Projets financés

L’organisation tridimensionnelle du génome est un facteur important pour la régulation de la transcription et est souvent dérégulée dans les maladies telles que les cancers. Par son rôle direct sur la répression de la transcription, la périphérie nucléaire est un élément clé de l’architecture nucléa

La transcription cachée est un phénomène répandu aussi bien chez les eucaryotes que les procaryotes. Elle se caractérise par une production massive d’ARNs non-codants depuis des régions non-annotées du génome. Ce phénomène est potentiellement dangereux pour la cellule, car il peut interférer avec l’

L'enveloppe bactérienne est un constituant cellulaire impliqué dans des fonctions de maintenance essentielles, telles que l'intégrité physique, la division cellulaire, la motilité, l'import et la sécrétion de composés, la communication cellulaire. C'est également un facteur clé de la pathogénie bact

La réponse cellulaire à des changements environnementaux ou la transition d'un état cellulaire à l'autre sont généralement définis par des modifications coordonnées de l'expression des gènes, un processus complexe impliquant la production d’ARNm. Lors de la production de ces ARNm, l’épissage alterna

Au cours de l'embryogenèse, un nombre limité de voies de signalisation conservées chez les animaux est constamment recruté avec de fines différences dans diverses lignées permettant l'émergence de la diversité morphologique actuelle des métazoaires. L'activation de ces signaux aboutit généralement à

L'épissage alternatif affecte jusqu'à 95% des gènes chez l’homme. Il existe trois types principaux d'épissage alternatif: le saut d'exon, l’utilisation alternatif de sites en 5` ou 3` et la retention d’introns (RI). Alors que les deux premiers sont bien décrits dans le développement normal et la mal

Les ADN satellites sont des répétitions de séquences nucléotidiques (de quelques paires de bases à plusieurs centaines) qui peuvent s'étendre sur plusieurs milliers de kilobases. Ces séquences, constituant majeur de l'hétérochromatine, représentent une fraction importante des génomes eucaryotes. Par

L'objectif de ce projet est d'étudier les mécanismes clés impliqués dans les anomalies structurelles du cervelet (SCD) chez l’homme, en utilisant des avancées technologiques récentes dans les domaines du séquençage génomique et de la modélisation. Ce programme est conçu pour avoir un impact importan

Le maintien de l'identité cellulaire repose sur la capacité des cellules filles à exprimer le même répertoire génétique que leur cellule mère. De façon générale, le maintien du transcriptome au fil des divisions cellulaires se fait par défaut, grâce à des mécanismes de répression épigénétique qui as

Les duplications génomiques complètes sont un thème récurrent dans l'évolution des vertébrés et leur analyse reste toujours une question cruciale en génomique et biologie évolutive. Dans ce contexte, le projet GenoFish s’est focalisé sur la duplication spécifique des poissons téléostéens qui eut lie

La reprogrammation cellulaire consiste à agir sur des gènes spécifiques, les Déterminants de Reprogrammation (DR), déclenchant une dé- ou trans-différenciation cellulaire. La prédiction de ces DR est un défi majeur, notamment en médecine régénérative. Des travaux récents ont montré avec validation e

Ces dix dernières années, de nombreux variants génétiques fréquents impliqués dans les maladies complexes ont été mis en évidence. Ceux-ci n’expliquent qu’une fraction réduite de la composante génétique de ces maladies et il est probable que des variants plus rares, apparus récemment et donc circon

Le contrôle de la qualité de l'ARN (RQC) est un mécanisme qui élimine les ARN aberrants afin d'assurer que seuls les ARN messagers (ARNm) fonctionnels produisent des protéines. Des défauts dans la machinerie RQC ou une saturation du RQC par un excès d'ARNs aberrants activent le "post-transcriptiona

La transition de la mitose à la méiose est un processus clé de différenciation cellulaire essentiel à la transmission de l’information génétique aux générations suivantes. Les modifications importantes dans les profils d’expression génique impliquent l’existence de mécanismes qui établissent et mai

Une différence majeure entre les bactéries et les eucaryotes est intrinsèque à la structure de leurs chromosomes: ils sont linéaires dans les eucaryotes et circulaires dans les bactéries. La circularité de l’ADN conduit à la formation de dimères de chromosomes qui entravent la répartition de l'infor

Comment l’identité cellulaire est-elle établie pendant la différenciation ? Comment peut-elle être maintenue ou changée au cours du développement, particulièrement lors du choix entre divisions symétriques et asymétriques ? A quel point le destin cellulaire somatique peut-il être mis au défi ou repr

La lèpre est une maladie infectieuse chronique causée par Mycobacterium leprae qui infecte principalement les macrophages et les cellules de Schwann. La lèpre demeure un problème majeur de santé publique avec plus de 200.000 nouveaux cas signalés en 2014. Les Réactions de Réversion de la Lèpre (RR)

La transcription non-codante du génome (transcription pervasive) est une caractéristique universelle des transcriptomes eucaryotes et procaryotes. L’ADN étant le support d’un grand nombre de micro-machines moléculaires impliquées simultanément dans la lecture, la duplication et la préservation de l’

