Projets financés
Signalisation oxydative et régulation épigénétique lors de l’émergence des semis sous stress hydrique. – SEED
La majeure partie de l'alimentation humaine ou animale est directement ou indirectement dérivée des semences. Leur germination puis le développement des plantules, qui déterminent la vigueur germinative, sont fortement impactés par les conditions environnementales. Par conséquent, comprendre l'impac
Approche de biologique intégrative pour comprendre la physiologie adaptative des bovins élevés à l'herbe afin de produire des viandes « bas carbone » – iREACT
La production intensive de viande bovine est critiquée pour son empreinte environnementale, l’utilisation de céréales destinées à l’alimentation humaine, le bien-être animal et les risques pour la santé humaine lors de consommation excessive de viande. Pourtant, les systèmes agricoles où les bovins
Les secrets de la reproduction des bourdons : identification des phéromones clés et des mécanismes neuronaux – BUMBLE-DATE
Les insectes utilisent des composés spécifiques pour communiquer leur statut reproductif et attirer le sexe opposé pour l'accouplement. Cependant, à l'exception de quelques taxons (diptères et lépidoptères), la communication sexuelle des insectes reste mal connue. Le bourdon terrestre (Bombus terr
Intégration de données métagénomiques et d'approches prédictives pour ordonner la diversité génomique des bactériophages – PhageOrder
La diversité du monde bactérien commence à être bien appréhendée, grâce aux efforts conjoints de scientifiques issus des disciplines de l'écologie, de la métagénomique et de l'informatique. Le champ connexe de l'étude des bactériophages (c'est-à-dire des virus infectant les bactéries, également appe
Explorer les rôles des GNAT chloroplastiques : l’acétylation comme mécanisme de régulation de la photosynthèse et de la sénescencece des plastides – AcetylPlast
Basé sur une longue collaboration franco-allemande, le projet AcetylPlast vise à élucider les rôles de l'acétylation N-terminale (NTA) et en lysine (KAT) des plastes. Le consortium a identifié une famille d'enzymes GNAT (Gcn5-related N-acetyltransferase) des plastes avec double activité NTA et KAT.
Production de biopesticide: de la plante sauvage à la filière – BioPest_Boost
Les pesticides constituent une menace pour la santé humaine et la biodiversité. Dans le cadre réglementaire visant à réduire l'utilisation des pesticides conventionnels, la recherche de méthodes alternatives, comme l'utilisation de produits de biocontrôle (produits phytosanitaires d'origine naturell
Les diatomées zombies : Faire ressusciter d'anciennes spores pour étudier les adaptations à l'échelle millénaire à un environnement changeant – DIAZOM
Le projet se focalise sur d'anciennes spores de diatomées Chaetoceros récupérées dans des carottes de sédiments marins de l'Antarctique datant de 10 000 ans, avec la possibilité de remonter encore plus loin dans le temps. Le succès sans précédent que nous avons obtenu récemment en faisant revivre ce
Role du shuttle allélopathique dans la dynamique des efflorescences de microalgues toxiques – RASH-HAB
La communication chimique est le mode d'interaction le plus fréquent du monde vivant. Bien qu'essentielle au fonctionnement des écosystèmes, notre compréhension des interactions chimiques chez le plancton est limitée. Néanmoins, certains microorganismes photosynthétiques peuvent inhiber activement l
Biogénèse de la membrane externe et stress de l'enveloppe chez les Terrabactéries – OM-BioStress
La membrane externe (ME), essentielle aux bactéries didermes (Gram-négatives), constitue une cible clé pour les antimicrobiens. Malgré des avancées notables dans la compréhension des mécanismes complexes de biogenèse et de maintien de la ME, nos connaissances reposent principalement sur quelques mod
Réponses des communautés autotrophes induites par la lumière aux conditions extrêmes et variables de la lumière en Arctique – ARCLIGHT
Les algues de la glace de mer et le phytoplancton, en particulier les diatomées, sont des organismes photosynthétiques essentiels dans l'océan Arctique. Près du pôle Nord, les variations saisonnières du rayonnement solaire sont extrêmes, avec des photopériodes allant de 0 à 24 heures d'un solstice à
Balance entre Prolifération et Croissance des Cellules Germinales chez le Poisson – PROBA
L’une des questions les plus fascinantes de la biologie de la reproduction, tant du point de vue fondamental qu’appliqué, est de comprendre comment les poissons adultes parviennent à maintenir une fécondité exceptionnellement élevée tout au long de leur vie. Selon les espèces, une femelle peut produ
