Projets financés

Les protéines membranaires représentent la majorité des cibles thérapeutiques actuelles. Afin de les manipuler in vitro des détergents sont généralement utilisés pour les extraire de la membrane et les maintenir solubles. Cependant, de nombreuses protéines se dénaturent une fois extraites et perdent

Les fonctions de toutes les cellules du corps humain sont régulées par des hormones et des neurotransmetteurs (messagers extracellulaires) et transmises à l'intérieur de la cellule par des messagers intracellulaires. Les messagers intracellulaires comprennent les nucléotides AMP cyclique (AMPc) et G

Une famille d’enzymes homologues est définie par une série de résidus de «cœur» très conservés qui sont nécessaires pour la fonction. Les détails de la catalyse (les vitesses, constantes de Michaelis, réactivité aux inhibiteurs et même la directionnalité) sont fréquemment déterminés par des résidus

Les cellules de la microglie sont les cellules immunitaires résidentes du cerveau qui maintiennent l'homéostasie cérébrale en répondant aux cytokines et en éliminant les substances par phagocytose. L'activation microgliale et la clairance phagocytaire des agrégats ß amyloïdes (Aß) et de tau limitent

Les infections par le virus respiratoire syncytial humain (VRSh) touchent principalement les nourrissons, les personnes âgées et les patients immunodéprimés. Elles sont une cause majeure de morbidité et de mortalité dans le monde entier et représentent un fardeau social et économique important. Cepe

La négamycine est un métabolite spécialisé de la famille des hydrazinopeptide, produite par l'actinobactérie Kitasatospora purpeofusca. Deux autres métabolites de la même famille, la 3-épi-déoxy-négamycine (3-Dneg) et la leucyl-3-épi-déoxy-négamycine (L-3-Dneg) sont produits par l'actinobactérie Str

La description détaillée des processus chimiques intervenant dans les enzymes est un défi qui nécessite, dans la plupart des cas, l’utilisation de techniques expérimentales complémentaires. Cette compréhension s’avère souvent cruciale pour le développement d’applications biotechnologiques. L’objecti

Des études récentes menées dans l'équipe du Pr Gilles Favre au CRCT ont mis en évidence un rôle potentiel de la petite GTPase RHOB dans la résistance aux thérapies du récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR). La surexpression de RHOB réduit la sensibilité des cellules à l'erlotinib de m

Le développement de nouveaux anticorps thérapeutiques fait aujourd’hui l’objet d’une recherche intense. La découverte et l'ingénierie de ces biomédicaments nécessitent la caractérisation (séquence en acides aminés et modifications post traductionnelles, PTMs) d’anticorps endogènes, qui reste une tâc

SensiGut : Biocapteurs bactériens programmables pour la surveillance des métabolites intestinaux. De plus en plus d'éléments décrivent l'influence du microbiote intestinal sur la physiologie humaine. L'image qui se dessine suggère que l'interaction entre le génome humain et le microbiome régule e

La tuberculose (TB) causée par la mycobactérie Mycobacterium tuberculosis (Mtb) touche 10 millions de personnes par an et l'émergence de souches résistantes laisse présager une incidence croissante. Au cours des 60 dernières années, trois nouveaux médicaments ont été approuvés pour le traitement de

Le méthanol est un substrat attractif à faible coût pour la biotechnologie. Bien que des usines cellulaires productrices de composés à haute valeur ajoutée à partir de méthanol existent, leur efficacité est limitée par la faible compréhension de la méthylotrophie. Chez les levures méthylotrophes com

Les adipocytes bruns et beiges peuvent produire de la chaleur à partir d'énergie chimique, indépendamment des processus de thermogenèse canonique. Ces adipocytes présentent une capacité de thermogenèse adaptative basée sur la créatine, activé non seulement après une réponse au froid à court et long

Les acides nucléiques (AN) constituent une classe essentielle de macromolécules nécessaires au stockage, à la transmission et à l'expression de l'information génétique des cellules. Alors que l'acide désoxyribonucléique (ADN) code les informations dont les cellules ont besoin pour fabriquer des prot

Contexte. Les fragments d'oligosaccharides dérivés de pathogènes et de glycoconjugués de l'hôte peuvent être immunogènes. Chez les mammifères, les oligosaccharides libres (fOS) sont normalement produits dans le réticulum endoplasmique (RE) pendant la biosynthèse des N-glycoprotéines. Dans certains c

Le but de ce projet est d'étendre largement l'univers chimique des biopolymères utilisés dans les aptamères, tout en gardant la même méthode d'amplification par PCR des meilleures molécules issues de la sélection. Le choix de la modification des bases sera largement inspiré de ce qui est observé che

