Projets financés
Structure et fonction de la machine de transcription et réplication des virus à ARN non-segmenté de polarité négative – NNViPol
Notre projet vise (1) à déterminer la structure du complexe polymérasique des MNV, (2) à décortiquer les détails moléculaires des mécanismes d’action et de régulation de la machine complexe qui transcrit et réplique le génome des MNV et (3) à évaluer le potentiel du complexe N0-P comme cible pour in
Déterminants structuraux du canal à protons et de l’interface de dimérisation de la F1Fo-ATP synthase mitochondriale de levure. – F1Fo-Struct
L'ATP est la molécule énergétique universelle. La F1Fo-ATP synthase est une enzyme clé du métabolisme énergique puisqu'elle est responsable de la plupart de la synthèse cellulaire de l'ATP. Ce complexe de 600 kDa est composé, chez la levure, de 17 sous-unités distinctes. Il utilise l'énergie d'un gr
Caractérisation structurale et fonctionnelle des Sulfs humaines – SULF
Les héparanes sulfate (HS) sont des polysaccharides complexes présents en abondance à la surface des cellules et dans les matrices extra-cellulaires. De par leur positionnement stratégique à l’interface entre la cellule et son micro-environnement, et leur capacité à fixer et moduler l’activité d’un
Rôle du complexe SoSLIP/FMRP (Fragile X Mental Retardation Protein) dans la régulation de la traduction. – So-FragileX
i) Comprendre la régulation de l’expression de la Sod1 (dont l’ARNm contienne la structure SoSLIP) dans le cerveau pour avoir plus d’informations sur la physiopathologie du Syndrome de l’X Fragile ii) La recherche d’autres ARNm contenants des éléments SoSLIP ou SoSLIP-like qui va permettre de comp
Rôle des protéines de stress mitochondriales LEA et sHSP chez Arabidopsis – MITOZEN
Dans le contexte actuel de changement climatique, il est important de comprendre les mécanismes de la tolérance aux stress abiotiques des plantes pour développer des modèles et des stratégies de sélection et d'amélioration des cultures. Nous avons mis en évidence des adaptations spectaculaire des mi
Bases moléculaires de la structuration des macrodomaines dans le chromosome de E. coli et intégration dans le contrôle du cycle cellulaire – MolMac
La condensation du chromosome bactérien induit la formation d'une structure appelée nucléoïde. Des études récentes chez E. coli ont révélé une organisation à différents niveaux qui inclut notamment la condensation de grandes régions appelées macrodomaines (MDs). Quatre MDs (Ori, Right, Left et Ter)
Nouvelles voies de protéolyse chez les Archées – ARCHELYSE
La destruction ciblée des protéines par le système du protéasome régule directement de nombreuses fonctions biologiques, permet aux cellules de se débarrasser de protéines non fonctionnelles et participe à l'adaptation aux environnements extrêmes. Les dysfonctionnements du protéasome sont impliqués
Analyse structurale et fonctionnelle des mechanisms de deposition/echange de l’histone H2AZ. – VARIZOME
The genome is organized within cell in association with proteins to form chromatin that is controlling genome activity. Genome activity is influenced by past events that occurred during organism development and adult life thanks to epigenetic memory. When epigenetic memory fails, cells dysfunction,
Transcription et Maladies Génétiques – TransDis
Les propriétés d'une cellule sont déterminées par l'information codée par son génome. Comprendre comment cette information est gérée en fonction du type cellulaire et de l’état de différenciation est un défi majeur pour la biologie moléculaire moderne. En ce sens, notre travail s’est cristallisé sur
Analyse Structure/Fonction des Facteurs requis pour la Polyadénylation des ARNm chez la levure – SAFAPOLYA
La polyadénylation est un processus indispensable à la maturation des ARN messagers. Cette modification est couplée à la terminaison de la transcription par l'ARN polymérase II et permet aux ARNm d'être exportés du noyau de la cellule jusqu'au cytoplasme. La traduction de l'ARNm en protéine et la st
Structure, fonction et dynamique du facteur de transcription TFIIH – TFIIH-Complexes
Chez l’homme, la régulation de l'expression de gènes et le maintien de l'intégrité du génome implique des complexes multi-protéiques. L'initiation de la transcription par l’ARN polymérase II nécessite la mobilisation et l’activité corrélée de plus de 40 protéines, parmi lesquelles les 10 sous-unités
Utilisation sélective d'acides aminés aromatiques par les protéines à radical SAM. – SelArom
Les protéines à radical S-adénosyl-L-méthionine (SAM) sont des enzymes capables de catalyser des réactions complexes telles que l’insertion d’atomes de soufre, des cyclisations ou des méthylations particulières. La réduction par un électron d’un centre Fe4S4 conservé permet la coupure de la SAM prod
Etudes structurales et fonctionnelles des complexes multi-protéiques de la voie NHEJ humaine – NHEJ-complexes
Le premier objectif du projet ANR est de produire les sept protéines qui sont au cœur de la reconnaissance, de la maturation et de la re-ligature des deux extrémités d’ADN générées lors d’une cassure double-brin. Le second objectif majeur sera la caractérisation du mécanisme moléculaire de ces machi
