Projets financés
UBTD1: l'ubiquitination au carrefour de la mécanique cellulaire et du métabolisme cellulaire – Mechano-Ub
Les signaux mécaniques de l'environnement favorisent la prolifération cellulaire. Toutefois, on ignore encore largement comment ils contrôlent les voies métaboliques indispensables à la prolifération des cellules. Récemment, le partenaire 1 a identifié une protéine, UBTD1, qui joue un rôle important
Étude de nouvelles acylations d'histones dans la régulation de l'expression des gènes – CHROMACYL
Dans le noyau des eucaryotes, l'ADN s'enroule autour de protéines histones pour former la chromatine. Les modifications post-traductionnelles dynamiques des histones sont essentielles pour réguler l'expression des gènes, en particulier lors du développement et de la différenciation cellulaire. L'acé
Au coeur de l'allostérie : un voyage à travers l'espace des séquences et conformations des enzymes – AlloSpace
Les protéines sont considérées comme un ensemble dynamique de conformations en échange permanent. Les multiples fonctions des protéines, par exemple en tant qu'enzymes, récepteurs ou canaux, dépendent étroitement de cette diversité et de cette flexibilité conformationnelles. Une propriété particuliè
Adaptation dynamique aux capacités maximales de l'hôte: bioproduction régulée par le stress – SmartSec
La bioproduction nécessite de détourner des ressources (précurseurs, énergie, enzymes) normalement utilisées par les cellules hôtes pour leur croissance vers la production de molécules d’intérêt, telles que des alcools, des acides organiques, des parfums, des antibiotiques, et une large gamme de pro
Des polysialyltransférases d’origine marine pour la synthèse de bioconjugués immunomodulateurs – PsaMAr
Les acides polysialiques (polySia) sont des polymères glucidiques naturels d’intérêt car ils interagissent avec des acteurs importants du système immunitaire inné tels que les peptides antimicrobiens et les histones extracellulaires. Si, chez les mammifères ne sont détectés que des homopolymères de
Incorporation métabolique de thioesters latents hautement réactifs : une solution intégrée pour la production de protéines étiquetées et de biopolymères – MISTER
Ces dernières années, la production de bioélastomères par les outils du recombinant fait l’objet d’intenses efforts de recherche et sont motivées par des applications prometteuses dans le domaine biomédical ou en science des matériaux. Malgré des avancées significatives, le développement d’approches
Cibler la dimérisation des récepteurs de chimiokines CCR2 et CCR5: vers une meilleure régulation de l'inflammation – GET-REDI
Les récepteurs de chimiokines CCR2 et CCR5 appartiennent à la famille des récepteurs à sept domaines transmembranaires couplés aux protéines G (GPCRs). Ils jouent un rôle essentiel dans la migration des leucocytes. Par conséquent, ils sont impliqués dans le développement de la réponse inflammatoire
Ciblage de la SUMOylation: des peptides agrafés aux PROTACs et inhibiteurs photo-activables – SUMOTarg
SUMO est un modificateur post-traductionnel peptidique qui est conjugué covalemment sur des chaines latérales de lysines de milliers de protéines pour en modifier la fonction et le devenir. Ainsi, la SUMOylation est impliquée dans la régulation de la plupart des grandes fonctions cellulaires et est
Nouveaux Tags Fluorogéniques Photoactivables pour des Applications en Interactomique et Bioimagerie – OXO-Tags
Les petites molécules fluorescentes sont des outils indispensables dans la plupart des secteurs de la recherche biologique et biomédicale. En plus d’une fluorescence forte, brillante et stable, les fluorophores organiques doivent posséder des propriétés additionnelles pour répondre à des demandes en
Composition et organisation des systèmes de transport des lipides de la membrane externe des mycobactéries – MYCOLT
Les mycobactéries incluent plusieurs agents pathogènes importants, tel que Mycobacterium tuberculosis, l'agent de la tuberculose. Ces bactéries sont dotées d'une enveloppe complexe extrêmement riche en lipides contenant des acides gras à très longues chaînes appelés acides mycoliques qui interagisse
Détermination des mécanismes de destruction des proteins liées à l’hème en conditions physiologiques et dans la pathogénèse du cancer – HEMID
l'Hème est un cofacteur essentiel et ubiquitaire pour une multitude d'enzymes. L'hème libre agit comme une molécule de signalisation qui régule plusieurs voies de signalisation en modulant l'activité de protéines dites "hème-senseur". Il a notamment été démontré que l'hème libre régule la signalisat
Distribution et dynamique du processus OXPHOS – D2OX
La conversion de l'énergie chez la plupart des organismes vivants implique un gradient électrochimique transmembranaire de protons maintenu par l'activité de transporteurs de protons associés à la membrane connectés les uns aux autres par des navettes électroniques, les quinones, il s’agit du proces
