Projets financés

Une augmentation importante du nombre d'expériences résolues en temps (TR) menées dans les synchrotrons, les lasers à électrons libres (XFEL) ou sur des cryo-microscopes électroniques (EM) a été observée ces dernières années. Nous avons contribué à cette accélération par la publication d’Xtrapol8, u

Une grande part du protéome des plantes (et d’autres eucaryotes) est constituée de régions intrinsèquement désordonnées (IDRs) dont les études conformationnelles, interactionnelles et fonctionnelles sont souvent négligées. Pourtant elles ont souvent des rôles cruciaux. Ces IDRs sont particulièrement

Les interactions entre le cytosquelette et les membranes permettent à des parasites tels que Trypanosoma brucei de remodeler leurs protéines de surface, facilitant ainsi l’évasion du système immunitaire de l’hôte. Chez T.brucei, la poche flagellaire (FP) est le seul site pour l'endocytose et l'exocy

Les virus sont des parasites opportunistes pathogènes dont la survie et la réplication reposent sur le détournement des ressources de l'hôte. La découverte des virus géants a révolutionné la Virologie et la Biologie du fait de la complexité de leurs génomes codant pour un millier de protéines, dont

Notre projet s’inscrit dans la thématique de l’étude du contrôle de l’expression génique. Grâce à une collaboration internationale, nous utiliserons des techniques de biologie structurale de pointe (RMN, SAXS, ITC), ainsi que des approches biochimiques et de biologie cellulaire in vivo pour étudier

Le projet OptoVCR vise à révéler le mécanisme moléculaire de la perméabilité ionique des channelrhodopsines virales (VCR1) avec une précision inégalée, et à utiliser ces connaissances pour concevoir de nouveaux outils optogénétiques. Ces canaux ioniques VCR1 et plus particulièrement OLPVR1, exprimés

Les protéines photoréceptrices sont omniprésentes dans la nature et régulent un grand nombre de processus biologiques en réponse à la lumière. Au sein du photorécepteur, un chromophore absorbe la lumière, modifiant ses propriétés chimiques. La photo-excitation du chromophore provoque alors un change

Le syste`me de se´cre´tion de type II (T2SS) permet de la se´cre´tion des toxines et enzymes implique´es dans la virulence des bacte´ries pathoge`nes. T2SS est très similaire aux pili de type IV, facteurs de virulence majeurs. Comprendre la fonction moléculaire de ces syste`mes est crucial pour de´v

Les quinones isoprénoïdes telles que l'ubiquinone (UQ) sont centrales pour la physiologie cellulaire puisqu'elles jouent le rôle de transporteurs d'électrons et de protons dans les chaînes respiratoires génératrices d'énergie et dans divers processus biologiques chez les bactéries et les eucaryotes.

Le protéasome est une machine moléculaire essentielle pour la dégradation des protéines intracellulaires. Chez les eucaryotes, son activité est étroitement contrôlée par des systèmes de ciblage complexes (ubiquitine) et des particules régulatrices (RP). Les archées, dont sont issus les eucaryotes, s

Ce projet porte sur les développements technologiques et méthodologiques en cryo microscopie électronique (cryo-EM) pour la biologie structurale, à travers le développement de méthodes et de logiciels pour la détermination rapide d’ensembles complets de conformations tout-atome (paysages conformatio

Le protéasome humain est un complexe multi-protéique essentiel à l'homéostasie et à la survie cellulaire. Sa dérégulation peut causer des pathologies neurodégénératives, auto-inflammatoires et certains cancers. Actuellement, des inhibiteurs de 1ère génération sont utilisés en clinique pour traiter l

Pour le bon fonctionnement de la cellule, le cytosquelette doit être fidèlement construit et maintenu. Cela implique un ballet complexe de protéines, en particulier les moteurs myosines et les filaments d'actine. Myo2 est une myosine qui s’assemble en filaments pour former les fibres de stress notam

Les rétrotransposons sont des constituants majeurs des génomes eucaryotes et présentent des similitudes structurales et fonctionnelles avec les rétrovirus. Leur intégration dans l'ADN s’effectue dans un environnement chromatinien complexe et hétérogène, où les protéines liées à l'ADN, les remodeleur

Le système de sécrétion de type VI (T6SS) est une nanomachine qui injecte des toxines dans les cellules procaryotes et eucaryotes et qui est un acteur clé dans la virulence bactérienne. Le T6SS ressemble à un nano-harpon qui est éjecté pour délivrer des toxines. Les bactéries didermes accomplissent

Les sécrétines sont largement retrouvées chez les bactéries gram négatives pour former l’imposant canal de membrane externe de nanomachines spécialisées dans la sécrétion ou l'assemblage de larges macromolécules extracellulaires. La structure 3D cryoEM des oligomères de sécrétine a récemment révélé

