Projets financés
Caractérisation de la chorégraphie orchestrée par l'hétérodimère Ku sur les cassures double-brin de l'ADN – BreakDance
Les cassures double-brin (CDBs) sont parmi les lésions les plus toxiques de l’ADN. Paradoxalement, elles sont générées de façon intentionnelle lors des traitements par radiothérapie ou lors de l’édition de génomes par l’approche CRISPR-Cas9. La voie de réparation par jonction directe (c-NHEJ pour "c
E´tude de structures prote´iques dans leur environnement cellulaire natif par re´sonance paramagne´tique e´lectronique – InVivoNanoSpin
L'objectif est de cre´er de nouveaux outils permettant des mesures intracellulaires a` l'e´chelle du nanome`tre de la structure des prote´ines par double re´sonance e´lectronique pulse´e (PELDOR). Des acides amine´s classiques ou non-naturels (UAAs) seront utilise´s pour introduire dans des prote´in
Exploration de la propagation des transpovirons chez les Mimiviridae – TransVIR
Les Mimiviridae, avec une taille de particule et une complexité génomique comparable à certains organismes cellulaires, sont l’une des découvertes les plus inattendues des 15 dernières années en biologie. Cette famille de virus d’amibes est divisée en 3 clades et tous partagent un cycle infectieux e
Etude de motifs riches en proline au sein des protéines par RMN du fluor – FLUOPROLINE
Les protéines intrinsèquement désordonnées (IDPs) représentent un tiers du protéome chez les eucaryotes et jouent un rôle important dans les processus de régulation et de signalisation cellulaire. Les séquences de ces protéines montrent une fréquence élevée de prolines, sous la forme de segments pol
Bases structurales et fonctionnelles de la methylation epitranscriptomique de genomes de virus à (+)ARN – VIRAGE
Les virus émergents à ARN (ex., Dengue, Zika, SARS, MERS, Ebola virus) menacent les économies et systèmes de santé mondiaux. Leur faculté d'émergence est liée à leur capacité d'adaptation évolutive et leur propension à échapper à l'immunité innée des cellules hôtes. Leur réplicase/transcriptase cont
Mécanismes moléculaires de l'immunité du phage T5 – ImmunoPhage
Les bactériophages, virus infectant les bactéries, sont les entités vivantes les plus abondantes sur Terre. Ils ont un impact profond sur les cycles biogéochimiques globaux et sur le climat, de par leurs effets sur l’écologie microbienne marine notamment. Ils sont présents dans tous les biotopes, pa
Structure des états excités au cours du processus photosynhtétique – Excit
La photosynthèse convertit l’énergie des photons solaires en énergie de potentiel chimique, utilisée ultérieurement pour fixer le CO2 sous forme de sucres. Ce processus convertit 80 TW d’énergie solaire sous forme de biomasse et d’oxygène. Il commence par l’absorption d’un photon par une antenne, qu
Dynamique et régulation de l'appareil traductionel mitochondrial chez Arabidopsis – DAMIA
Ce projet multidisciplinaire consiste en l’analyse mécanistique de processus spécifiques de la traduction mitochondriale chez les plantes. Nous nous intéresserons en particulier aux mécanismes liés à l’étape d’initiation traductionnelle, à l’organisation et à la structuration du mitoribosome de plan
Organisation structurale et fonctionnelle de la chromatine à l’échelle du nucléosome. Analyse par cryo tomographie électronique de sections vitreuses et modélisation in silico – CRYOCHROM
Le chromosome eucaryote est un milieu complexe, à la fois dense et hétérogène, composé d'une longue chaîne d'ADN (quelques mm à quelques dizaines de cm selon les espèces), repliée dans le volume du noyau à l'échelle du micron, à travers plusieurs niveaux d'organisation, et tout en interagissant avec
Etude des bases structurales du mécanisme d'activation des RCPG en utilisant des ligands photocontrôlables et la diffraction des rayons X. – SWITCH-ON
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) représentent la plus grande famille de récepteurs membranaires. Ils jouent un rôle important dans la communication cellulaire et sont des cibles thérapeutiques majeures : plus de 40% des médicaments utilisés sont en effet des modulateurs de l’activé des
Export-Import de la pseudopaline chez Pseudomonas aeruginosa – PseudoTraffic
Les metallophores sont des molécules à haute affinité pour les métaux, synthétisées, sécrétées puis récupérées par les bactéries pour assurer une constante disponibilité en métaux, en particuliers dans les milieux les plus hostiles tels que ceux rencontrés lors de l’infection d'un hôte. Dans ce cont
Une approche multidisciplinaire pour comprendre la structure et la dynamique du système de sécrétion de type VI – FullContact
Le système de sécrétion de Type VI est une nanomachine contractile développée par des bactéries pour tuer leurs congénères. Il est composé de quatorze sous-unités qui s'assemblent en trois sous-complexes: le complexe membranaire (CM), la plateforme et le complexe tube/fourreau (CTF). Les structures
Études structurale et fonctionnelle des voies uniques de modification de l’ARN chez le parasite pathogène pour l’homme Trypanosoma brucei – TbbRNA
La trypanosomiase chez l’homme et les animaux d’élevage représente une grave menace socio-économique dans l’hémisphère sud, l’infection étant difficile à traiter avec les médicaments actuellement disponibles. De façon intéressante, les voies de modification de l’ARN diffèrent entre l’homme et le par
