Projets financés
COopération, COmpensation, COmpétition: interactions complexes entre Méthylation de l'ADN et Polycomb dans le contrôle des Eléments Transposables d'ArabidopsiS – COMPTES
Dans de nombreux organismes, la méthylation de l’ADN est associée aux éléments transposables (ET) et contrôle négativement leur expression. D’autre part, la triméthylation de la lysine 27 de l’histone H3 (H3K27me3) catalysée par les protéines du groupe Polycomb (PcG) cible, elle, les gènes codants p
Réseau de régulation et élément LINE-1 : impact global des éléments transposables récents sur l'activité génique chez les Mammifères – ImpacTE
Les séquences d’ADN répété constituent près de la moitié des génomes humain et murin. La plupart d’entre elles sont des vestiges dégénérés d’anciens éléments génétiques mobiles. Cependant, un petit groupe d’éléments transposables récents du point de vue évolutif, en particulier ceux appartenant à la
Coopération entre épitranscriptomique et voie piRNA dans la régulation des ARNm maternels – m6ApiRNA
La régulation des ARNm est essentielle dans un grand nombre de processus biologiques et pathologiques. Cette régulation implique des protéines de liaison à l'ARN et des ARN non-codants qui agissent de manière coordonnée pour déterminer le devenir et la fonction des ARNm cellulaires. Les piRNAs (Piwi
Assemblage de complexes épigénétiques dans le temps et dans l’espace – EpiCAST
L’action collaborative de différents régulateurs transcriptionnels contrôle la transcription par l’ARN polymérase II (Pol II), sous-tendant l’identité et la fonction de toute cellule eucaryote. Une transcription régulée repose sur des complexes de régulation de la transcription qui sont recrutés sur
Analyse intégrée d'un régulateur épigénétique essentiel – INTEGER
La méthylation de l'ADN est une marque épigétique essentielle chez les mammifères. Elle est nécessaire au développement embryonnaire, à la différenciation des cellules, et son altération est à la base de nombreuses maladies humaines héréditaires ou sporadiques, allant de la neurodégénerescence, à l'
Régulation redox de l'activité des HDAC de plantes en réponse au changement climatique – REPHARE
1. Etude des modifications post-traductionnelles redox des HDAC d'Arabidopsis dans des conditions de température ambiante normale et élevée et identification des régulateurs redox impliqués dans les modifications des HDAC. 2. Etude de la régulation redox des fonctions HDAC dans l'acétylation des hi
Etude de la toxine RNase du système TAC chez Mycobacterium tuberculosis – M-TOX
Les systèmes de toxine-antitoxine bactériens (TA) sont des éléments génétiques composés d'une toxine et d'une antitoxine qui inhibe l'activité de la toxine. Dans certaines conditions, y compris le stress, la toxine peut être activée et inhiber la croissance de la bactérie qui la produit. La forte to
Une maladie rare pour décoder le lien fonctionnel entre méthylation de l'ADN et maintien de l'intégrité du centromère – MEliCENDre
Dans tous les organismes vivants, le maintien de l'intégrité du génome et la transmission fidèle de l'information génétique à chaque division cellulaire sont essentiels au développement normal et à la survie. Chez les mammifères, la méthylation de l'ADN et le maintien de l'intégrité du centromère so
Origines de réplication humaines : réconcilier des visions disparates – HUDROR
Le but de ce projet est une compréhension quantitative rigoureuse du programme de réplication du génome humain. Ceci est essentiel car les perturbations de la réplication menacent la stabilité du génome dans les cellules souches, le cancer, le vieillissement et d'autres affections. La nature des ori
Contrôle des voies de réparation des fourches de réplication par les pores nucléaires – NIRO
Le stress réplicatif est une cause sous-jacente de maladies humaines. Bien que la plupart des voies de signalisation et de réparation soient maintenant bien décrites, le contrôle spatio-temporel des mécanismes de réparation des fourches de réplication reste peu connu. Ces mécanismes opèrent dans un
Etude des pontages interbrins de l'ADN chez les mammifères en utilisant la chimie click – DeCLick
L'information génétique de nos cellules est contenue dans notre ADN qui est constamment exposé à des molécules capables d'impacter sa structure ou sa séquence. Les pontages interbrins de l'ADN sont induits par des molécules capables de lier les deux brins de l'ADN à la manière de menottes qui évit
