Projets financés
– ROSETTE
Ce projet se concentre sur un type d'adhérences cellulaires peu connues, mais qui jouent un rôle essentiel dans l'invasion cellulaire physiologique et pathologique des tissus cohésifs. Ces structures sont appelées podosomes dans les ostéoclastes et macrophages, et invadopodes dans les cellules métas
– RETID(Y)NA
Les changements de conformation de protéines jouent un rôle vital dans les processus biochimiques. Ils peuvent varier de mouvements locaux de faible amplitude pendant le transfert d?électron à des mouvements de domaine très étendus souvent rencontrés dans la catalyse enzymatique. Dans ce projet, des
Intégration de données hétérogènes pour la détermination de la structure de complexes macromoléculaires : application à TFIID. – Puzzle-fit
L?objectif du projet est de développer des outils bioinformatiques pour intégrer des données expérimentales et bioinformatiques hétérogènes dans la reconstruction tri-dimensionnelle de complexes multi-protéiques. Le projet est centré sur le facteur de transcription TFIID comme paradigme d?un assembl
Développement et validation d?une chimiothèque focalisée enrichie en inhibiteurs d?interactions protéine-protéine via des approches in silico et in vitro – PPIFocusDb
Les interactions protéine-protéine (PPIs) sont essentielles à la plupart des processus cellulaires. Les PPIs aberrantes sont responsables de la plupart de maladies recensées et font donc de ce type de système une classe de cibles encore peu explorée mais ayant un fort potentiel pour l?innovation thé
– NanoLife@Work
L?étude fonctionnelle et structurale des machines macromoléculaires est une tâche difficile compte tenu de la dimension des objets étudiés, de leur flexibilité et de la complexité des substrats manipulés (protéines, peptides, ADN, ARN ?). Ces études nécessitent la combinaison de la cristallographie
Microscopie des Intermédiaires de Réplication et Recombinaison – MIRR
Au cours de la synthèse d?ADN, la progression des fourches de réplication peut être compromise par des barrières de réplication (RFBs) qui résultent de situations variées (dommages de l?ADN, présences de complexes protéines/ADN, structures secondaires de l?ADN?). Selon la natures du blocage, de nomb
Signalisation transmembranaire des récepteurs métabotropiques du glutamate – mGluNano
Les récepteurs métabotropiques du glutamate (mGluR) appartiennent à la Classe C des récepteurs couplés aux protéines G (GPCR). Ils sont activés par le glutamate, le principal neurotransmetteur inhibiteur du système nerveux central. Les 8 récepteurs mGlu (mGluR1 à mGluR8) sont exprimés dans des régio
Induction Mécanique des Gènes Tumoraux dans le Cancer du Colon et dans l’Hepato-Carcinome – MECHANO-CANCER
Notre appréhension de la morphogenèse et de l?homéostasie des tissus multi-cellulaires est actuellement réactualisée par un nombre croissant d?évidences montrant l?implication d?une interaction réciproque « mécano-sensible » entre l?état mécanique du tissu et l?état d?expression du génome. Bien que
– MASDA-EYE
L?imagerie par spectrométrie de masse (ISM) est une technologie émergente qui permet d?accéder avec une grande sensibilité et un haut débit à la complexité moléculaire du tissu sain ou malade. Comparée à l?immunocytochimie classique, souvent limitée par la spécificité des anticorps et le nombre d?an
– InterGame
Malgré la baisse actuelle de la fertilité humaine, la recherche visant à comprendre le processus de fécondation est peu développée. Les mécanismes moléculaires et membranaires impliqués dans ce processus sont mal compris en partie parceque les approches biologiques classiques sont difficilement adap
– ICCR
A l?aide de protéines existantes, il est possible de créer des objets biologiques possédant de nouvelles propriétés. Notre publication récente (Moreau et al., 2008, Nature Nanotech. 3:620-625) a présenté le concept de Récepteurs Couplés à un Canal Ionique (Ion-Channel Coupled Receptors ou ICCR), qui
Structure et fonction du complexe IFNg/héparane sulfate pour l'ingénierie d'un glyconjugué de synthèse pour inhiber la cytokine – HEPAFERON
Les cytokines sont de petites protéines, qui, après avoir été sécrétées, diffusent dans les tissus pour stimuler l?activation, la prolifération, la différentiation des cellules? et constituent ainsi un système de communication cellulaire. De nombreux travaux ont démontré que la plupart des cytokines
Régulation du fonctionnement des RCPG : hétéro-oligomérisation et organisation dynamique des récepteurs dans la membrane – GPCR D-I-F
Le mécanisme de signalisation des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) a été largement révisité, notamment parce qu?il a été montré que les récepteurs pouvaient former des homo- ou des hétéromères. De plus, la notion de RCPGs fonctionnant au sein d?un complexe multiprotéique spécifique ou ?sign
– DELTAV
Définir les déterminants physico-chimiques de la stabilité et du repliement des protéines dans des conditions normales et pathologiques a constitué un domaine de recherches important en biochimie physique depuis plus d?un demi-siècle. Et, malgré les progrès importants vers ce but, un nombre de quest
Pontage covalent « clickable » optimisé pour la spectrométrie de masse, application à l’analyse structurale des pili de type IV de Neisseria meningitidis – CLICKMASSLINK
Sonder l?organisation des protéines et de leurs interactions dans un système vivant est indispensable à la compréhension du rôle de ces protéines in vivo. Chez de nombreux pathogènes, dont N. meningitidis, la virulence dépend essentiellement de l?expression d?organelles filamenteuses que sont les pi
Microscopie électrochimique à Nanocavité pour l’imagerie fonctionnelle de cascades enzymatiques. – CASCADE