Vers une meilleure caractérisation du paysage conformationnel des récepteurs nucléaires pour élucider les mécanismes de la signalisation spécifique des ligands. – NURESCAPE
Les récepteurs nucléaires (RN) traduisent l’information portée par la structure chimique de leurs ligands via un ensemble d’interactions récepteur/ADN et récepteur/protéines, modulant ainsi l’expression de leurs gènes cibles. Les mécanismes généraux responsables de l'activation ou de l'inhibition de
Interaction spatiale et fonctionnelle entre septines et Escrt pendant la cytocinèse: une approche multi-échelle – SeptScort
Les septines sont des protéines filamentaires du cytosquelette qui interagissent avec la membrane plasmique et jouent un rôle fondamental en limitant la diffusion des protéines membranaires. Les septines sont essentielles à de nombreux processus cellulaires impliquant un remodelage des membranes (no
Nouvelle génération de protéines fluorescentes ultrastables pour la microscopie quantitative super-résolution – STABLE-FP
La microscopie super-résolution ("nanoscopie") a connu un développement extraordinaire ces dernières années, éclairant les sciences du vivant à l'échelle nanométrique. Notamment, la microscopie de localisation par molécules uniques (SMLM), la technique de nanoscopie la plus répandue, a élargi sa gam
Développement d'une nouvelle technologie: la viro-fluidique pour étudier en temps réel la production virale à l'échelle de la cellule infectée et de la particule virale uniques. – virofluidics
L’objectif de ce projet interdisciplinaire est de combiner la virologie aux puissantes stratégies nano/microfluidiques (nous appelons "viro-fluidique") afin d’étudier, pour la première fois, le relargage des virus en temps-réel à l’échelle de la cellule et de la nanoparticule virale uniques. La viro
Elucider le mécanisme d'action du système de sécrétion de type IX (T9SS) – T9-Mechanism
L'objectif de ce projet est d'élucider le mécanisme d'action du système de sécrétion de type IX (T9SS) découvert récemment. Le T9SS est responsable de la pathogénicité de Porphyromonas gingivalis en assurant la sécrétion de facteurs de virulence, et de la motilité de Flavobacterium johnsoniae en ass
Mécanismes de fission membranaire par l'actine – ActinFission
La fission membranaire où une vésicule ou un tubule sont détachés d'une membrane, est cruciale pour générer des intermédiaires de transport dans les cellules. Son dysfonctionnement conduit à de nombreuses maladies. Dans les cellules, des protéines génèrent les forces mécaniques pour vaincre la résis
Imagerie de la structure et de la chimie nanométrique des vésicules osseuses par microscopie électronique et spectroscopie – VINCI
Les vésicules extracellulaires (EVs) jouent un rôle clé dans la communication de cellule à cellule et de plus en plus de preuves expérimentales ont montré que les EVs sécrétées par les différents types de cellules osseuses jouent un rôle majeur dans le processus de remodelage osseux. L'accès aux EVs
L'homeostasie rheologique de la paroi cellulaire végétale au cours de la croissance – HOMEOWALL
Afin de comprendre comment une plante grandit, il est indispensable d’étudier l’architecture et l’homéostasie mécanique du réseau de polymères constituant la paroi cellulaire. Les objectives de HOMEOWALL sont de combiner la biologie cellulaire, la biologie structurale, la physique de la matière moll
Exploration des mécanismes moléculaires de la fonction des protéines désordonnées d'initiation de la traduction : de l'in vitro à la cellule – DISTINCT
Les protéines intrinsèquement désordonnées (IDPs) ne possèdent pas de structure définie sous leur forme native et n'en requièrent pas nécessairement une pour permettre des interactions moléculaires et effectuer leur fonction cellulaire spécifique. Ces IDPs sont souvent présentes dans les cellules eu
Un atlas de la morphologie et de l’organisation nanométrique des synapses par microscopie de super-résolution computationnelle – NANO-SYNATLAS
Les synapses sont des structures micrométriques permettant la communication neuronale et composées d’une multitude de protéines. Leurs changements de structure et de composition moléculaire sous-tendent les fonctions essentielles du cerveau. De par sa position au sein de la synapse, la protéine d'ad
Caractérisation moléculaire de l'enzyme qui produit la dendrogenine A et d'autres stérols conjugués bio-actifs – DASYNT2
Nous avons récemment découvert chez le mammifère l'existence de la dendrogenine A (DDA). Il s'agit d'un alcaloïde stéroïdien dérivé du cholestérol qui induit la différenciation cellulaire et l'autophagie. Nous avons montré que ce lipide présente des propriétés de suppresseur de tumeurs et des propri
Rôle des chaperonnes dans la maturation et la régulation du récepteur des androgènes – ARCHAP
Les androgènes comme la testostérone et la dihydrotestostérone sont les moteurs du développement et du maintien du phénotype male. Ils jouent aussi un rôle dans la régulation de la masse musculaire et de l'homéostasie osseuse chez les deux sexes. Ces actions sont régulées par le récepteur des androg
L'ADN primase, le couteau Suisse des Archées: Etude de biologie intégrative – ARCHAPRIM
L’ADN de tous les organismes est constamment endommagé par des agents exogènes et endogènes. Une coopération complexe entre la réplication, la recombinaison et la réparation de l'ADN est nécessaire pour assurer une transmission fidèle du matériel génétique d'une génération à l'autre. Les archées hyp
