Projets financés
Le fonctionnement hydraulique des plantes face au changement climatique – PHYDRAUCC
La concentration atmosphérique de CO2 ([CO2]) a augmenté de près de 45% depuis 1750, atteignant son plus haut niveau depuis au moins 800 000 ans, et va continuer à augmenter dans les prochaines décennies, impliquant une augmentation des températures et une modification du cycle hydrologique. Ainsi,
Combiner intelligence artificielle et ADN environnemental pour prédire les changements d'aire de répartition des poissons marins face changement global – SHIFTeDNA
Le réchauffement atmosphérique et océanique s'accélère aujourd'hui à un rythme sans précédent avec des conséquences sur la biodiversité et en particulier le déplacement de l’aire de distribution géographique de certaines espèces. Les poissons, ectothermes marins, sont particulièrement sensibles à ce
Explorer l'étendue, les voies et le devenir des transferts horizontaux dans les génomes nucléaires des plantes – EXOTICA
Les transferts horizontaux (THs) sont le mouvement du matériel génétique entre des espèces distantes par des mécanismes autres que la reproduction sexuelle. Chez les procaryotes, les THs sont bien connus pour être une source de nouveaux traits adaptatifs, comme la dissémination de gènes impliqués da
Les nageurs éphémères des parasites marins – EPHEMER
La survie de parasites planctoniques marins ubiquistes dépend uniquement des capacités de ses stades libres flagellés et unicellulaires, des zoospores, à trouver et à infecter spécifiquement ses hôtes parmi une communauté microbienne complexe et dans un temps très court (quelques heures à quelques j
Les composés organo-halogénés volatils sont toxiques pour les organismes vivants et contribuent à la destruction de l'ozone stratosphérique. Les mers et les océans sont des sources importantes de ces composés, notamment d’halométhanes, produits en grande quantité par les micro-organismes et les algu
Evolution des génomes chez les Décapodes – GEODE
Les décapodes sont un ordre très diversifié de crustacés, comprenant plus de 15 000 espèces vivantes dont les écrevisses, homards, crabes et crevettes. Parmi les décapodes, les écrevisses sont des espèces clés des écosystèmes aquatiques avec un fort impact sur la biodiversité de leur habitat. En dép
Impact de la crise séismo-volcanique sur le lac de cratère thalassohalin Dziani Dzaha, Mayotte – SUBSILAKE
Depuis 2018, la naissance d’un volcan sous-marin 50 km à l’Est de l’archipel de Mayotte cause de nombreux tremblements de terre et une subsidence accrue des îles. Sur Petite-Terre, deuxième île de l’archipel par sa taille, se trouve le Dziani Dzaha, un lac de cratère thalassohalin. Suite à la crise
Interactions phytoplankton-virus: des bases moléculaires de la résistance aux virus à leurs dynamiques éco-évolutives – PHYTOMICS
La moitié de la photosynthèse planétaire est due à des espèces phytoplanctoniques régulées par de nombreux virus. Parmi eux, les virus à ADN double brins, des phycoDNAvirus, sont ubiquistes et des régulateurs clés des Mamiellophyceae, des algues unicellulaires eukariotes dominant les eaux côtières.