Holobionte de dinoflagellée toxique - Quelle place pour les champignons? – HOLOFungi
Le projet HOLOFUNGI explore les interactions microbiennes dans l'environnement marin en utilisant un dinoflagellé toxique Prorocentrum lima comme holobiont modèle. Cette microalgue produit des toxines et contribue aux proliférations nuisibles d’algales (HABs). Ce projet se concentre en particulier s
Étude des photorécepteurs phytochromes de diatomées pour explorer les mécanismes de détection de la lumière du phytoplancton en milieu marin – D-PHYTO
Les organismes photosynthétiques utilisent la lumière non seulement comme principale source d'énergie pour leur métabolisme, mais aussi comme un indicateur clé de leur environnement. La perception de la lumière repose sur des photorécepteurs spécifiques d’une couleur qui traduisent le signal lumineu
Comprendre le rôle des protéines TPR/ANK dans l'architecture de l'inflorescence chez Oryza sativa – UTOPIA
L’architecture de la plante est un déterminant clé de l’adaptabilité et de la productivité des espèces d’intérêt agronomique, comme le riz. L'identification des régulateurs génétiques de la ramification est importante pour comprendre les processus fondamentaux de la mise en place et du fonctionnemen
Contrôle lipidique de la signalisation médiée par la RhoGTPase dans les plantes – LipCORP
La signalisation cellulaire est un processus crucial qui permet aux organismes de percevoir et de répondre aux stimuli environnementaux et développementaux. Au niveau de la membrane plasmique, une multitude de récepteurs et de corécepteurs protéiques ont été identifiés comme des acteurs clés de la s
Nouvelle génération de bactériocines lactiques : exploration des mécanismes de régulation post-transcriptionnelle et des voies d'externalisation pour des applications postbiotiques – BACANTI-GNP
Devant la recrudescence du phénomène de la résistance bactérienne aux antibiotiques (antibiorésistance) mais aussi pour répondre aux consommateurs qui veulent plus de produits naturels et moins de conservateurs chimiques dans les aliments, il est alors tout à fait envisageable d’y répondre à ces deu
Synergies entre champignons mycorhiziens et bactéries hyphosphériques dans la nutrition et les performance agronomiques du maïs à bas intrants – HyphAMaize
Les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) établissent des relations symbiotiques avec les racines des plantes et jouent un rôle clé dans l’acquisition de nutriments, fournissant à leur hôte du phosphore et de l'azote du sol en échange de photosynthétats. Les CMA recrutent via leur sphère d'inf
Décryptage du mode d'action moléculaire des HSF au cours de la réponse transcriptionnelle au stress thermique et au priming – P-HEAT
Les tomates comptent parmi les cultures légumières les plus importantes pour la production et le commerce mondiaux. Avec une demande qui devrait augmenter de 60 % d'ici à 2050, le changement climatique constitue un défi majeur pour l'augmentation des rendements. Pour y faire face, les scientifiques
Virulence des parasitoïdes face à la protection symbiotique de leurs hôtes : incidence, spécificité, mécanismes et implications pour la lutte biologique contre les insectes nuisibles – PARAVIR
À l'échelle mondiale, environ 20 % des pertes agricoles sont dues aux insectes phytophages, les pucerons étant parmi les ravageurs les plus problématiques. Bien que les pesticides soient largement utilisés contre les pucerons, leur durabilité, les réglementations et leurs effets négatifs soulignent
Evolution des INVERsions chromosomiques chez les agents PATHogènes – INVERPATH
Les inversions sont des réarrangements chromosomiques qui peuvent former des combinaisons d’allèles bénéfiques controlant des phénotypes adaptatifs. Les inversions peuvent être polymorphes au sein des espèces ou peuvent être fixées entre espèces. Les inversions sont identifiées dans un nombre croiss
Mise en évidence d'une olfaction trachéale chez deux espèces de drosophiles apparentées. – TrachOdors
Le réchauffement climatique, les mouvements et les échanges commerciaux internationaux entraînent la dissémination d'insectes ravageurs, comme la drosophile D. suzukii en France. Récemment, nous avons découvert une nouvelle modalité de détection des odeurs émanant d’un organe méconnu qui joue un rôl