Investigation multi-omique de la construction de matrice extracellulaire par les cellules souches humaines mésenchymateuses dans un hydrogel 3D de fibrine pour la régénération de la pulpe dentaire – TRIDENTOMIC
Le traitement classique des caries avancées consiste à retirer la pulpe dentaire (PD) ce qui entraîne une perte de vitalité et de surveillance immunitaire prédisposant aux réinfections et fractures. La régénération de la PD basée sur un échafaudage de fibrine 3D associé à des cellules souches mésenc
Contrôle de la qualité des protéines dans le noyau – PROCONUC
La manière dont les organismes réagissent au stress environnemental a des implications critiques à la fois sur la qualité de vie et le traitement des maladies. Maintenir un protéome qui fonctionne est un défi, étant donné la variété de stress protéotoxiques qui endommagent les protéines, favorisant
Role des domaines riches en méthionine dans l'homéostasie du cuivre: zoom sur les CueOs – MetCop
Cofacteur métallique d'enzymes impliquées dans de nombreux processus biologiques, le cuivre est un micronutriment essentiel à la vie. En excès, il est cependant toxique pour la cellule. La compréhension des mécanismes impliqués dans l'équilibre intracellulaire du Cu est donc cruciale. Les résidus
Rôle des différents substrats énergétiques pour l'activité cérébrale – BrainFuel
Le glucose est une source d’énergie importante pour toutes les cellules eukaryotes. Son métabolisme via la glycolyse et le cycle des acides tricarboxyliques couplé à la phosphorylation oxydative fourni les ATPs et les équivalents réducteurs nécessaires aux cellules pour accomplir leurs fonctions. A
Interrelation entre les produits de glycation de la dopamine et sur le système de réparation DJ1/PARK7. – ADTIQ-PARK
La glycation est la formation non-enzymatique d’une liaison covalente entre des réducteurs endogènes dérivés du glucose (comme le méthylglyoxal, MGO) et certains constituants des biomolécules (ADN, protéines et métabolites). Le MGO est un composé dicarbonylé hautement réactif vis-à-vis des groupemen
Un bioprocédé éco-efficient pour la conversion directe du méthane en méthanol – BIOMETHAN-OL
Ce projet vise à valoriser le méthane (CH4) contenu dans du gaz naturel (GN) issu de sources restreintes et localisées qui, pour des raisons de coût, ne peut être valorisé en énergie ou précurseur chimique. Ces émissions de GN sont donc rejetées à l’air, brûlées ou enfouies. Le consortium propose ic
Remodelage enzymatique de la matrice extracellulaire : Expériences en milieux synthétiques encombrés et modèles cinétiques – X-CROWD
La matrice extracellulaire (MEC) est essentielle pour le fonctionnement des organismes multicellulaires. Des maladies majeures, comme le cancer, sont associées à l’altération de son remodelage dynamique régulé par voie enzymatique. Cependant, celui-ci est encore peu compris au niveau théorique dans
Impacte de la poly-insaturation phospholipidique dans la dynamique, l’activation et la signalisation du récepteur Dopamine D2 – polyFADO
A cause du manque d’efficacité et des effets secondaires liés aux antipsychotiques (AP) conventionnels, il est nécessaire de développer des thérapies alternatives et adjuvantes. Des travaux ont montré l'implication des acides gras polyinsaturés (AGPI) dans l’étiologie de certains désordres psychiatr
Nouvelle génération de crosslinkers pour la spectrométrie de masse appliquée aux agents infectieux – NEOCLASSIC
L’interaction entre un pathogène et la surface des cellules de l’hôte est une étape critique de l’infection. La description fine de cette interaction au niveau moléculaire et donc à l’échelle des protéines est cruciale pour comprendre cette étape-clé et pouvoir développer de nouveaux traitements ou
La biochimie comparative et la convergence évolutive : de nouveaux outils de recherche sur la structure et la fonction des voies métaboliques – CONVERGE
Glycogène et amidon sont les formes les plus répandues de polysaccharides de réserves. Ils sont constitués tous deux de chaines de glucose polymérisé par des liaisons alpha-1,4, ramifiées entre elles par des liaisons alpha1,6, appelés points de branchement. Toutefois ils présentent des propriétés ph
Décrypter les régulations moléculaires de l’homéostasie du calcium et de l’autophagie par la protéine Fe-S humaine CISD2 – CISCO
La protéine humaine CISD2 est une protéine à centre Fe-S, principalement localisée au niveau des membranes associées aux mitochondries (MAMs), régions de communication inter-organelles dont les dysfonctionnements sont associés à des pathologies graves telles que le cancer, les maladies neurodégénéra
Régulation nutritionnelle dépendante du complexe de pré-initiation de la transcription par la O-GlcNAcylation de la TATA-Box Binding Protein – TaNGoT
L'expression des gènes est assurée par trois ARN polymérases (RNAP), chacune étant dédiée à une classe spécifique de gènes. L'assemblage de complexes moléculaires spécifiques au niveau des promoteurs des gènes forme des complexes de pré-initiation (PIC) qui assurent le recrutement et le positionneme