Rôle des protéases FtsH du thylacoïde dans la biogenèse et la dégradation des protéines du chloroplaste dans l’organisme modèle photosynthétique Chlamydomonas reinhardtii – FtsH-Thyl-Chlamy
Malgré les efforts croissants de plusieurs équipes, notre connaissance du spectre des substrats et de l’importance physiologique des différentes protéases du thylacoïde reste très limitée. Le rôle des protéases FtsH du thylacoïde dans la biogenèse et la dégradation des protéines du chloroplaste sera
Nouvelle approche dans la lutte contre la résistance aux antibiotiques: reconstruction d'une pompe d'efflux à trois composants – ASSEMBLY
Après plusieurs décennies de succès dans la lutte contre les infections bactériennes, nous devons faire face à une menace croissante: l'évolution accélérée du phénomène de résistance aux antibiotiques, et l'absence de découverte de nouvelles familles d'antibiotiques. Il est donc urgent de développer
Specificités et complexicité des voies d’acquisition du fer chez Pseudomonas aeruginosa. – IronPath
Avec IronPath, nous proposons de nous intéresser à d’autres aspects de ce transport impliquant plutôt des protéines de membrane interne, plus difficiles à manipuler que les protéines de membrane externe. Notre équipe a ces derniers mois identifié un complexe de 4 protéines de membrane interne, FpvGH
Assemblage des proteines dans des membranes de tissus sains et pathologiques par Microscopie à Force Atomique – AFM-2-BioMed
-Define membrane protein imaging conditions and experimental setups -Develop and use laser micro-dissection for lens mRNA measure -Atomic force microscopy imaging of the +cAMP conformation of Mlok1 -Atomic force microscopy imaging of clathrin (preliminary) -High-speed Atomic force microscopy imag
Catabolisme oxidatif et activité hormonale de dérivés de l’acide jasmonique – JASMON'OX
Les régulations hormonales régissent le développement des plantes et leur adaptation à l’ environnement. L’acide jasmonique (AJ), de structure proche de celles de prostaglandines animales, est une pro-hormone jouant des rôles importants dans le développement des plantes ainsi que dans le déploiement
Caractérisation structurale et fonctionnelle des protéines ESCRT-III-like de Metallospherae sedula – ESCRT-ARC
Les différents objectifs du projet dont les enjeux sont indiqués ci-dessus sont : 1- Structure cristallographique de CdvB (ESCRT-III-like) et/ou de ce 2- Bases structurales de la poymérisation de CdvB 3- Structure cristallographique de CdvC (AAA-ATPase) et caractérisation de l’interaction ave
Analyse structure-fonction de senseurs de pathogène fixant des composés de tumeurs de plante – sensor
Ce projet multidisciplinaire propose de résoudre la structure de quatre periplasmique binding proteins (Atu2422, OccJ, NocT et AccA) du pathogène de plante A. tumefaciens en plus d'expériences génomique et «sur plante« pour comprendre leur fonction et régulation. Structures de Atu4344 avec et sans G
Le cycle structural des kinésines: l’interaction kinésine-tubuline à résolution atomique en relation avec l’état nucléotidique. – (Kines-Tubul-DARP)-in
Les moteurs moléculaires associés au cytosquelette sont ubiquitaires chez les eucaryotes. Ils sont impliqués aussi bien dans le transport intracellulaire que dans la mitose. Ils utilisent l’énergie produite par l’hydrolyse de l’ATP pour se déplacer le long des filaments d’actine, pour ce qui est des
Mécanisme et dynamique de la photoréparation de l'ADN par la photolyase (6-4) – (6-4)PhotoMec
La réparation des lésions de l'ADN induites par les UV est cruciale pour la survie. Les deux lésions UV les plus fréquentes sont le dimère cyclobutane de pyrimidines (CPD) et le photoproduit pyrimidine(6-4)pyrimidone (6-4PP). Pour les réparer, la Nature a développé des enzymes spécifiques, utilisant
Synthèse et évaluation cellulaire de ligands spécifiques de G-quadruplexes dérivés de porphyrines et salens – QUARPDIEMS
Si les structures de G-quadruplex ont bien été bien étudiés in vitro, leurs conditions de formation in vivo restent mal connues. Nous souhaitons atteindre un niveau élevé de spécificité pour des conformations particulières. Une telle discrimination, tandis que hautement souhaitable, semble plus diff
Etude du rôle de la terminaison de la transcription dans le contrôle de la transcription cachée chez la levure S. cerevisiae. – TermCUT
La terminaison de la transcription est essentielle La terminaison de la transcription est essentielle non seulement pour produire des ARNs ayant une extrémité 3’ correcte, mais aussi pour prévenir l’interférence entre la transcription et d’autres fonctions cellulaires telles que la réplication et la
Impact des Recombinases et Transposases à simple brin sur la Dynamique des Génomes – MOBISING
Le premier challenge est d’obtenir une description détaillée du mécanisme de transposition d’IS608. Cette IS est le paradigme de la famille IS200/IS605 très différente des IS classiques. Ces éléments utilisent un mécanisme de transposition en simple brin impliquant excision précise de l’élément puis