L’initiation de la transcription par l’ARN polymérase II (PolII) nécessite un grand nombre d’interactions protéine-protéine, dont les impacts fonctionnels in vivo ont été peu étudiés. Un acteur clef est le Médiateur (MED), un complexe multiprotéique conservé servant d’interface physique et fonctionn

Les séquences répétées constituent plus de la moitié du génome humain et participent à sa fonction et à son évolution. Parmi ces éléments répétés, les rétrotransposons L1HS, spécifiquement humains, forment la seule famille d'éléments transposables autonomes et actifs chez l'Homme. Leur mobilité génè

Une des grandes questions actuelles en biologie est de comprendre les bases génétiques à l'origine des variations des caractères observables, ou phénotypes, au sein des populations naturelles. La complexité de l'architecture génétique des caractères varie d'une simple hérédité Mendelienne à des rése

Les microARNs sont de petits ARN régulateurs réputés comme étant non codants. Nous avons récemment montré que les transcrits primaires de microARNs chez les plantes codent pour des petits peptides régulateurs, que nous avons appelés miPEPs (Lauressergues et al., 2015, Nature). Les miPEPs sont produi

Les lymphocytes B ont la remarquable capacité d’altérer leur génome. Les cellules B matures effectuent la commutation isotypique (CI) qui cible spécifiquement les gènes constants du locus IgH. La CI a lieu entre des séquences « switch » (S) hautement répétées et requiert leur transcription, fourniss

Le métabolisme de l’ARN, qui implique des ribonucléases et des enzymes auxiliaires telles que les hélicases à ARN, joue un rôle pivot dans toute cellule vivante et constitue une étape primordiale dans la régulation de l’expression des gènes. La plupart de nos connaissances du métabolisme de l’ARN pr

La dégradation de l’ARNm est un processus essentiel et fondamental pour le contrôle de l’expression génétique chez tous les organismes. Chez les bactéries, la dégradation de l’ARNm est le plus efficacement contrôlée à l’étape initiale du processus. Des études chez Escherichia coli et Bacillus subtil

Les variants d’histones sont des régulateurs épigénétiques majeurs de la transcription, de la réplication et de la réparation de l’ADN, et de la recombinaison. Leur déposition et éviction de sites spécifiques de la chromatine sont des processus fortement régulés qui sont médiés par des chaperonnes s

La transmission fidèle de l’information génétique aux cellules filles est un mécanisme biologique majeur dans le processus de prolifération cellulaire et repose sur la duplication exacte des chromosomes pendant la phase S du cycle cellulaire. Le génome des cellules humaines contient des séquences in

Les bactériophages tempérés sont des virus bactériens capables de s'intégrer dans le génome de leur hôte. La forme lysogène leur permet d'être transmis au cours des générations bactériennes sans avoir recours à un cycle lytique tant que les conditions de croissances de l'hôte restent clémentes. Les

Les cassures double brin de l’ADN (DSBs) sont parmi les lésions de l’ADN les plus dangereuses car une seule de ces cassures non réparée peut provoquer la mort cellulaire. En fonction du cycle cellulaire, ces cassures peuvent être réparées soit par ligature simple soit par recombinaison homologue, et

Chez les animaux, les tissus vieillissants accumulent des cellules sénescentes, processus considéré comme suppresseur de tumeur chez les jeunes, mais qui sous-tend la perte de la capacité régénérative des organes en fin de vie. L’inactivation de la télomérase est une cause majeure de la sénescence r

La plupart des processus cellulaires impliquent un grand nombre de protéines en interactions. Même lorsque ces processus sont très bien décrits au niveau de leurs acteurs moléculaires, leurs comportements dynamiques restent souvent méconnus. Malgré l'existence de méthodes expérimentales pour sonder

La synthèse des ribosomes chez les eucaryotes implique la transcription de l’ADN ribosomique (ADNr) par l’ARN polymérase I (Pol I) et l’assemblage du pré-ARN naissant (pré-ARNr) avec de nombreuses protéines ribosomiques et des facteurs d’assemblage et de maturation. Ces étapes précoces conduisent à

La transmission correcte du matériel génétique au cours des divisions cellulaires est essentielle pour la survie de tous les organismes vivants. Une transmission anormale des chromosomes peut conduire à des anomalies irréversibles dans la structure et/ou le nombre de chromosomes, conduisant à l’appa

La régulation des profils d'expression de gènes au cours du développement et de la différenciation cellulaire joue un rôle important dans la définition de l'identité cellulaire. Beaucoup d'efforts ont été consacrés à comprendre comment les programmes de transcription spécifiques de cellules sont éta

La régulation de l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnel est un moyen efficace de moduler l’expression génétique dans tout le monde vivant. Les petits ARN régulateurs (sARN) jouent un rôle clé dans ce mode de régulation. Ils peuvent affecter directement la traduction et/ou la stabilit