Projets financés
Cartographie spatiale, temporelle, structurale et fonctionnelle du kinome des virus géants et de l'hôte pour l'infection – PHOSPHO-gi-RUS
Nommés en raison de leur taille de l'ordre du micromètre et de leur énorme complexité génomique, les virus géants (ou girus) représentent une classe de virus biologiquement uniques récemment découverts, et ayant co-évolué avec leurs hôtes pour occuper presque tous les écosystèmes terrestres et aquat
Démarrage de la traduction avec des ARN messagers sans leaders – LmRNA
LmRNA concerne l’étude d’un processus cellulaire essentiel, la traduction des ARN messagers en protéines par les ribosomes. Les manuels décrivent les mécanismes canoniques de démarrage de la traduction : le cas bactérien, où l'ARNm porte dans sa région 5’ non traduite une séquence Shine-Dalgarno (SD
Stockage des stérylesters dans les gouttelettes lipidiques : mécanismes et hOMéostasie – SELDOM
Dans les systèmes vivants, le stockage rapide des lipides dans des organites spécialisés, appelés gouttelettes lipidiques (LD), est crucial pour garantir l'homéostasie cellulaire. Le stockage des lipides nécessite généralement une estérification et produit des lipides neutres (apolaires) (NL). Il pe
Élucider les mécanismes moléculaires d'action de PilC/PilY1, un acteur clé de la biologie des pili de type 4 présent au sommet des pili chez des centaines d'espèces bactériennes – T4Ptip
Les pili de type 4 (PT4) sont des pili uniques car ils sont (1) le seul type de pilus universellement présent chez les bactéries et les archées, et (2) exceptionnellement polyvalents, étant impliqués dans l'adhésion, la motilité, l'absorption d'ADN, l'agrégation et la mécanodétection. Les PT4a – le
Analyse de l'expansion du peptidoglycane chez les bactéries à Gram positif par combinaison de la spectrométrie de masse et de la microscopie à haute résolution – MAPEX
Le projet MAPEX vise à mieux comprendre les mécanismes moléculaires d’assemblage du peptidoglycane et de sa cinétique d’expansion au cours du cycle cellulaire. Le peptidoglycane (PG) est une molécule géante à structure réticulée composée de chaînes glycanes pontées par des tiges peptidiques. Malgré
Organisation nanoscopique de la matrice extracellulaire neuronale et impact sur la dynamique des récepteurs aux neurotransmetteurs – nanoMATRIX
Les neurones, comme virtuellement toutes les cellules de l’organisme, sont couverts d’un réseau complexe et dynamique de glycoprotéines de la matrice extracellulaire (MEC). Des composants de la MEC recouvrent une importante fraction de la surface des neurones qui n’est pas couverte par les connectio
Stratégies innovantes pour étudier la dynamique des protéines par des spectroscopies de résonance magnétique – SpINtein
L'étude de la dynamique structurelle et des transitions conformationnelles permet de relier les structures atomiques des protéines à leurs fonctions cellulaires. Les techniques de Site Directed Spin Labelling couplées aux spectroscopies de résonance magnétique se sont révélées être des méthodes vala
Cibler La Poly-Adénosine Polymérase De Cryptosporidium hominis Comme Nouvelle Approche Thérapeutique Pour Traiter Les Maladies Gastro-intestinales Sévères – CryptoTarget
Les parasites apicomplexes représentent un problème de santé publique, non seulement en raison de la rareté des traitements thérapeutiques efficaces, mais aussi à cause de l'émergence de résistances dans certaines régions du monde. Parmi ces agents pathogènes, le Cryptosporidium provoque des diarrhé
Caractérisation structurale et fonctionnelle d'oligomères de la vinculine induits par la protéine IpaA de Shigella – VITAL
La vinculine joue un rôle essentiel dans l'adhérence cellulaire en renforçant l'ancrage des récepteurs intégrines au cytosquelette d’actine pendant la mécanotransduction. Shigella, l'agent de la dysenterie bacillaire, cible la vinculine par l’intermédiaire de l'effecteur IpaA durant l'invasion des c
Jumeaux fraternels : les domaines cytosoliques liés à la membrane de la glycoprotéine Gn et le facteur de virulence NSm du CCHFV – CCHFV-NMR
La recherche sur les virus est souvent menée dans l'urgence, passant d'une méconnaissance quasi totale d'un virus à sa compréhension la plus rapide possible. Pour améliorer notre degré de préparation, l'OMS a établi une liste de dix agents pathogènes pour lesquels la recherche devrait être prioritai
