structure et fonction du co-activateur humain TIP60/p400 – C-TIP60
Notre objectif est de comprendre le rôle, l'organisation structurale et le mécanisme d’action du facteur TIP60c humain impliqué dans la régulation de la transcription et dans la réparation des cassures double brin d'ADN. Ce co-activateur transcriptionnel fait le lien entre les voies de signalisation cellulaire, la structure de la chromatine et les modifications épigénétiques pour favoriser l'initiation de la transcription. TIP60c est recruté aux promoteurs des gènes par des activateurs de transcription et favorise la transcription en acétylant les histones sur des résidus lysine spécifiques ainsi qu’un ensemble de protéines non-histones par des mécanismes de reconnaissance mal connus. TIP60c comporte une fonction de remodelage de la chromatine (EP400) qui incorpore le variant d'histone H2A.Z dans les nucléosomes flanquant les promoteurs de gènes. TIP60c est donc au cœur de la régulation épigénétique et agit positivement sur la transcription de l'ADN, mais aussi sur la réparation des cassures double brin de l'ADN. L'organisation structurale du complexe humain, les liens entre les activités d'acétylation et d'échange d'histones, le mécanisme moléculaire de la réaction d'échange d'histones et le mode de recrutement de TIP60c à des loci nucléaires spécifiques sont actuellement mal connus. En combinant nos expertises en biochimie, biologie structurale, chimie biologique et ingénierie cellulaire, nous visons à (i) déterminer la structure de TIP60c en cryo-microscopie électronique, (ii) comprendre l'interaction du module d'acétyltransférase d'histone avec des cibles histones et non-histones, (iii) étudier le recrutement de TIP60c aux promoteurs de gènes par les activateurs, (iv) décrire l'interaction de TIP60c avec le complexe Mre11-Rad50-Nbs1 qui cible le co-activateur aux sites de cassures double-brin, et (v) explorer le mécanisme moléculaire d'échange de la paire d'histones H2A/H2B contre un dimère H2A.Z/H2B.
Coordination du projet
Adam Ben-Shem (Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (UM 41 - UMR 7104 - UMR_S 1258))
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Partenariat
IGBMC Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (UM 41 - UMR 7104 - UMR_S 1258)
BSC Université Strasbourg
StrInG Muséum National d'Histoire Naturelle Paris
IGBMC Centre Européen de Recherche en Biologie et en Médecine
Aide de l'ANR 838 509 euros
Début et durée du projet scientifique :
septembre 2024
- 42 Mois