorisant l'expansion du génome par l'intégration de grands réplicons secondaires restent partiellement compris. Pour combler cette lacune, l

La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est la troisième maladie neurodégénérative la plus répandue dans le monde occidental, touchant 1 personne sur 50 000. Cette maladie se caractérise par une dégénérescence des motoneurones entraînant une faiblesse musculaire, aboutissant à la paralysie et à la

L'épissage alternatif est essentiel pour définir l’identité moléculaire des cellules au cours du développement. Il est notamment crucial pour le développement du système nerveux central, particulièrement pour le renouvellement du stock des progéniteurs neuronaux, la différenciation ou la spécificati

La condensation mitotique des chromosomes (CMC) est la réorganisation globale des fibres de chromatine en chromosomes métaphasiques, en préparation à leur ségrégation précise en anaphase. Condensine est le moteur moléculaire de la CMC. Les données actuelles indiquent que condensine se lie massivemen

Les cassures de l'ADN représentent environ 75% des lésions et comportent souvent des « extrémités sales » (dépourvues de 5' phosphate ou 3' hydroxyle). Le traitement de ces extrémités est nécessaire pour restaurer l’intégrité de l’ADN, mais augmente les risques d’erreurs et d’instabilité génomique.

Les facteurs de transcription sont des régulateurs essentiels de l’identité cellulaire, établissant des programmes d’expression génique dans chaque type de cellule. Ces protéines sont nécessaires au développement embryonnaire et sont souvent dérégulées dans les maladies humaines. Bien que les facteu

Le projet RiboStallRescue vise à explorer les mécanismes par lesquels les protéines ABC-F d'E. coli préservent les ribosomes de l'Arrêt Ribosomal Dépendant du Contexte (CDRS), un phénomène où la séquence d'acides aminés naissante influence l'efficacité de la traduction. La traduction, processus fond

La duplication du matériel génétique est régie par la réplication de l'ADN via le replisome. Cependant, ce dernier rencontre souvent des obstacles conduisant à un stress réplicatif, qui se traduit par un blocage de la fourche de réplication (RFS). Bien que certaines régions répétitives soient connue

Les génomes sont organisés de manière ordonnée selon plusieurs échelles de repliement de l’ADN dans tous les organismes. L’organisation de la chromatine dans le noyau a une importance fonctionnelle pour contrôler notamment le programme d’expression des gènes, la réplication de l’ADN, sa réparation e

Les condensats biomoléculaires qui compartimentent protéines et acides nucléiques sont reconnus comme des acteurs essentiels de l'organisation de la biochimie cellulaire. Leur assemblage dépend du principe de séparation de phase qui s'opère lorsqu'un seuil de concentration est atteint. Malgré les pr

Lors de la première division en méiose, les chromosomes homologues doivent s’apparier et rester connectés jusqu’à leur ségrégation. La recombinaison homologue (RH) est cruciale dans ce processus, commençant par la formation programmée de cassures double brin (CDB) dans l’ADN. Ces cassures sont répar

La résistance aux antibiotiques est un problème majeur de santé publique. Toutefois, le lien entre l’état physiologique des bactéries et l’efficacité des antibiotiques reste mal caractérisé. Notre projet propose d’y remédier en étudiant, à l’échelle de la cellule unique, l’effet de changements du ta

Comprendre comment les variations génétiques se traduisent en traits phénotypiques est une question importante en biologie. Notre connaissance des mécanismes sous-jacents provient essentiellement de travaux réalisés sur un nombre restreint d'organismes modèles, propagés sous forme de souches isogéni

La sclérose en plaques (SEP) est une maladie neurologique fréquente du jeune adulte, dont les mécanismes moléculaires restent encore mal compris. Des SNPs dans des gènes régulant la pause et l’élongation de l’ARN polymérase II (RNAPII) ont été associés à un risque accru de SEP, mais ce lien n’a pas

La machinerie de méthylation de l'ADN et les protéines du groupe Polycomb sont deux voies de modification de la chromatine hautement conservées, associées à la répression transcriptionnelle épigénétique. Malgré leurs similarités, leurs activités sont généralement exclusives au sein des génomes des m

Lors de la méiose, plusieurs centaines de cassures double-brin programmées de l'ADN sont formées et réparées par recombinaison homologue (RH), générant des crossing-over entre chromosomes homologues, qui sont essentiels pour leur ségrégation lors de la première division méiotique, et donc pour la fe

La réplication de l'ADN est constamment mise à l'épreuve par des dommages de l’ADN qui peuvent bloquer sa progression, entrainant un « stress réplicatif ». Ce stress réplicatif menace la stabilité du génome ainsi que la viabilité cellulaire et a été associé à diverses pathologies humaines. Les mécan

Chez les plantes à fleurs, les croisements entre différentes espèces et entre parents de ploïdies divergentes donnent le plus souvent naissance à des graines hybrides défaillantes en raison d'un déséquilibre dans l'expression des gènes à empreinte parentale. Ce phénomène, connu sous le nom de "bloca

