Projets financés
Structure génétique et déséquilibre de liaison chez 3 espèces du genre Vitis – DLVitis
Dans l'objectif de réponse aux nouveaux défis de la viticulture, les objectifs de la sélection vigne sont de créer de nouvelles variétés accumulant une résistance durable aux pathogènes et une adaptation aux nouvelles conditions climatiques, tout en maintenant une qualité optimale de la vendange. Ce
Construction d’une banque BAC de cacaoyer Criollo ; séquençage et analyse bioinformatique des extrémités de BAC – CACAOBAC
Theobroma cacao L. est une espèce diploide (2n = 2x = 20) avec un petit génome (430Mb). C’est un arbre fruitier originaire des régions tropicales humides d’Amérique du sud dont la culture représente une importante source de devises pour les pays tropicaux qui le cultivent. Un consortium internationa
Les nématodes parasites de plantes (PPN) sont capables d’infecter presque toutes les cultures économiquement importantes et sont responsables de pertes estimées au niveau mondial à plusieurs milliards d’euros par an. Jusqu’à une période très récente, les nématicides chimiques représentaient un des m
En général, les relations entre les caractéristiques moléculaires d'une protéine (séquence et structure 3D) et les fonctions biologiques dans lesquelles elle est impliquée sont difficiles à établir. Dans les bases de données, les fonctions biologiques sont souvent décrites sous forme de langage natu
Bases moléculaires des résistances aux virus contrôlées par des facteurs de l'hôte nécessaires au cycle infectieux – MOVIE
Ces dernières années, une augmentation globale de l’incidence des maladies provoquées par les phytovirus a été observée, probablement en lien avec l’intensification des pratiques culturales, l’altération du climat (présentant un impact direct sur les vecteurs viraux) et la globalisation du marché. D
Le projet rassemble des équipes de recherche de plusieurs instituts publics CEA, CNRS et INRA, des universités de Grenoble et Toulouse et de la société privée Genoptics. Ces équipes développent des recherches dans les domaines de la physico-chimie, la chimie, la biologie structurale et la biologie v
La vigne est une culture majeure pour l’agriculture française (9,5 milliards € dont 5,8 à l’exportation). Toutefois l’espèce cultivée (Vitis vinifera) est confrontée à de sévères difficultés car elle est sensible à de nombreuses maladies dont la pourriture grise (champignon nécrotrophe Botrytis cine
La viticulture est une composante majeure de l'agriculture française, non seulement en termes économiques mais aussi en termes culturels. La viticulture française est menacée par plusieurs bioagresseurs. La stratégie actuelle de lutte contre ces maladies est l’utilisation de fongicides. Cette pratiq
Analyse du transcriptome des interactions entre le blé et le champignon pathogène Septoria tritici (Mycosphaerella graminicola) – TWIST
Le blé est une des plantes les plus cultivées et les plus consommées dans le monde. En effet,le blé correspond à environ 35% des besoins alimentaires mondiaux actuels et il est attendu que la demande en blé augmente fortement au cours des prochaines décades. Les maladies fongiques sont un problème m
Création d'une nouvelle ressource pour la validation de gènes chez le blé: une population emboitée de génétique d'association – NEWNAM
Le blé tendre est l'une des céréales les plus cultivées au monde: chaque année, plus de 550 millions de tonnes de blé sont utilisées pour les alimentations humaine et animale. Si la sélection conventionnelle a permis d'augmenter considérablement le rendement et la qualité du blé ces dernières 50 ann
Au cours des dernières années, de nombreux programmes ont produits énormément de données à l’échelle des génomes en génétique ou en génomique. Pour tirer pleinement partie de ces données, il est nécessaire de les intégrer à plusieurs niveaux de résolution. La cartographie de QTL est généralement réa
Un maïs adapté à la sécheresse : développement de l'épi et surface foliaire – DROMADAiR
Le maïs est le principal consommateur de l'eau d'irrigation en France, bien que son métabolisme C4 lui confère une faible conductance stomatique et une excellente efficience de l'eau. Son niveau d'irrigation est dû à sa grande sensibilité au déficit hydrique, liée à l'avortement des grains. Les hypo
Le projet DELICAS a pour objectif d’identifier des marqueurs moléculaires associés à des gènes impliqués dans l’élaboration du rendement et la résistance aux bioagresseurs chez la canne à sucre. La création de nouvelles variétés productives et résistantes aux bioagresseurs est un objectif prioritair
Analyses de séquences d'extrémités de clones BAC comme étape préliminaire au séquençage du génome des caféiers – GénomeCafé
L'utilisation effective des ressources génétiques caféières est considérée comme essentielle pour les programmes d'amélioration génétique dans une perspective de développement durable. Toutefois, malgré son importance économique et sociale dans de nombreux pays de part le monde, le caféier a fait l’
Les plantes sont constamment exposées à une grande variété d'agressions abiotiques (e.g. sécheresse et salinité accentuées par le changement climatique ) et biotiques (e.g. attaques de pathogènes fongiques et bactériens) réduisant leur rendement. Au niveau moléculaire la perception des stimuli extra