Décrypter les programmes génétiques des champignons causant les maladies des rouilles par la transcriptomique de leur cycle de vie – RustCyclomics
Les champignons de l’ordre des Pucciniales sont des agents phytopathogènes qui provoquent les maladies dites de rouille et ils constituent une menace sérieuse pour l'agriculture. Ces champignons biotrophes obligatoires présentent des caractéristiques biologiques uniques par rapport aux autres champi
Génomique de la phylogénie, de l'évolution et du diagnostic des bactéries responsables de la maladie du huanglongbing des agrumes – CALIBEVOL
Le huanglongbing des agrumes (HLB) est une maladie dévastatrice responsable de pertes économiques majeures dans les pays producteurs d'agrumes du monde et est actuellement considérée comme la principale menace pour l'industrie des agrumes. Le HLB est associé à trois espèces de ‘Candidatus Liberibact
Comprendre comment la méthylation de l'arginine/R s'établit et contribue au développement et à l'adaptation des plantes – AGO-Rmet
Le projet AGO-Rmet est un projet de recherche fondamentale destiné à mieux comprendre comment la methylation sur les résidus arginines/R (R-met) se met en place et comment ce mécanisme de régulation contribue au développement de la plante et à son adaptation à l’environnement. La R-met est une modif
Identifier les régions de contact entre promoteurs et “enhancers” comme moteurs évolutifs potentiels de la nodulation symbiotique des légumineuses – EnhanceNod
Les légumineuses interagissent avec les bactéries rhizobia pour former des organes racinaires symbiotiques, les nodules, où le N2 atmosphérique est fixé au profit des plantes. Les légumineuses sont donc importantes pour les pratiques agroécologiques et pour réduire l’utilisation d’engrais chimiques
Évolution et fonction de la détermination des nodosités symbiotiques chez les légumineuses – DETERMINATE
Comparé aux mammifères, la croissance indéterminée et la plasticité du développement post-embryonnaire sont des caractéristiques clés des plantes terrestres. Identifier les réseaux moléculaires qui régulent la détermination et l'indétermination de la croissance est essentiel pour comprendre l'évolut
Conservation fonctionnelle des variants d'histones H2A dans les clades d'algues et de plantes – His2AVar
L'incorporation de différents variants d'histones dans les nucléosomes permet à la stabilité des nucléosomes et à l'accessibilité de l'ADN d’être modulées ainsi qu’à des modifications spécifiques des histones d’être déposées. Il est intéressant de noter que certains variants d'histones sont apparus
Compartimentation et organisation d'ELF3 dans l'adaptation des plantes à la température – COOL-PLANT
La perception de la température et la réponse transcriptionnelle qui en découle sont essentielles pour la croissance et la reproduction des plantes. Des études récentes suggèrent qu'un mécanisme important permettant une réponse rapide et réversible aux variations de température est la compartimentat
Chronobiologie pour améliorer la résilience du pois aux stresses abiotiques – CHRONOPEAS
L’horloge circadienne permet aux plantes d’anticiper et répondre aux variations journalières de signaux comme la lumière ou la température. Composée principalement de facteurs de transcription ayant une expression rhythmique au cours de la journée, elle régule des processus clés comme la floraison e
Les appendices des d'insectes : implications dans les interactions avec l'habitat et les mécanismes de défense locale – a-SHIELD
Le succès évolutif des insectes est en grande partie lié à l’adaptabilité de leurs appendices articulés, leur permettant d'exploiter des écosystèmes variés et la réalisation de comportements complexes. Interfaces avec l’extérieur, ces appendices sont essentiels pour la perception de l'environnement,
Homéostasie de la sève élaborée : élucider les mécanismes écophysiologiques de controle du métabolome et du flux de sève – PHLOEMICS
La sève élaborée est le fluide qui circule entre les organes de la plante pour redistribuer les assimilats carbonés, azotés et soufrés et les molécules de signalisation. Elle est donc cruciale pour le remplissage des grains et des fruits, la production primaire et le rendement. Malgré cette importan
Cibler les récepteurs phéromonaux en écologie chimique inverse assistée par l'intelligence artificielle : une stratégie prometteuse pour la lutte contre les ravageurs des cultures – PHERECIA