Enquêtes structurelles et fonctionnelles sur le mécanisme moteur Dynein – DynLink
La protéine motrice dynéine participe au transport le long des microtubules dans les cellules eucaryotes. Ses cargos incluent des ARNm ainsi que des organelles. La dynéine exerce également des fonctions essentielles au cours de la mitose, où elle participe à l’alignement du fuseau mitotique. Par ail
Analyse structurale du complexe ribonucléoprotéique FemXAB-NPtRNAsGly de Staphylococcus aureus, essentiel à la synthèse du peptidoglycane et contribuant à la résistance à la méthicilline – SatRNAsPG
Staphylococcus aureus relies on three Fem proteins to synthesize the pentaglycine bridges (Gly5) within its peptidoglycan (PG), a fundamental and specific component of the bacterial cell wall. Our major aim is to understand the molecular mechanisms that underlie the specificity of Fem proteins in re
structure et fonction du co-activateur humain TIP60/p400 – C-TIP60
Notre objectif est de comprendre le rôle, l'organisation structurale et le mécanisme d’action du facteur TIP60c humain impliqué dans la régulation de la transcription et dans la réparation des cassures double brin d'ADN. Ce co-activateur transcriptionnel fait le lien entre les voies de signalisation
Une approche d'interactomique intégrative pour déterminer les mécanismes à la base de la pathogénicité des mutants de CASK impliqués dans des troubles du neurodéveloppement – CASKINT
Les interactions protéine-protéine (IPP) sont au cœur du fonctionnement cellulaire normal et pathologique. Différentes méthodes d’interactomique existent, chacune avec ses avantages et ses inconvénients. Dans ce projet nous exploiterons la complémentarité de la purification par affinité suivie d’ana
Étude structure-fonction de l'export d'ARN médiée par le complexe de liaison à la coiffe nucléaire – CBC
La transcription eucaryote produit de grandes quantités d'ARN, dont une partie est maturée et exportée vers le cytoplasme, tandis que des ARNs aberrants sont éliminés dans le noyau. Le complexe nucléaire de liaison à la coiffe (CBC) joue un rôle central dans ces processus. Au début de la transcripti
Détermination des bases moléculaires de l'appareil réplicatif des Archées – ARCHAREP
La capacité des cellules à répliquer des millions de paires de bases d'ADN à chaque division est une fonction biologique essentielle. Tous les êtres vivants, bactéries, eucaryotes et archées effectuent une réplication de l'ADN semi-conservatrice. La réplication de l'ADN est effectuée par des machine
Comprendre les réseaux de protéines médiés par DivIVA, au cœur du cycle cellulaire chez les bactéries à Gram positif. – Divinet
La division et croissance cellulaires bactériennes sont des processus fondamentaux pour la survie et la prolifération des bactéries. Ce projet se focalise sur DivIVA, une protéine clé du cycle cellulaire dans deux importantes familles: les Corynebacteriales et Streptococcaceae. Les protéines DivIVA
L'homéostasie du cholesterol par son esterification – CHOLESTORAGE
Le cholestérol est un composant vital des membranes cellulaires, assurant leur intégrité structurelle et influençant leur fluidité à travers des structures telles que les radeaux lipidiques. Au-delà de son rôle structurel, le cholestérol agit comme un précurseur de molécules essentielles telles que
Caractérisation structurale et fonctionnelle des nanodomaines protéines-lipides de la plateforme d'assemblage du RSV. – RSVMlipo
Le virus respiratoire syncytial (VRS) est un agent pathogène majeur chez les nourrissons et la principale cause de bronchiolite infantile et de pneumonie virale dans le monde. Il s'agit également d'un pathogène majeur, mais souvent non diagnostiqué, chez les personnes âgées fragiles, contribuant à l
Nanoscopie quantitative à température cryogénique. – CryoQN
Le passage à température cryogénique est une étape clé dans l’évolution de la microscopie de fluorescence à super-résolution, afin de surmonter les artefacts résultant de la fixation chimique et de faciliter les études cryo-corrélatives. Pourtant, malgré des progrès significatifs ces dernières année
Déchiffrer le rôle de la SUMOylation d'Arf6 dans l'endocytose et la dynamique membranaire – ENDOARF
