Co-évolution des génomes bactériens et de leurs prophages: cooptation des prophages et conversion lysogenique chez Salmonella – Salmo_prophages

Les bactériophages tempérés sont des virus bactériens capables de s'intégrer dans le génome de leur hôte. La forme lysogène leur permet d'être transmis au cours des générations bactériennes sans avoir recours à un cycle lytique tant que les conditions de croissances de l'hôte restent clémentes. Les gènes d'origine prophagique contribuent à nombreux traits phénotypiques de l'hôte, en particulier ceux associés à la virulence chez de nombreux pathogènes humains mais également des traits adaptatifs qui contribuent au fitness de l'hôte dans certaines conditions de stress. Le projet Salmo_Prophages allie des approches de bioinformatiques et de génétique moléculaire afin de caractériser les effets de la lysogénie sur la physiologie du pathogène humain Salmonella enterica, en particulier au cours de l'infection. L'ensemble de ce projet permettra de mieux comprendre le rôle des phages tempérés dans le transfert horizontal de gènes ainsi que les mécanismes moléculaires associés à la cooptation de fonctions d'éléments génétiques mobiles. Ces thématiques sont implantées et reconnues comme des expertises majeures de notre consortium. Les aspects de dissémination de pouvoir pathogène et de coévolution des génomes présentent des perspectives de valorisation indéniables pour le diagnostic et le traitement des maladies infectieuses.