Evolution de l'inactivation du X et des ARN non-codant régulateurs chez les primates – PrimateXCI
L’inactivation du chromosome X est un processus de compensation de dose rencontré chez les mammifères, et un paradigme des régulations épigénétiques. Le rôle majeur que joue un ensemble d’éléments non-codants dans ce processus a été largement démontré chez la souris. L’inactivation du X est un proce
Régulation des cellules souches neurales par les lncARN dans le cerveau adulte – stemmcell_lncRNA
Les cellules souches neuronales (CSN) ont la capacité de générer les neurones et la glie du cerveau intact ou endommagé. L’épuisement du stock de CSN étant l’une des causes du vieillissement, il est crucial d’identifier les molécules régulant la régénération et la maturation des CSN afin de prévenir
Régulation de l'activité des ribosomes par la 2'-O-méthylation des ARNr : Vers un contrôle de la traduction par l'épitranscriptome de l'ARNr – ActiMeth
Déchiffrer les mécanismes de régulation de la synthèse protéique est crucial dans notre compréhension de l'expression génique tant dans les tissus sains que pathologiques. Historiquement, les séquences génétiques présentes dans les ARN messagers (ARNm) et les protéines qui se lient aux ARNm étaient
Paysage épigénomique et variations naturelles de l'hérédité transgénérationnelle chez C. elegans – EpiMEV
L'hérédité est au cœur de la biologie. Bien que l'hérédité soit principalement basée sur la séquence de l'ADN, une hérédité épigénétique a maintenant été décrite chez certaines espèces. Le mécanisme moléculaire et l'existence de variation génétique naturelle régulant cette hérédité épigénétique sont
Les P-bodies dans le contrôle du cycle cellulaire – BODYCYCLE
Pour comprendre comment est contrôlée la production des protéines, il faudrait une vision intégrée de la traduction, du stockage et de la dégradation des ARN. Chez les eucaryotes, de nombreux régulateurs condensent dans des gouttelettes cytoplasmiques appelées P-bodies. Dans une étude pionnière, nou
Mécanismes de réplication de l'hétérochromatine: lien avec les télomères – TELOCHROM
L’Hétérochromatine (HC), élément chromosomique essentiel à la stabilité du génome, est particulièrement difficile à répliquer du fait de sa condensation et de sa composition riche en ADN répété. Récemment, l’équipe d’E. Gilson a mis au jour un rôle inattendu de la protéine télomérique TRF2 dans la r
Origine des points chauds méïotiques PRDM9-dépendants: où, comment et pourquoi recombiner? – HotRec
Chez de nombreux eucaryotes, la recombinaison méiotique est concentrée dans des hotspots. Ceux des plantes, fungi, oiseaux et canidés sont localisés dans les promoteurs et évolutivement stables. Chez l’homme et la souris, PRDM9 cible les hotspots loin des gènes, et provoque leur autodestruction rapi
Hybrides ARN:ADN et instabilité des fourches de réplication – ReDeFINe
Les R-loops sont des structures stables qui se forment lors de la transcription quand l'ARN naissant s’associe avec son ADN matrice, générant un hybride ARN:ADN et une boucle d’ADN simple-brin. Ces structures couvrent jusqu'à 5% du génome humain et jouent un rôle important dans la régulation de l'ex
Complexe Polycomb chez la paramécie: interaction avec la machinerie des petits ARN et spécificité de substrats – POLYCHROME
Chez Paramecium, les régions chromatiniennes associée à la signature PRC2 sont mises en place au cours du développement et sont ensuite éliminées, avant la première division cellulaire. Une caractéristique des ciliés, et donc de Paramecium, est la séparation des fonctions germinale et somatique entr
Bases moléculaires de la programmation du génome mâle haploïde – EpiSperm4
La différenciation des cellules germinales mâles haploïdes constitue une étape essentielle dans la préparation d'un génome résistant et transportable. Malgré son importance vitale dans le cycle de vie de nombreuses espèces, ce processus est resté l'un des phénomènes biologiques essentiels les plus o
Comprendre le rôle de SUMO dans la plasticité cellulaire, implications dans la régénération tissulaire – SUMOCHROM
Les mécanismes assurant la stabilité des cellules matures dans les organismes multicellulaires et leurs altérations dans les maladies est une question centrale en biologie et en médecine. La compréhension de principes généraux de sauvegarde de l'identité cellulaire devrait notamment permettre de rév