Diversité et rôle du pathobiome dans l'infection par un protiste parasite et invasif dans les populations de palourdes – PANIC
De récentes études ont mis en évidence une impressionnante augmentation de la circulation des agents infectieux avec l'émergence d'épizooties, zoonoses et épidémies notamment via l'introduction d'espèces exotiques combinée aux changements climatiques. Par exemple, le parasite marin micro-eucaryote P
ETUDE DE LA BIODIVERSITE, DE L'ECOLOGIE ET DE L'EVOLUTION DE LA SYMBIOSE MAGNETOTACTIQUE – SymbioMAGNET
La symbiose et le mutualisme sont des moteurs de diversification du vivant et sources d’innovation biologique dans le monde microbien. Récemment, des assemblages magnétotactiques composés d’un protiste flagellé et de bactéries ectosymbiotiques biominéralisant des cristaux magnétiques ont été découve
Il est largement admis que les changements climatiques (CC) influencent profondément la biodiversité, et prévoir les conséquences de ces changements sur les espèces et leurs écosystèmes est un défi majeur pour les écologistes. La plupart des études se sont concentrées sur les effets du CC sur la phé
Etudier l'évolution du cycle de vie des vers de farine pour optimiser sa production industrielle – OPTIM-INSECT
Le ver de farine Tenebrio molitor est une source alternative de protéines prometteuse pour l’alimentation. L'optimisation de sa production à l'échelle industrielle nécessite une meilleure connaissance de l'évolution de ses principaux traits du cycle biologique et de leurs compromis. Le taux de crois
Diversification adaptative des orchidées mouches comme modèle pour étudier la spéciation écologique et les radiations adaptatives – DiversiFly
Développer une recherche intégrative permettant d’élucider à la fois les liens entre génotypes, phénotypes et fitness et les bases génomiques de la variation constitue un défi majeur dans notre compréhension de la spéciation et de l’émergence de la biodiversité. Avec DiversiFly, je propose de mettre
Croissance des micro-algues à très faibles lumières sous la banquise arctique à la sortie de la nuit polaire, et rôle dans l'inoculation du bloom printanier – Dim
Dans l’océan Arctique, les micro-algues sont soumises à des variations saisonnières extrêmes d’éclairement, de la nuit polaire sous la banquise au soleil de minuit en eaux libres de glace. Nous avons récemment découvert qu’elles pouvaient croitre à de très faibles éclairements dès la sortie de la nu
Plongée dans le monde chimique des cétacés – DICWOC
La chémoréception est impliquée dans de nombreuses fonctions biologiques chez les mammifères terrestres. Cependant, chez les mammifères marins, et plus particulièrement les cétacés, les capacités olfactives et gustatives demeurent largement méconnues. Notre projet vise à explorer pour la première fo
Dynamique des communautés autour des bactéries Fe-oxydantes dans les tapis microbiens riches en fer : Adaptation aux variations environnementales
En plus de fournir une description supplémentaire de l'activité et des habitats des FeOB marines, le projet IRONWOMAN élucidera les interactions et les dialogues métaboliques entre les microorganismes au sein de l'écosystème que sont les tapis riches en fer. A l'interface eau de mer/sédiments, les
Impact de l'invasion par le plathelminthe Obama nungara sur les communautés de vers de terre en France – PLATWORM
L'augmentation du commerce international au cours des dernières décennies, ainsi qu'un contrôle insuffisant du transport d'espèces exotiques, ont entraîné l'introduction accidentelle de nombreuses espèces animales et végétales. L'un des impacts écologiques les plus importants des espèces introduites
Plasticité des dents et implications pour l'inférence des intéractions trophiques des vertébrés autour de la limite Permo-Trias – PLASTICiTEETH
La vie animale a failli disparaitre à la limite Permien-Trias (PTB), il y a environ 250 Ma. A l’époque de grandes quantités de CO2 furent relâchées dans l’atmosphère par les volcans de Sibérie, initiant ainsi une série de fluctuations spectaculaires du climat et de la chimie des océans qui durèrent
Caractérisation phylogénétique, écologique et physiologique de le pan-génome des algues Arctiques – PanArctica
L'océan Arctique se distingue de tous les autres océans en raison de son encerclement par les terres, de son environnement extrême et de son écosystème distinct, caractérisé par une forte succession saisonnière. Le changement climatique anthropique transforme rapidement l'océan Arctique en un habita
Elements transposables et adaptation aux environnements tempérés chez le moustique tigre Aedes albopictus – MosquiTEs
Le compréhension des mécanismes par lesquels les espèces et populations s'adaptent à de nouvelles conditions environnementales est un des objectifs de la biologie évolutive. Cette compréhension apparaît d'autant plus nécessaire dans le contexte actuel de changement climatique, qui déstabilise toutes
Si l’impact écologique de la crise des pollinisateurs reçoit une attention croissante, ses conséquences évolutives restent quant à elles peu étudiées et semblent plus délicates à prédire. En prenant comme modèle une espèce de plante à sexes séparés, le projet EvoPoD aspire à (i) caractériser l’effet
