Décryptage des déterminants d'assemblage des complexes de Calvin – CALVINASSEMBLY

La fixation de carbone par la photosynthèse est catalysée par les enzymes du cycle de Calvin-Benson-Bassham, des protéines solubles conservées dans tous les chloroplastes et formant des espèces de hautes masses moléculaires. Nous proposons d’utiliser un ensemble de techniques expérimentales et numériques pour étudier l’effet de différents types de modifications chimiques posttraductionnelles sur la conformation de ces protéines. Des motifs peptidiques conditionnellement désordonnés formeraient des interfaces avec des partenaires d’interaction que nous mettrons à l’essai in vitro. Nous proposons en outre que des chaperons d’assemblage ou des facteurs d’échafaudage inconnus stabilisent ces structures multimoléculaires de grande taille. L’identification par des méthodes protéomique des modifications et de ces partenaires présents lors de l’assemblage dans des extraits cellulaires soumis à chromatographies nous permettra ensuite de reconstituer ces structures à partir de protéines isolées en vue de la détermination de la structure des complexes à haute résolution. Nous mettrons alors en relation les interactions protéines-protéines et leurs effets allostériques sur les activités enzymatiques. CALVINASSEMBLY a ainsi pour objectif de combiner l’analyse de modifications posttraductionnelles, de la dynamique des protéines et de la formation de complexes multi-protéiques dans un modèle plus global de régulation de la photosynthèse.