Les Récepteurs Couplés aux Protéines G (RCPG) sont les acteurs centraux du ballet des signaux moléculaires échangés par les cellules. Elles agissent de concert en s’activant et s’influençant mutuellement en fonction du contexte ou de la pathologie dans une trame complexe dont les figures et les sign

Les modifications post-traductionnelles élargissent le répertoire chimique des polypeptides et donnent accès à de nouvelles fonctionnalités moléculaires. Certaines d’entre elles sont remarquablement conservées. Par exemple, la protéine ribosomique universelle uS11, impliquée chez les humains dans de

Les glycosaminoglycanes (GAG) sont des biopolymères majeurs assurant des fonctions structurales et régulatrices multiples dans la cellule et les tissus des organismes pluricellulaires. Leur synthèse nécessite l'action coordonnée de glycosyltransférases (GT) et de partenaires, dont les variants patho

La résistance à l'insuline (RI) joue un rôle majeur dans la physiopathologie du diabète de type 2 (DT2) dû à un phénomène appelé lipotoxicité. En cas d’obésité, les acides gras (AG) en excès s'accumulent dans les tissus périphériques et sont métabolisés en dérivés sphingolipidiques comme les céramid

Une réponse inflammatoire incontôlée peut survenir suite à une infection et peut également être associée à un grand nombre de pathologies ; cependant il n’existe que très peu de médicaments pour contrôler une inflammation excessive. Notre laboratoire a identifié l’existence d’une endocytose du cuivr

La membrane plasmique (MP) et la paroi cellulaire végétale forment ensemble un continuum qui se comporte comme une barrière dynamique contre les menaces environnementales. Les propriétés de la MP et de la paroi ont été étudiées indépendamment pendant plusieurs décennies, mais de plus en plus de donn

Les cyclophilines sont une famille de protéines qui catalyse l’isomérisation cis/trans des liaisons peptidiques au niveau des résidus de proline, ce qui facilite le repliement des protéines. CypA, l’isoforme la plus abondante, a été décrite comme un acteur clé de l’infection virale par des virus tel

La manière dont les cellules s’adaptent à leur charge de sécrétion fixe une frontière tenue entre physiologie et pathologie. Le réticulum endoplasmique (RE) induit pour cette adaptation une signalisation spécifique : la réponse aux protéines mal repliées (UPR). L'UPR, adaptative, préserve les foncti

L'objectif du projet Sweet-ThioPep est de développer de nouveaux outils biochimiques comme sondes multivalentes non hydrolysables de lectines ou de glycosides hydrolases. Ces outils seront construits par voie enzymatique, à partir de glycosyltransférases (GT) modifiées par ingénierie génétique (en g

Les bactéries multi-résistantes aux antibiotiques représentent un problème majeur de santé publique et il devient essentiel d’élaborer de nouvelles stratégies pour les combattre. Un prérequis est de mieux comprendre comment les pathogènes s’adaptent et résistent aux stress perçus lors de l’infection

Les protéines de liaison à la pénicilline (PLPs) sont les cibles des bêta-lactamines, les antibiotiques les plus utilisés tels que les pénicillines, les céphalosporines ou les carbapénèmes. Les PLPs sont des transpeptidases qui catalysent la réticulation du peptidoglycane (PG), le principal composa

Les terres rares (TR) forment un groupe d’éléments métalliques aux propriétés uniques, utilisés dans une multitude d’applications et de produits de haute technologie et indispensables à la transition énergétique en cours. La découverte récente d’enzymes utilisant spécifiquement les TR comme cofacteu

Dans les hydroxylations biologiques aérobies, les mono-oxygénases activent l'oxygène moléculaire en un intermédiaire peroxy, en utilisant des cofacteurs liés tels que l'hème, la flavine ou les ions métalliques (Fe, Cu). Dans les hydroxylations biologiques anaérobies, les mono-oxygénases à molybdopté

La proximité entre protéines joue un rôle essentiel dans de nombreux processus biologiques. Les outils moléculaires permettant de contrôler et d'observer la proximité des protéines sont ainsi essentiels pour étudier le rôle fonctionnel de la distance physique entre protéines. Dans ce contexte, les t

Lors de l’annotation de génome, un des critères majeurs utilisés pour définir un gène codant pour une protéines est que l’ORF (Cadre de lecture ouvert) doit faire au moins 100 codons. Cependant, des études récentes ont démontré que des protéines peuvent être produites à partir de petits ORFs (moins