Arf6 est une petite protéine G impliquée dans le transport intracellulaire, notamment dans les processus d’endocytose et de recyclage de récepteurs membranaires, ainsi que dans la mise en place de la polarité épithéliale. Pourtant, les mécanismes moléculaires qui engagent et contrôlent Arf6 dans ces
Révéler les structures natives qui sous-tendent le transport des spermatozoïdes dans les plantes – SC-Delivery
L'endosperme des céréales est, d'un point de vue calorique, le principal contributeur à la nutrition humaine. La formation de l'endosperme chez les plantes angiospermes dépend de la livraison par le pollen de deux spermatozoïdes (CS) au gamétophyte femelle. Les CS fécondent alors la cellule centrale
Caractérisation structurale et dynamique d’un canal à potassium (Kir) fonctionnel et dysfonctionnel – KirFlex
Les cellules utilisent la régulation allostérique comme mécanisme fondamental pour contrôler des processus critiques au niveau moléculaire. Les approches in silico de simulation moléculaire permettent des analyses détaillées et comparatives de la régulation allostérique, surtout lorsqu'elles sont as
Le couplage de la transcription et de la traduction – TTCoup
L'expression des gènes permet aux organismes de se maintenir, de se développer et de s'adapter à leurs environnements. Les structures de l'ARN polymérase (ARNP) d’une part, et du ribosome d’autre part ont transformé notre compréhension mécanistique de ces acteurs clés de l'expression des gènes et on
Pores membranaires de coronavirus – MemPoco
Pendant l'infection, les coronaviruses remanient les membranes du réticulum endoplasmique (ER) afin de générer des vesicules double membranaires (DMVs) pour héberger les complexes réplicatives et l'ARN virale. Une étude récente a identifié un pore trans-membranaire traversent les deux membranes du D
imagerie quantitative de la thermodynamique des phases dans les cellules grâce à la microscopie Brillouin – ALICE
Les condensats biomoléculaires (biocondensats) sont des structures sans membrane qui contribuent à des fonctions biologiques essentielles grâce à leur capacité à concentrer sélectivement les molécules. La plupart du temps, la formation des biocondensats est réversible, mais des transitions liquide-s
Mechanism moléculaire et dépendance du contexte cellulaire de la formation d'amyloïde par une expansion génétique de la périlipine 4 – PlinAmylo
De nombreuses maladies dégénératives sont liées au mauvais repliement de protéines et au dépôt d'amyloïdes dans les tissus affectés. Nous (Copic) avons montré que la protéine PLIN4 se lie de manière spécifique et stable à la surface des gouttelettes lipidiques (LD), organelles essentielles au mainti
Structure et régulation d'ADGRV1, un récepteur couplé aux protéines G impliqué dans l'audition – AudioGPCR
Le syndrome humain USHER 2 (USH2) est la plus fréquente cause génétique de surdité et de cécité combinées. Associées à cette maladie, deux grandes protéines transmembranaires, l’usherin et le récepteur couplé aux protéines G ADGRV1, ainsi que les protéines cytoplasmiques whirlin et PDZD7 forment le
Fonction des domaines proches de la membrane de la protéine Spike du SARS-CoV-2 dans la fusion membranaire – FUMESPIME
L'infection cellulaire par le SARS-CoV-2 commence par la fusion de son enveloppe lipidique avec la membrane de la cellule hôte, un processus médié par la protéine Spike (S) de la membrane virale. La protéine S est composée de deux sous-unités : S1, responsable de la liaison avec la cellule hôte, et
Technologies innovantes pour étudier la coordination des dynamiques conformationnelles de récepteurs membranaires sur molécules uniques – CoCoDy
Les cellules communiquent avec leur environnement à travers des récepteurs membranaires qui détectent les stimuli extracellulaires et transmettent à l'intérieur de la cellule. La transmission d'informations à travers la membrane implique des réarrangements structurels qui se propagent de manière all
Élucider les mécanismes moléculaires du récepteur intestinal Guanylyl Cyclase C – InteReSt
Le récepteur humain Guanylyl Cyclase C (GC-C) régule l'homéostasie intestinale. Son dérèglement entraîne de nombreuses maladies gastro-intestinales telles que l'iléus méconial, des syndromes diarrhéiques chroniques ou le cancer colorectal (deuxième cancer le plus mortel au monde). GC-C est hyperacti