Les complexes kinase IKK (Inhibitor of kB (IkB) kinase) sont des régulateurs clés des voies de signalisation d’NF-kB ‘canoniques’ et ‘alternatives’, impliquées dans les réponses inflammatoires, immunitaires et apoptotiques. Alors que tous les complexes IKK possèdent un dimère catalytique composé des

Au cours de la division cellulaire, le fuseau mitotique contrôle la répartition des chromosomes dans les cellules filles. La dépolymérase des microtubules KIF2C/MCAK facilite la correction des erreurs d'attachement des microtubules au kinétochore (MT-k). L’absence de KIF2C provoque des défauts de sé

Les mitochondries sont responsables de la production d'énergie par les phosphorylations oxydatives (OXPHOS). Elles contiennent leur propre ADN (ADNmt), qui est exposé aux espèces réactives de l'oxygène (ROS) et à d'autres radicaux libres nocifs produits au cours des OXPHOS. Les lésions oxydatives de

Le complexe Cohésine joue un rôle clé dans la ségrégation des chromosomes et l'organisation 3D des génomes eucaryotes. Chez l’homme, des mutations de ce complexe sont retrouvées dans de nombreux cancers et causent des maladies neurodéveloppementales (cohésinopathies) comme le syndrome Cornelia de La

Ce projet est consacré à l'étude de la biogenèse des diverses classes de RNP H/ACA (sno, sca et Télomèrase). Elles sont composées d'un ARN H/ACA s'associant à deux hétéro-tétramères de GAR1, NHP2, NOP10 et DKC1 (Psi-synthase) et sont impliquées dans plusieurs processus vitaux comme la formation de P

Le récepteur-canal de la glycine (GlyR) assure la communication neuronale et constitue une cible pharmacologique prometteuse pour le traitement de la douleur chronique, du cancer et de l'hyperekplexie. De nombreuses structures du GlyR ont été résolues par cryo-microscopie électronique dans des condi

Les dommages de l'ADN peuvent avoir de graves conséquences pour les cellules, conduisant à l’accumulation de mutations, à l’instabilité génomique, voire à la mort cellulaire. Les voies de réparation de l'ADN par excision de bases (BER) et par excision de nucléotides (NER) sont en charge de l'élimina

Ce projet vise à comprendre comment les ribosomes sont assemblés dans les mitochondries de plantes. Les ribosomes sont les principaux effecteurs de la traduction, le processus fondamental qui convertit l'information génétique en protéines. Alors que la traduction a été très étudiée dans les systèmes

L’apoptose, ou « suicide cellulaire », est un mécanisme essentiel au bon fonctionnement de l’organisme. Un dysfonctionnement de ce processus peut entraîner de nombreuses pathologies, notamment le cancer et la maladie d’Alzheimer. La voie mitochondriale de l’apoptose repose sur la libération du cytoc

Les peptides jouent un rôle essentiel dans la médecine moderne grâce à leur spécificité, leur efficacité et leur faible toxicité, offrant des solutions prometteuses pour diverses maladies. La conception de médicaments à base de peptides rencontre des défis liés à l'amélioration des propriétés pharma

Les phages filamenteux sont des virus qui se comportent comme des symbiotes bactériens et constituent des acteurs peu caractérisés du microbiote. Ils participent notamment à la résistance aux antibiotiques et à la virulence de pathogènes humains et végétaux. Pourtant, le processus d'infection de l’h

La fixation de carbone par la photosynthèse est catalysée par les enzymes du cycle de Calvin-Benson-Bassham, des protéines solubles conservées dans tous les chloroplastes et formant des espèces de hautes masses moléculaires. Nous proposons d’utiliser un ensemble de techniques expérimentales et numér

Le projet ELIXER vise à élucider les mécanismes moléculaires qui sous-tendent le système de recombinaison spécifique du site Xer chez les bactéries. La recombinaison Xer est un processus critique qui résout les dimères chromosomiques formés lors de la recombinaison homologue, assurant ainsi une ségr

La résistance aux antibiotiques représente une réelle menace pour la santé humaine. La paroi cellulaire constitue la première ligne de défense des bactéries contre les antibiotiques notamment. Ancrées à la membrane, les lipoprotéines maintiennent l'intégrité de cette paroi et sont impliquées dans de

Le projet Catal-X se penche sur l’étude des événements dynamiques et transitoires survenant pendant le processus catalytique des enzymes. Ces événements restent difficiles à prédire avec l’intelligence artificielle ou à visualiser par cryo-EM. La cristallographie résolue en temps demeure donc une ap

L'existence des nanodomaines membranaires est désormais reconnue, mais les principes structurels selon lesquels les protéines et les lipides sont fonctionnellement assemblés restent peu explorés. À la surface des cellules, les glycanes constituent un lien pour le regroupement des glycolipides et