Evolution dirigée de modulateurs moléculaires d’interactions impliquant les domaines PDZ – AFFLIGEM
Les interactions impliquant les domaines PDZ constituent un module d’interaction essentiel pour la signalisation cellulaire. En particulier, ces interactions jouent un rôle critique dans l'organisation dynamique des synapses excitatrices glutamatergiques chez les mammifères. En raison de la complexi
Biologie chimique et ciblage des domaines intrinsèquement désordonnés des co-régulateurs de transcription p160 et CBP/p300 – ChemBioIDP
Nous proposons de développer une nouvelle stratégie pour la conception d’inhibiteurs des interactions protéine-protéine impliquant des domaines intrinsèquement désordonnés. Les protéines d’intérêt qui seront étudiées sont les coactivateurs de transcription ACTR (p160) et p300/CBP. Ces protéines sont
Elucider les mécanismes d'adaptation métaboliques et lipidiques du parasite Toxoplasma gondii en fonction de l'environnement nutritionnel de son hôte – ApicoLipidAdapt
Les parasites Apicomplexa sont des agents infectieux responsables de graves maladies chez l’homme telles que la malaria et la toxoplasmose. Il n’existe pas de vaccin efficace et les parasites deviennent résistants à la plupart des traitements actuels dont certains ont des effets toxiques, notamment
Interactions Protéine-Protéine en Meiose – PPIMei
La méiose est un programme cellulaire conservé au cours de l’évolution et orchestré par plusieurs machineries recombinant l’ADN parental en vue de former des crossovers. Le projet PPIMei vise à disséquer les interactions moléculaires impliquées dans ce processus en utilisant une combinaison d’approc
Asymétrie de la membrane externe chez Veillonella parvula, un diderme Firmicute atypique – OM-LipAsy
La membrane externe (ME) est un élément essentiel des bactéries didermes dont l'intégrité repose notamment sur son asymétrie contrôlée par le transport du LPS (Lpt) et de phospholipides (Mla). Cependant, hormis chez quelques bactéries modèles, on ignore les mécanismes précis du maintien de cette asy
Approche intégrative pour étudier les mécanismes d'interaction entre leukotoxines de S. aureus et nos récepteurs couplés aux protéines G – LEUKOCEPTOR
La résistance antimicrobienne chez S. aureus (SA) représente une grande menace pour la santé publique. De nouvelles cibles thérapeutiques sont donc nécessaires pour la conception de nouveaux médicaments. Les leukotoxines secrétées par SA sont une cible intéressante car elles se lient aux récepteurs
Canaux caclciques de type-T et complexe de signalisation dans la douleur chronique – interacT
La prise en charge de la douleur, tout particulièrement de la douleur chronique, est un enjeu sociétal essentiel. En France, on estime que près d’un adulte sur 5 souffre ou aura à souffrir de douleurs chroniques, souvent associées à d’autres pathologies. La réponse thérapeutique actuelle se limite s
Pertinence biologique et ciblage de l’ADN i-motif – iCARE
Les structures secondaires non canoniques d'acides nucléiques ont émergé au cours des dernières décennies comme des facteurs critiques modulant le métabolisme de l'ADN et de l'ARN. Les i-motifs (ADN-i), qui correspondent à des structures d'ADN non usuelles à quatre brins dans lesquelles les cytosine
Décrypter les mécanismes inflammatoires induits par l’activité enzymatique de l'héparanase dans les maladies de la peau en utilisant un inhibiteur naturel dérivé d'un polysaccharide marin – HeparInfSkin
Les lésions cutanées observées chez les patients atteints de psoriasis se caractérisent par une inflammation chronique où la surexpression de l’héparanase 1 (Hpa1) y contribue, bien que son rôle précis reste à démontrer. En effet, Hpa1 pourrait participer aux processus inflammatoires par son activit
De l'halogénation chez les champignons marins aux biocatalyseurs – HALO-CAT
Des travaux préliminaires au sein du laboratoire ont montré le potentiel de champignons marins dans la production de substances naturelles halogénées avec la détection non seulement de plusieurs molécules nouvelles mais aussi d’enzymes permettant l’halogénation de substrats. Dans ce projet, nous sou
Exploration de Nouvelles Activités de Manipulation des Anticorps – ENIgMA
Les anticorps sont des outils biotechnologiques essentiels, en raison de leur capacité à interagir étroitement et spécifiquement avec un antigène donné. Plusieurs stratégies utilisées pour manipuler les anticorps ont été développées en utilisant des effecteurs microbiens normalement impliqués dans l
Explorant l'émergence de la biocatalyse: relation structure-activité de la coenzyme A dans le contexte d'origine de la vie – COASAR
Les enzymes favorisent une grande partie des réactions du métabolisme biologique, souvent aidées par des cofacteurs qui facilitent la catalyse en se liant aux enzymes. Les cofacteurs sont impliqués dans plus de 60 % des mécanismes enzymatiques connus et beaucoup d'entre eux peuvent également catalys