Mécanisme moléculaire de répression post-transcriptionnelle par une chaperonne à ARN à domaine ProQ/FinO et son petit ARN non-codant partenaire – RocCRcollab

Notre projet s’inscrit dans la thématique de l’étude du contrôle de l’expression génique. Grâce à une collaboration internationale, nous utiliserons des techniques de biologie structurale de pointe (RMN, SAXS, ITC), ainsi que des approches biochimiques et de biologie cellulaire in vivo pour étudier les principes moléculaires d’un système de répression post-transcriptionnelle impliquant une protéine chaperonne à ARN et un petit ARN non-codant (ARNnc) multi-cible. Les ARNnc jouent un rôle essentiel dans la physiologie cellulaire, participant à de nombreux processus, notamment la régulation de l'expression génique. Cette régulation implique l'appariement des bases de l'ARNnc avec des ARN messagers (ARNm) cibles, souvent avec l’aide de chaperons protéiques, mais comprendre les détails moléculaires et la dynamique de la répression reste un défi majeur. Chez les bactéries, la protéine Hfq a longtemps été considérée comme la seule chaperonne à ARNnc multi-cible. Cependant, nous avons récemment identifié et caractérisé la protéine RocC de Legionella pneumophila, un pathogène bactérien, comme étant la chaperonne à ARN de l’ARNnc multi-cible RocR. RocC fait partie d’une famille de protéines, très répandues chez les bactéries, possédant un domaine conservé ProQ/FinO qui permet leur interaction avec des ARN. Chez L. pneumophila, RocC stabilise RocR, et ensemble, ils répriment des gènes essentiels à la transformation naturelle, un mécanisme de transfert horizontal de gènes (HGT). Nous éluciderons les détails moléculaires du mécanisme de répression en caractérisant la structure et la dynamique du complexe RocC / RocR / ARNm cible, et validerons la pertinence fonctionnelle de ces interactions in vivo. Déchiffrer les relations structure-fonction de ce système apportera un éclairage sur la régulation des HGT et pourrait ouvrir la voie à de nouvelles stratégies pour prévenir l’acquisition et la propagation de la résistance aux antibiotiques.