Obtention de la séquence complète du génome de deux trypanosomes de plantes – Seqtryplant
Les génomes de trois trypanosomes pathogènes pour l’homme ont été récemment séquencés et comparés. Pour ce projet nous proposons le séquençage comparé de deux trypanosomatides de plante (Eucaryote, Trypanosmatidae,Phytomonas sp.). Le premier est un isolat pathogène du “groupe H” (Hart1). Ce groupe c
Séquençage du génome du bananier (Musa) – MusaTract
La banane est la quatrième plus importante plante cultivée dans les pays en développement. Il existe un besoin urgent de sélectionner des cultivars de banane plus adaptés en terme de résistance aux pathogènes, de productivité et d'adaptation aux conditions locales de culture. Les programmes d'amélio
Les agrumes sont produits dans le monde entier entre les 40°parallèles nord et Sud, aussi bien pour le marché interne que pour l’exportation. Il constitue la plus importante production fruitière au niveau mondial (105 millions de tonne) et possèdent des qualités nutritionnelles élevées. L’agrumicult
Identification de facteurs de l'hôte impliqués dans le mouvement à longue distance des virus de plante – ViroMouv
Les virus de plante sont d’importants pathogènes responsables de sérieux dégâts sur de nombreuses cultures économiquement importantes. Leur impact sur les cultures est non seulement économique mais aussi environnemental en raison des nombreux traitements chimiques (insecticide et nématicides en part
Les légumineuses ont la propriété unique parmi les plantes cultivées de croître efficacement sans engrais azotés et d'enrichir le sol en azote organique. Cette caractéristique, particulièrement intéressante pour l'agriculture durable et la protection de l'environnement, est directement liée à leur c
Peptides de Signalisation et Régulateurs du Cytosquelette Impliqués dans la Sensibilité des Plantes aux Maladies – SCRIPTS
Les mécanismes moléculaires impliqués dans la résistance des plantes aux microorganismes pathogènes ont fait l’objet de nombreuses études dans la dernière décennie. Ces études ont permis de nombreuses applications dans le contrôle de ces agents pathogènes. En revanche, nos connaissances sur la sensi
Réponses de phosphorylation de la racine d'Arabidopsis à des stimuli biotiques, abiotiques et nutritionnels – PhosphoStim
xxx xxx x x Les plantes sont constamment soumises à des contraintes environnementales, comme des attaques par des pathogènes, des changements drastiques de la température et de la lumière ambiantes, ou un apport limitant en eau ou en nutriments. La combinaison de ces contraintes détermine l’état de
Le sol de par sa communauté microbienne est sans conteste l?écosystème de notre planète qui présente la plus grande biodiversité. La principale limite à l?étude et à l?exploitation de ce très important écosystème demeure le faible niveau de cultivabilité des bactéries et même la difficulté à en extr
Méthodes Bioinformatiques et Statistiques pour les expériences de Métagénomique – CBME
La génomique microbienne à grande échelle est un domaine où des progrès scientifiques importants et rapides sont attendus, avec à la clé des applications de grande portée, notamment dans les domaines de la chimie durable, la bioconversion et la santé. C'est un domaine où les possibilités ouvertes pa
Génomique des populations de Streptococcus agalactiae, la diversification des génomes et l'adaptation à l'hôte – Genopop-GBS
Streptococcus agalactiae est apparue comme la première cause d'infections néonatales dans la seconde moitié du 20ème siècle. Cette bactérie est également un pathogène animal et a initialement été associée à des pertes économiques dans les élevages bovins laitiers puis dans des fermes piscicoles. Des
IIl est maintenant bien établi que les biocatalyseurs sont des alternatives intéressantes à la chimie de synthèse pour l?industrie. Les enzymes sont capables de catalyser des réactions qui ont le grand avantage d?être spécifiques du substrat, strictement enantiosélectives et régiospécifiques. De plu
Description et exploitation de la communauté microbienne du sol par une approche metagénomique – METASOIL
Le sol de par sa communauté microbienne est sans conteste l’écosystème de notre planète qui présente la plus grande biodiversité. La principale limite à l’étude et à l’exploitation de ce très important écosystème demeure le faible niveau de cultivabilité des bactéries et même la difficulté à en extr
Génomique évolutive et des populations de microorganismes non-cultivables de l'océan profond – EVOLDEEP
L'océan profond est l'un des écosystèmes terrestres les moins connus malgré le fait qu'il constitue l'un des plus vastes et que les activités des communautés microbiennes qui s'y développent sont fondamentales pour la complétion des cycles biogéochimiques globaux de notre planète. Des approches mo
Evolution et dynamique des génomes au cours d'une adaptation bactérienne à long terme. – EVOGENO
La séquence de centaines de génomes bactériens a mis en évidence l?extraordinaire diversité et plasticité des réseaux métaboliques et de régulation. Cependant, la dynamique de l?évolution de ces diverses fonctions, et en particulier le lien entre les modifications génomiques, la diversité et la perf