Régulation de la stabilité des ARNm à l'échelle de l'organe chez Arabidopsis – STABILORG

Après export du noyau vers le cytosol, les ARN messagers (ARNm) sont en constant équilibre entre traduction, stockage et dégradation. La régulation spatio-temporelle de cet équilibre est essentielle pour ajuster le transcriptome en réponse aux signaux développementaux et environnementaux. Cette régulation est essentielle chez tous les organismes, et en particulier chez les plantes qui sont exposées à un environnement en constante évolution. Bien que la régulation fine de cette stabilité soit cruciale pour réguler l'expression des gènes, notre compréhension du rôle des éléments cis et trans-régulateurs dans ce mécanisme reste limitée chez les plantes. Le projet actuel vise à comprendre comment la dégradation des ARNm régule le métabolisme des ARN en réponse à des stress environnementaux de manière tissu-spécifique. Les données préliminaires du consortium suggèrent que la stabilité des ARNm peut être ajustée par des signaux développementaux et environnementaux. Dans ce projet, nous chercherons à décrypter les déterminants moléculaires modulant la dégradation des ARNm chez Arabidopsis, à la fois dans les feuilles et les racines, en conditions normale et de stress au travers de trois axes. Tout d'abord, nous analyserons la dynamique du devenir des ARNm dans trois conditions abiotiques différentes au sein des feuilles et des racines en utilisant une stratégie transcriptomique orthogonale combinant des mesures de demi-vie des ARNm, de la longueur de la queue poly(A) et de l'efficacité de la traduction (WP1). Ensuite, nous caractériserons les protéines de liaison à l'ARN (RBP) associées à la modulation de la stabilité de l'ARNm en utilisant une technique de "RNA Interactome Capture" à l'échelle d'un transcrit unique (WP2). Enfin, nous testerons l'importance physiologique de la modulation de la stabilité des ARNm (WP3). In fine, ce projet permettre de renforcer nos connaissances sur le role de la stabilité des ARN messagers chez les plants.