Chez les insectes de la famille des charançons, dont de nombreuses espèces sont des ravageurs de cultures, des signaux chimiques volatils appelés phéromones d’agrégation permettent aux adultes de se regrouper sur leur plante hôte pour se reproduire. Ces phéromones sont parfois utilisées en biocontrô
Impact des fibres alimentaires de légumineuses sur la muqueuse de l'intestin grêle du porcelet – MucFib
Compte tenu des défis auxquels est confrontée la production porcine, il est nécessaire de trouver de nouvelles sources de protéines ayant un faible impact sur l'environnement tout en étant nutritives pour les animaux. Les légumineuses locales pourraient être une solution en remplaçant d'autres ingré
Dissection des mécanismes de recombinaison et d'évasion des défenses dans les infections mixtes conduisant à l'émergence de géminivirus invasifs brisant la résistance de l'hôte et l'exclusion de la su – RecombiDEv
Les bégomovirus à ADN simple brin (ss) circulaire (genre Begomovirus, famille Geminiviridae) et leurs satellites sont transmis par l'aleurode Bemisia tabaci de manière persistante et circulante, causant de graves maladies des plantes cultivées dans le monde entier. Ils évoluent par recombinaison et
Exploration des mécanismes de l'homéostasie du nickel chez les plantes à l'aide d'une espèce hyperaccumulatrice – HOMONIME
Le nickel est un métal essentiel pour les plantes. Il est le cofacteur indispensable à uréase, qui dégrade l’urée pour recycler l’azote. Cependant, le nickel est toxique quand il est présent en excès, car il affecte la photosynthèse et induit des stress génotoxiques et oxydatifs. Toutes les plantes
Améliorer la résistance des pères et de leur descendance au stress thermique par la programmation précoce chez les poulets – Heat-T
Chez les poulets, le stress thermique (ST) influence particulièrement la physiologie des coqs en induisant une mortalité importante et une diminution de la fertilité. Pour atténuer les effets négatifs de l'HS sur la survie des coqs, des protocoles programmation précoce ont été développés et consiste
Caractérisation fonctionnelle de protéines impliquées dans le transport et la chélation de métaux chez la microalgue hypertolérante Coelastrella – FunhyCoela
La contamination des écosystèmes par des éléments traces métalliques, communément appelés métaux lourds, crée une menace importante pour l'environnement et la santé humaine. Les métaux lourds sont toxiques pour la plupart des organismes à de faibles concentrations, mais certains ont développé des mé
Diversité et vulnérabilité des stratégies de recrutement larvaire et de métamorphose chez les poissons marins – FRAMES
La plupart des poissons marins ont un cycle de vie bipartite avec un stade larvaire pélagique suivi de stades juvéniles et adultes liés aux habitats récifaux. Le retour des larves vers ces habitats, leur colonisation et leur survie constitue le recrutement larvaire, une des transitions écologiques l
Etude chez le pétunia de la communication dépendante de la voie de la karrikin et induite par des sesquiterpènes volatils – VOLCOM
Les plantes utilisent leur capacité à produire des composés organiques volatils (COV) pour communiquer avec leur environnement. Elles sont aussi la cible de COV libérés lors des interactions plante-microbe et plante-plante et lors de signalisations intra-plantes. Chez le pétunia, nous avons montré
Mécanismes cellulaires et moléculaires à la base du déclin de la fonctionnalité de la niche des cellules souches musculaires chez la truite – AMuFish
Les poissons d’intérêt agronomique ont une croissance musculaire post-larvaire continue, caractérisée par la persistance de la formation de nouvelles fibres musculaires issues des cellules souches musculaires (cellules satellites) après l’éclosion. Néanmoins, après la phase de croissance hyperplasiq
Comprendre la diaphonie moléculaire des Endozoicomonas dans l'holobionte cnidarien – CECIL
Les symbiotes microbiens permettent aux holobiontes coralliens (Cnidaria) de prospérer dans les eaux tropicales oligotrophes. Si la symbiose mutualiste corail-algue est bien étudiée, d'autres membres du microbiome corallien, notamment les champignons, les procaryotes et les virus, restent mal compri
Caractérisation de l'interactome de la cellule hôte nécessaire à l'entrée et la réplication du virus respiratoire syncytial bovin – BRSV-HostiN
Le virus respiratoire syncytial bovin (VRSB) est un pathogène respiratoire majeur des veaux, responsable de pertes économiques substantielles. Ce virus est le proche homologue du VRS humain, principale cause de la bronchiolite du nouveau-né. Actuellement, il n'existe pas d'antiviraux ni de vaccins s
