Étude structure-fonction de la biogenèse et du mode d'action des sécrétines bactériennes – SECRET-in

Les sécrétines sont largement retrouvées chez les bactéries gram négatives pour former l’imposant canal de membrane externe de nanomachines spécialisées dans la sécrétion ou l'assemblage de larges macromolécules extracellulaires. La structure 3D cryoEM des oligomères de sécrétine a récemment révélé un complexe macromoléculaire sans précédent, organisé en un pore géant à double tonneau bêta abritant plusieurs constrictions. Afin de corréler ces nouvelles informations structurales avec les processus fonctionnels sous-jacents encore fort méconnus, nous proposons un ambitieux projet pluridisciplinaire utilisant des technologies de pointe de type RPE in cell, pontage cystéine et nano-anticorps interférents visant à capturer et analyser les changements de conformation opérés par la sécrétine au cours du processus de sécrétion. Les mensurations atypiques des sécrétines imposent également des modes de transport à travers l'enveloppe spécifiques souvent inconnus dont l’identification sera abordée par deux approches complémentaires de génétique in vivo et de prédiction in silico du ou des partenaires impliqués. La détermination des bases moléculaires du mode d'action et de l’adressage des sécrétines bactériennes permettra non seulement d'améliorer notre compréhension fondamentale des nanomachines correspondantes, largement répandues chez les bactéries pathogènes, mais aussi d'ouvrir la voie au développement de nouvelles stratégies antibactériennes.