Les ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes (hnRNP) forment une famille de protéines liant l'ARN, impliquées dans plusieurs aspects du métabolisme de l'ARN, notamment la biogenèse, la maturation, la localisation, le stockage, la traduction et la dégradation, contribuant ainsi à une régulation str

Les changements dans la structure chromosomique appelés réarrangements chromosomiques complexes (GCRs pour Gross Chromosomal Rearrangements, ex : translocations ou amplifications) sont des moteurs fondamentaux des processus évolutifs mais aussi une caractéristique majeure des cellules cancéreuses et

L'hibernation des ribosomes est un processus adaptatif essentiel chez les bactéries et les eucaryotes. Cependant, ce processus impliquant l'inactivation temporaire des ribosomes, reste non documentée chez Archaea. La séquestration des ribosomes dans un état inactif en réponse à des facteurs de stres

Certaines espèces eucaryotes subissent systématiquement une élimination programmée de l'ADN (PDE), consistant en la destruction partielle des chromosomes dans leur soma au cours du développement. Bien que décrit dès 1887, le PDE est resté mystérieux en raison des limites des systèmes modèles et des

L'information épigénétique stockée sous forme de chromatine dans le noyau cellulaire gouverne l'identité cellulaire en contrôlant à la fois l'expression des gènes et la réparation des lésions de l'ADN. L'hétérochromatine facultative est une forme de chromatine transcriptionnellement silencieuse qui

Des déficiences intellectuelles associées à un retard de neurodéveloppement (NDD) affectent environ 1% de la population. Nous avons découvert que certains variants faux-sens hétérozygotes du gène DDX6 causent une nouvelle forme syndromique de NDD. DDX6 est une hélicase à ARN impliquée dans la dégrad

Durant l'embryogenèse chez les mammifères, les niveaux globaux de méthylation de l’ADN en position 5-Cytosine (5mC) augmentent considérablement. Ce phénomène, qui est crucial pour la progression du développement, peut être récapitulé en culture cellulaire en différenciant des cellules souches embryo

La conjugaison et la transformation naturelle sont des mécanismes de transfert horizontal de gènes (THG) jouant un rôle crucial dans l'évolution des bactéries. Cependant, les barrières limitant ces processus sont moins explorées que celles du THG médié par les phages (transduction). Nous déterminero

Les systèmes à deux composants (SDC) et les petits ARN sont deux classes de régulateurs de l’expression génétique extrêmement répandues chez les bactéries et qui agissent en général au niveau transcriptionnel ou post-transcriptionnel, respectivement. Nos travaux précédents, ainsi que ceux d’autres l

La cohésine, un complexe protéique en forme d'anneau, est essentielle à la stabilité du génome en régulant les boucles d'ADN, l'expression des gènes, la cohésion des chromatides sœurs et la réparation de l'ADN. Elle forme des boucles intrachromosomiques pendant l'interphase, contribuant à l'organisa

Les télomères sont des séquences répétées localisées aux extrémités des chromosomes sur lesquelles se fixent des protéines spécifiques. Ces structures protègent ces extrémités et assurent la stabilité du génome. Au fur et à mesure des divisions cellulaire, ces séquences raccourcissent et sont un mar

N6-méthyladénosine (m6A) est le nucléotide modifié le plus abondant des ARNm, jouant un rôle crucial dans la régulation de leur destin. Des défauts dans la méthylation m6A des ARNm sont associés à diverses pathologies. La m6A est déposée sur les transcrits naissants par METTL3, la sous-unité enzymat

L'inactivation du chromosome X (XCI) égalise le dosage des gènes liés à l'X entre les sexes, mais jusqu'à 20 % des gènes liés à l'X échappent au silence génétique et sont exprimés à des niveaux plus élevés chez les femelles (XX) que chez les mâles (XY). Les mécanismes d'échappement au XCI restent ma

Les génomes subissent des modifications de leur architecture 3D, impactant les processus liés à l'ADN, tels que l'expression génique, la réplication et la réparation de l'ADN et la ségrégation des chromosomes. Cette organisation implique des structures telles que les boucles d'ADN, la cohésion des c

Dans une population vieillissante exposée aux stress environnementaux, la fertilité des gamètes décline. Malgré le succès de la fécondation in vitro, ce qui définit la fitness des gamètes, ou leur déclin, reste peu compris. Les études se sont focalisées sur l'intégrité de l'ADN, et son épigénétique.

Les mécanismes liés à l’ARN sont au cœur de la régulation de l’expression des gènes, et leur diversité et interaction contribuent à la complexité des réseaux de régulation génique. À partir d’un criblage génétique CRISPR à l’échelle génomique nous avons récemment identifié un lien inattendu entre la

RECAF aborde de manière originale une question clé de la biologie évolutive : comment le sexe façonne-t-il la diversité génétique ? La reproduction sexuée par le biais de la méiose crée de la variation génétique, mais de nombreuses espèces ont tendance à se reproduire de manière asexuée. En fait, la

Les complexes Polycomb jouent un rôle crucial dans le développement en contrôlant les programmes de transcription spécifiques qui déterminent l'identité cellulaire chez les animaux et les plantes. La répression transcriptionnelle associée au complexe répressif Polycomb 2 (PRC2) est assurée par le co