Biogénèse de la membrane externe et stress de l'enveloppe chez les Terrabactéries – OM-BioStress

La membrane externe (ME), essentielle aux bactéries didermes (Gram-négatives), constitue une cible clé pour les antimicrobiens. Malgré des avancées notables dans la compréhension des mécanismes complexes de biogenèse et de maintien de la ME, nos connaissances reposent principalement sur quelques modèles comme Escherichia coli (Gracilicutes), laissant une grande partie des bactéries largement inexplorées. Nos recherches récentes révèlent que la ME est une structure ancestrale, perdue à plusieurs reprises exclusivement chez les Terrabactéries, l'un des deux grands groupes bactériens. Ces dernières semblent avoir développé des mécanismes uniques de construction et de maintien de leur ME, très différents des modèles classiques, et qui restent encore à élucider.
Ce projet a pour ambition d'explorer comment les Terrabactéries didermes assurent la biogenèse de leur ME et gèrent les contraintes liées au stress de l'enveloppe. Pour cela, nous combinerons des approches computationnelles et expérimentales, en utilisant notre modèle Veillonella parvula. Nous mènerons des études génétiques, transcriptomiques, phénotypiques ainsi que des analyses de cryo-microscopie haute résolution, afin de caractériser plusieurs gènes candidats, identifiés via des outils bioinformatiques, qui semblent jouer un rôle dans de nouvelles voies de biogenèse de la ME. Parmi eux, un système à deux composants pourrait être responsable du contrôle qualité de la ME et du périplasme. Ces résultats seront enrichis par des analyses in silico à grande échelle, permettant de reconstruire l'origine et l'évolution des mécanismes de biogenèse et de maintien de la ME chez les Terrabactéries. Nous espérons ainsi mieux comprendre ce qui distingue ces mécanismes de ceux présents chez les Gracilicutes, et nourrir notre compréhension de la transition des bactéries didermes vers les monodermes.