Les ARNs régulateurs et leur rôle dans la dégradation des ARNm chez Bacillus subtilis – BaRR

La régulation de l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnel est un moyen efficace de moduler l’expression génétique dans tout le monde vivant. Les petits ARN régulateurs (sARN) jouent un rôle clé dans ce mode de régulation. Ils peuvent affecter directement la traduction et/ou la stabilité des ARN messagers (ARNm). Les sARN ont fait l’objet de nombreuses études chez les bactéries à Gram-négatifs et chez quelques bactéries pathogènes à Gram-positifs comme le Staphylocoque doré (Staphylococcus aureus). Cependant, chez Bacillus subtilis, l’organisme modèle des bactéries à Gram-positifs, naturellement présente dans les sols, seul un petit nombre de sARN a été caractérisé jusqu’à maintenant et les mécanismes de régulation restent à élucider. Les précédentes études suggèrent pourtant que les sARN chez les firmicutes comme B. subtilis agissent différemment de ceux des bactéries à Gram-négatif. Par exemple, contrairement à Escherichia coli, la protéine Hfq n’est pas requise chez B. subtilis pour favoriser les interactions sARN-ARNm. De plus, il existe des différences majeures entre les machineries de dégradation des bactéries à Gram-négatifs et de celles à Gram-positifs. Notamment, la RNAse E qui est l’enzyme majeure impliquée dans la dégradation des ARNm après leur appariement avec un sARN chez E. coli est absente du génome de B. subtilis. Nous proposons de mesurer l’impact des petits ARNs sur la traduction et la dégradation des ARNm chez B. subtilis. Nous souhaitons également identifier les RNases impliquées dans ces mécanismes de dégradation. La seconde partie du projet sera dédiée à l’identification de partenaires impliqués dans les intéractions sARN-ARNm étant donné qu’aucune protéine avec une fonction similaire à Hfq n’a encore été identifiée chez B. subtilis. Ce projet a donc pour but de mieux comprendre les régulations post-transcriptionnelles par les sARN (RoxS, FsrA et CsfG) dans l’organisme modèle B. subtilis.