Ce projet propose de développer : (i) un système biomimétique reproduisant les cascades enzymatiques naturelles, en mettant au point une stratégie expérimentale d?assemblage d?enzymes en 2D d?une façon spatialement contrôlé à l?échelle nanométrique. (ii) Une microscopie électrochimique et à force at
– CALCOMED
Le vieillissement de la population engendre un nombre croissant de cas d?ostéoporose et d?athropathies dégénératives. L?activité sportive pratiquée par le plus grand nombre est à l?origine de traumatismes articulaires en nombre grandissant. La recherche dans le domaine de l'ingénierie tissulaire est
Chimiokines adhésives: structure moléculaire, imagerie cellulaire et outils thérapeutiques – Adhékines
Les chimiokines sont des cytokines chimiotactiques solubles exprimées par de nombreux types cellulaires. Il y a deux exceptions, CX3CL1 et CXCL16, qui sont produites sous forme membranaire. Ainsi, elles possèdent, avec leurs récepteurs respectifs, le CX3CR1 et le CXCR6, une propriété inattendue de m
Additifs supramoléculaires de cristallisation des transporteurs ABC de résistance à de multiples agents chimiothérapeutiques – AddX
Une approche de ?drug-design? d?inhibiteurs hautement efficaces et sélectifs utilisables en thérapie nécessite la connaissance des protéines ciblées au niveau atomique, si possible dans différentes conformations reliées aux différentes étapes catalytiques d?un processus donné. Cette tâche est partic
Force associée à la polymérisation d’actine. Aspects biochimiques et mécaniques. – ACTIMAG
L?évolution dynamique des filaments et des réseaux d?actine est un processus biologique fondamental impliqué dans de nombreuses fonctions cellulaires. La propriété fonctionnelle pertinente de l?actine est sa capacité d?autoassemblage via une réaction unique associée à l?hydrolyse de l?ATP. Le coupla
Migration cellulaire en milieu confiné – MICEMICO
La capacité à migrer dans un espace restreint est essentielle pour la fonction des leucocytes, les principales cellules du système immunitaire. De plus, ce type de migration peut être adopté par les cellules tumorales les plus agressives et contribuer à leur capacité à envahir des tissus saints. Nou
Propriétés physiques locales du biofilm et leur rôle dans la dynamique interne de l'édifice sondé par des micro-colloïdes magnétiques insérés. – DynaBiofilm
Les biofilms sont des assemblages bactériens associés aux surfaces qu?elles soient biologiques ou artificielles. Ils se forment par des mécanismes d?adhésion-croissance couplés à la production de polysaccharides extracellulaires qui probablement à la fois protègent et stabilisent l?édifice formé par
– CONE
La compréhension des mécanismes d'orientation des cellules vivantes est essentielle tant d?un point de vue fondamental qu?appliqué. La plupart des modèles d'orientation cellulaire portent sur des stimulations directionnelles simples, en espace et en temps. En pratique, les stimulations auxquelles le
– Chromodyn
L?organisation spatiale des gènes et chromosomes au sein des noyaux de cellules eucaryotes n?est pas aléatoire et joue un rôle important dans l?expression génique, le maintien de l?intégrité du génome et sa réplication. Malgré son importance, cette organisation dynamique reste encore très mal connue
Conception d'un microsystème basé sur des sondes électrochimiques ultra-sensibles pour une multi-détection sans marquage d'acides nucléiques: application au génotypage HCV – VirProbe
Le projet concerne la conception d'une plateforme de diagnostic miniaturisée (microsystème) innovante permettant le génotypage rapide du virus de l'hépatite C (HCV). Avec 170 millions de personnes infectées dans le monde dont 600 000 en France, HCV constitue un problème majeur de santé publique. L'i
Lésions oxydatives tandem de l’ADN, formation réparation et mutagénèse – TODNAL
Les dommages de l'ADN sont continuellement créés au sein du génome par le stress oxydant qui est impliqué ou associé à de nombreuses pathologies humaines. Les espèces réactives de l?oxygène produites peuvent endommager les constituants cellulaires et notamment l?ADN dont l?intégrité est nécessaire a
– STR-ASS-DEF-COL
Le système immunitaire a développé des composantes innée et adaptative qui coopèrent pour la protection de l?hôte contre les infections microbiennes. L?immunité innée met en jeu des molécules de reconnaissance constitutives capables d?identifier les signaux de danger et de déclencher des mécanismes
Bases moléculaires de la régulation de l'activité de Deubiquitination des histones – HISTONEDUB
Les modifications post-traductionnelles des histones sont cruciales pour la régulation de la transcription chez les eucaryotes. La vision émergente actuelle est que les défauts dans ces mécanismes cellulaires aboutissent à différentes maladies, y compris le cancer. Plusieurs modifications des histon
– PAGDEG
Dans ce projet, nous proposons de développer des approches pluridisciplinaires concernant le vieillissement et la mort cellulaire (induite par antibiotiques) chez Escherichia coli. Il s?agit en effet non seulement de l?être vivant le mieux connu, mais aussi du modèle expérimental le plus simple de v
– NANOCHEMCELL
Le contexte général du projet est le développement de méthodes d?imagerie chimique avancées afin de comprendre des processus biologiques complexes, tels que les réactions chimiques au sein des neurones dopaminergiques. Le projet est basé sur l?imagerie chimique multimodale de la cellule avec des tec
– Moonlight
Certaines protéines assurent plusieurs fonctions différentes dans la cellule. Ces protéines multifonctionnelles sont appelées collectivement 'moonlighting' protéines. Ceci fait référence à l'anglicisme désignant le fait d'avoir un deuxième emploi au noir. Parce que la fonction des protéines est pri