Caracterisation des foyers de traduction: de nouvelles structures qui organisement finement le cytoplasme – TRANSFACT
La plupart des ARNm se distribuent de manière aléatoire dans le cytoplasme, mais certains se localisent dans des zones spécifiques. La localisation de l'ARN est liée au métabolisme de l'ARN (par exemple pour du stockage); ou au métabolisme des protéines, pour synthétiser une protéine localement. La
Initiation de la réplication de l’ ADN chez les parasites du Paludisme – ROAdMAP
La réplication de l'ADN est un processus essentiel à la vie. Cependant, les mécanismes de duplication du génome présentent un niveau élevé de diversité au sein de l'arbre de vie. Les mécanismes qui régissent ce processus omniprésent ont fait l'objet d'études approfondies dans des systèmes modèles te
Activité et interaction fonctionnelle entre deux condensines bactériennes pour le management du chromosome chez Pseudomonas aeruginosa – PseudoSMC
Les protéines SMC (pour « Structural Maintenance of Chromosomes) sont très conservées dans la grande majorité des êtres vivants. Elles assurent diverses fonctions essentielles dans l’organisation et le fonctionnement des chromosomes. Les organismes eucaryotes ont plusieurs complexes SMC spécialisés
Transposopathie de mouches mutantes pour p53 – Top53
La présente proposition vise donc à mieux comprendre les mécanismes par lesquels les ET sont réprimés dans deux tissus de drosophile qui expriment la p53 mais qui sont dépourvus du mécanisme de silencing transcriptionnel médié par les piARN : la Piwi-less pocket, dans la lignée germinale féminine et
Réparation des dommages ou mort cellulaire chez les bactéries exposées aux stress – NOVOREP
Les bactéries sont fréquemment exposées à diverses conditions de stress dans la nature, lors de procédés industriels, ou quand elles sont confrontées au système immunitaire humain ou aux antibiotiques. Les bactéries ont développé de nombreux mécanismes de défense, de réponse au stress et de réparati
Dissection de l'impact intergénérationnel de la phéromone chez C. elegans – InterPhero
Les individus génétiquement identiques évoluant dans le même environnement sont souvent phénotypiquement différents, comme c’est le cas pour les humains, où de « vrais » jumeaux peuvent être discordants pour des maladies génétiques courantes. Les raisons de ces écarts sont généralement inconnues. C
Contrôle épigénétique de l’activité des transposons et l’empreinte génomique chez les graines hybrides – EpiHYBRIDS
L’hybridation entre plantes de ploïdies différentes est souvent perturbée par des petits ARNs issus des transposons, qui effacent l’empreinte génomique parentale dans la graine. Ce phénomène, qui ressemble à la dysgénésie des hybrides de Drosophila, suggère que les plantes et les animaux utilisent d
ARN Régulateurs et Résistance aux Antibiotiques – RRARE
Selon l'Organisation Mondiale de la Santé, la résistance aux antibiotiques est l’une des menaces les plus graves pour la santé, la sécurité alimentaire et le développement dans le monde. Elle concerne les humains et les animaux de tous pays et la gravité des infections augmente avec l'échec de trait
Mécanisme de recherche et de reconnaissance d’homologie de l'ADN, indépendant de la recombinaison – RECIND
Nos précédentes recherches ont mis en évidence un mécanisme général fondamental par lequel deux séquences d’ADN homologues peuvent être reconnues in vivo. Ce processus peut avoir lieu aussi bien dans des noyaux mitotiques que dans des noyaux en méiose. De plus, il ne requiert pas de recombinases de
Contrôle de la Réplication chez les Bactéries à Multiple Chromosomes – RepliChroms
L'hypothèse principale qui sous-tend cette proposition est que les mécanismes usuels de type plasmidique, qui permettent de maintenir des plasmides à nombre de copies multiples, en déclenchant leur réplication de manière aléatoire dans le temps, ont évolué vers des systèmes capables de maintenir la
Stress oxydant et transfert horizontal de gènes comme source de diversité génétique du pathogène gastrique Helicobacter pylori – GenTransOx
Le transfert horizontal de gène (HGT) joue un rôle central dans la dissémination de nouveaux variants génétiques au sein d’une population bactérienne et contribue ainsi à sa diversité génétique. Le HGT est donc essentiel pour permettre aux microorganismes de s’adapter aux changements environnementau