Démêler les stratégies coévolutives des hôtes et des symbiontes – HONEST
Les relations symbiotiques varient du mutualisme au parasitisme. Dans les symbioses mutualistes obligatoires, les endosymbiotes subissent souvent une réduction irréversible de leur génome. Maintenir la stabilité des interactions hôte-symbiote est difficile, surtout lorsque le symbiote se dégrade. Se
Caractérisation fonctionnelle des transporteurs de gibbérellines – MOVE
Les gibbérellines (GAs) sont des molécules peu abondantes produites par les plantes et qui ont la capacité de se déplacer au sein de la plante entière pour coordonner divers processus de croissance. Au cours des deux dernières décennies, des progrès importants ont été réalisés dans la compréhension
Interférence des protéines de mouvement viral dans la détection des virus dans les plantes – PlantVirImmune
Divers virus sont à l'origine de pandémies de maladies dévastatrices chez les plantes cultivées et constituent des facteurs importants de limitation de la production agricole. Le processus et les résultats de l'infection virale concernant les maladies, la tolérance ou la résistance sont régis par de
Adaptations cognitives chez les animaux domestiques : Étude de l'impact de la sélection artificielle sur la cognition et la plasticité cérébrale chez les poules – CADO
L'impact de la domestication sur la cognition animale suscite des débats depuis longtemps. Les théories initiales suggéraient que les animaux domestiqués pourraient subir des altérations cognitives par rapport à leurs ancêtres sauvages, en raison de compromis entre les traits sélectionnés et la fonc
Régulation de la stabilité des ARNm à l'échelle de l'organe chez Arabidopsis – STABILORG
Après export du noyau vers le cytosol, les ARN messagers (ARNm) sont en constant équilibre entre traduction, stockage et dégradation. La régulation spatio-temporelle de cet équilibre est essentielle pour ajuster le transcriptome en réponse aux signaux développementaux et environnementaux. Cette régu
Étude du module de détection de CO2 MPK12/HT1 pour ajuster les caractéristiques d'utilisation de l'eau du TOmato adaptées à différents contextes agricoles – TOMWU
La production agricole est confrontée à des défis sans précédent en raison du changement climatique. L'eau devient plus que jamais le facteur limitant de la croissance des plantes dans le monde. Lorsqu’elle est rare, la fermeture des pores stomatiques des feuilles est vitale pour en limiter les pert
Les peptides CEP, CLE et IDA au carrefour des interactions parasitaires et symbiotiques – CLIPS
Certains petits peptides sécrétés agissent comme des molécules de signalisation, notamment pour contrôler la spécification cellulaire chez les plantes. Le projet CLIPS vise à mieux comprendre le rôle de ces hormones peptidiques dans trois interactions biotiques, en utilisant la légumineuse modèle Me
Dynamique des Compartiments Nucléaires et de l'Organisation 3D du Génome chez le Bovin – DYNAMENT
Une meilleure compréhension de la biologie des animaux et de la construction des phénotypes, telle que la relation entre le génotype, le phénotype et l'expression des gènes, peut contribuer à construire un système agricole durable. L'information génétique est codée sur le génome linéaire, qui est en
Rôle de l'hétérogénéité phénotypique dans la survie de Streptococcus pneumoniae – PHENICS
Streptococcus pneumoniae (ou pneumocoque) est un pathogène humain majeur et la principale cause d'infections des voies respiratoires inférieures. Si la résistance génétique permet aux bactéries de proliférer en présence d'antibiotiques, la tolérance phénotypique leur permet de survivre au traitement
Plante, pathogène et microbiome, l'appel à l'aide des plantes sous le prisme de la recherche "omics" – MicroHelp
Le concept du “Cry for help” suggère que les plantes, quand elles subissent un stress abiotique ou biotique, recrutent un microbiome spécifique, c’est-à-dire une communauté de micro-organismes, pour combattre ce stress. L’hypothèse repose sur la capacité de la plante à structurer un microbiome favor
Nouvelles méthodes favorisant la formation de crossovers dans des régions froides pour la recombinaison – T-RECS
La recombinaison méiotique est centrale à l’hérédité, l’évolution et l’amélioration génétique des espèces. Elle est utilisée par les sélectionneurs pour créer de nouvelles variétés élites performantes, à faible impact environnemental et adaptées à des environnements changeants. Cependant, cette amél