L'efficacité générale des voies métaboliques souffre de la faible durée de vie, la toxicité et la diffusion des intermédiaires, ainsi que de l’existence de voies concurrentes. La nature a contourné ses limites par une évolution de micro-environnements, isolés sous forme d'organites. Dans le contexte

Le phosphatidylinositol (PI) est un lipide unique car il est le précurseur des phosphoinositides, comme le PI4P et PI(4,5)P2, qui ont des rôles clés dans la cellule eucaryote. Néanmoins, la façon dont le PI est exporté du réticulum endoplasmique (RE) où il est fabriqué, vers l'appareil de Golgi et l

Les protéines jouent de multiples rôles dans le métabolisme de l’ARN, régulant presque tous les aspects des fonctions de l’ARN et forment des complexes stables non covalents, principalement médiés par des charges électrostatiques et des liaisons hydrogène. Dans ces complexes, des groupes chimiques d

Le projet MiniToxoAd vise à étudier les modalités moléculaires qui régissent les interactions établies par le protozoaire parasite Toxoplasma gondii avec une variété de matrices extracellulaires de son hôte au sein desquelles il migre pour atteindre les cellules cibles et y produire une descendance,

La paroi cellulaire fongique (FCW) est probablement l'une des structures les plus essentielles et les plus largement partagées dans le règne fongique. Qu'ils soient impliqués dans la décomposition de la biomasse végétale, la pathogenèse ou les associations symbiotiques, les champignons filamenteux s

Les capacités de biotransformation des cellules sont directement liées au métabolisme cellulaire. Le processus enzymatique de dégradation des ARN participe à la régulation du métabolisme en contrôlant l'expression des gènes de manière post-transcriptionnelle. Des milliers de molécules d'ARN sont sus

Les ARN interférents (siRNA) sont des molécules spécifiques et efficaces pour l’extinction génique, mais ils ne pénètrent pas spontanément dans les cellules car ils sont chargés négativement et leur poids moléculaire est élevé. La conjugaison des siRNA à des ligands ciblant des récepteurs de surface

La médecine personnalisée repose sur la biologie médicale dont le but est de définir le profil métabolique de patients afin d'adapter leur traitement et de minimiser les effets secondaires. Ces profils métaboliques sont constitués d'un ensemble de biomarqueurs, qui permettent de diagnostiquer précoc

Les chaînes bioénergétiques qui alimentent le métabolisme cellulaire ont connu des changements spectaculaires depuis l'apparition de la vie sur Terre, avec une diversification des sources d'énergie environnementales et l'évolution de nombreuses enzymes dédiées. Le mécanisme de conservation de l'éner

Les maladies neurodégénératives représentent un enjeu de santé publique majeur, auquel il est nécessaire de répondre. Parmi elles, la maladie de Parkinson (MP) est considérée comme la pathologie motrice la plus répandue mais pour laquelle aucun traitement curatif n’est disponible. Récemment, le gène

Les particules ribonucléoprotéiques (RNP) sont formées d’ARN associés à des protéines et jouent un rôle central dans systèmes biologiques (maintien de l’homéostasie cellulaire, établissement de processus infectieux ou pathologiques). L’identification des constituants de ces RNP a connu une véritable

Une question des plus intrigantes dans l’apparition de l’atmosphère oxygénée est comment la photosynthèse oxygénique a évolué, probablement à partir d'une photosynthèse anoxygénique à base de soufre. Les cyanobactéries primitives “ont inventé” la photosynthèse oxygénique et dans l’océan primitif enc

Parmi les quatre composants macromoléculaires fondamentaux nécessaires à la vie, les sucres complexes (glycannes) sont vraisemblablement ceux qui présentent la plus grande diversité structurale. Les glycannes recouvrent chaque cellule du corps humain, décorent presque toutes les protéines sécrétées

La photosynthèse est limitée par le cycle de Calvin-Benson (CBC), réalisant la fixation de carbone. Le CBC est décrit comme impossible à améliorer car l’Evolution aurait déjà sélectionné la meilleure fitness possible, dans l’environnement actuel. Cependant, l’hypothèse d’une fitness maximale différe

L’utilisation technologique des métaux s’est étendue et intensifiée dans des domaines aussi divers que les énergies renouvelables, l’informatique et la médecine. Parmi ces métaux, certains, dont les lanthanides, sont considérés critiques car plus rares ou d’approvisionnement contrôlé par une poignée

Pour évoluer dans leur environnement volatil, les mammifères font constamment appel à leur odorat. L'odeur peut être vue comme un signal chimique converti par le cerveau en un signal électrique lui-même traduit en perceptions et en émotions. Cette vue simpliste n'est pas représentative du puzzle mol