Le canal membranaire T6SS : de l'évidence moléculaire à sa dynamique et sa structure chez Acinetobacter baumannii – T6-Channel

Le système de sécrétion de type VI (T6SS) est une nanomachine qui injecte des toxines dans les cellules procaryotes et eucaryotes et qui est un acteur clé dans la virulence bactérienne. Le T6SS ressemble à un nano-harpon qui est éjecté pour délivrer des toxines. Les bactéries didermes accomplissent cet exploit en faisant passer l’aiguille T6SS à travers un complexe membranaire (MC). On a longtemps le MC formait un canal à travers lequel le T6SS tirait la « flèche empoisonnée», empêchant ainsi les dommages membranaires chez l’attaquant. Ce transport moléculaire des effecteurs à travers les membranes biologiques repousse nos connaissances et nous incite à rechercher l'existence d'un canal spécifique. Pour résoudre ce problème, nous utiliserons le pathogène Acinetobacter baumannii (Ab) comme système modèle le plus simple. L'AbT6SS est utilisé pour la compétition interbactérienne et permet aux bactéries d'acquérir de l'ADN et donc des résistances aux antibiotiques. Nous avons des évidences que l'AbMC subit une dynamique à à travers la membrane externe (OM), des domaines spécifiques étant exposés de manière extracellulaire en raison d'autres impliqués dans la perméabilisation de la membrane. L’assemblage de l'AbMC requiert une composition spécifique et une connexion intime avec l'homéostasie lipidique. L'observation en microscopie électronique de l'AbMC natif purifié ont démontré une architecture gigantesque. Le projet T6 Channel utilisera une combinaison intégrée d'approches in vitro, in vivo et in silico pour déterminer la composition, la structure dynamique et le mécanisme de fonctionnement du canal OM du T6SS (T6OMC). Nous intégrerons quatre échelles moléculaires, de l'OMC (WP1) aux MC et T6SS entier (WP2) à l'interactome cellulaire et l'homéostasie lipidique (WP3). Ce projet permettra d’étudier d'autres T6OMC plus complexes chez des pathogènes.