Sélection de bactéries endosymbiotiques par la plante-hôte – SELECT
Les organismes eucaryotes sont exposés à des communautés microbiennes complexes qui influencent leur santé, leur développement et leur évolution. Au cours de l’évolution, les eucaryotes ont ainsi acquis plusieurs types de mécanismes leur permettant de contrôler leurs interactions avec les micro-orga
Contexte en oxygène et origine relative des voies de biosynthèse des quinones – QUINEVOL
L’augmentation des niveaux de dioxygène sur Terre lors du « grand choc oxydatif » (GCO) a conduit au passage de conditions globalement réductrices à oxydantes et a bouleversé les processus bioénergétiques des microorganismes ancestraux. Au cœur de ces processus, les quinones, molécules quasi-ubiquit
Analyse multi-échelle de la variabilité temporelle passée et future de la connectivité des populations marines – PopNCo
Face aux risques croissants du changement global induit par les activités humaines sur la biodiversité et les ressources marines, connaître l’efficacité à long terme des stratégies de gestion actuelles est un défi majeur. PopNCo s'intéresse à la robustesse des estimations d’un paramètre clé considér
Effet des changements environnementaux passés sur la diversification des espèces et phénotypes – CHANGE
Le but de CHANGE est d’améliorer notre compréhension de l’effet des changements environnementaux passés sur les vitesses de diversification des espèces et de leurs phénotypes. Les modèles phylogénétiques utilisés pour tester ces effets ont des limitations majeures, telles que tester l’effet des vari
Résistance des oiseaux aux glycations: origines phylogénétiques et écologiques, mécanismes et liens avec la valeur sélective individuelle – AGEs
Explorer la biodiversité procure un moyen fondamental de comprendre comment l’évolution a développé des solutions pour répondre aux contraintes environnementales, parfois de manière contre-intuitive, et conduisant à une grande diversité des longévités. Les oiseaux sont hyperglycémiques mais longévif
La chimie de l’amour et de la guerre, et son rôle dans la diversification – SEXBOMB
Les études sur l'adaptation et la spéciation peuvent être utiles pour comprendre l’origine de la biodiversité, mais sont généralement biaisées car elles portent exclusivement sur des signaux visuels ou auditifs. Des études répliquées sur plusieurs traits adaptatifs et mode de communication sont esse
APEX vise à comprendre les mécanismes sous-jacents à l’effet de l’environnement sur les dynamiques de populations de prédateurs marins. Dans ce projet, je propose de développer une approche holistique intégrant la dynamique des proies au sein des relations environnement-prédateurs dans un des écosys
Dynamique temporelle, évolution et mécanismes de la plasticité transgénérationnelle dans un contexte proie-prédateur – TEATIME
Les changements globaux sont des défis face auxquels les organismes doivent s’adapter. La principale caractéristique de ces changements environnementaux est qu'ils se produisent plus rapidement et plus intensément que ceux probablement rencontrés par les organismes au cours de leur évolution. Il est
Evolution de la résistance à des systèmes naturels de gene drive – RESIST
Les génomes représentent des unités cohésives au sein desquelles la plupart des gènes coopèrent pour augmenter la valeur sélective des organismes, par des contributions positives sur la survie et la reproduction. Cette coopération est largement basée sur le fait que la plupart des gènes sont transmi
Traits des plantes et fonctionnement de l’écosystème aquatique en contexte de changement climatique – PONDS
Le changement climatique affecte particulièrement les zones humides et leurs communautés végétales. Il induit une augmentation de la température affectant directement, ou indirectement par la modification des interactions biotiques, les performances des espèces végétales. Le projet PONDS vise à déte
Compétition microbienne dans les interactions mutualistes chez les tiques – MICROM
La vie microbienne a une influence majeure sur l’évolution des macro-organismes: elle est essentielle à leur développement, leur immunité et leur nutrition. Ces interactions mutualistes ont facilité l'adaptation de grandes lignées d'eucaryotes à des milieux inhospitaliers, modifiant écosystèmes et b
Diversité, évolution et mode de vie du phylum Dependentiae au sein de leurs hôtes protistes – DEPEND
La majorité des taxons bactériens ne sont pas actuellement cultivables, formant ainsi la ‘matière noire microbienne’ (MDM), consortium dont l’écologie et la biologie restent méconnues. Les Dependentiae sont un phylum majeur de la MDM, distribués mondialement et détectés dans divers environnements. D
Le projet TRIDENT vise à développer un nouvel outil de modélisation basé sur les traits écologiques afin de prédire les effets des changements globaux sur la biodiversité marine et la dynamique des écosystèmes associés aux fonds marins côtiers. Il visera d'abord à caractériser la structure des inter
