Mécanisme de recherche et de reconnaissance d’homologie de l'ADN, indépendant de la recombinaison – RECIND

Nos précédentes recherches ont mis en évidence un mécanisme général fondamental par lequel deux séquences d’ADN homologues peuvent être reconnues in vivo. Ce processus peut avoir lieu aussi bien dans des noyaux mitotiques que dans des noyaux en méiose. De plus, il ne requiert pas de recombinases de type RecA et la comparaison entre double hélices d’ADN s’effectuerait selon des motifs de triplets de paires de bases. Nous avons acquis ces connaissances en analysant deux processus distincts d’extinction génique, le RIP (repeat-induced point mutation) et le MSUD (meitoic silencing by unpaired DNA), chez le champignon modèle Neurospora crassa. Bien que le RIP et le MSUD soient limités aux champignons, leur mécanisme implique un certain nombre de protéines conservées chez les autres eucaryotes, y compris chez les mammifères. Par conséquent, étant donné que les phénomènes dépendants d’une homologie de séquence sont très répandus chez les mammifères, un tel mécanisme de reconnaissance indépendant de la recombinaison homologue pourrait également être impliqué dans plusieurs processus cytogénétiques chez l’Homme.

Nous proposons à présent d’utiliser le RIP et le MSUD comme deux systèmes complémentaires pour mieux comprendre la nature moléculaire du processus sous-jacent de reconnaissance d’homologie. Premièrement, nous utiliserons le RIP pour définir plus précisément ses caractéristiques biophysiques. Deuxièmement, en nous basant sur les connaissances générales du programme méiotique, et en particulier des éléments nécessaires au MSUD, nous examinerons le rôle de plusieurs processus chromosomiques susceptibles de favoriser la recherche d’homologies, indépendant de la recombinaison, lors de la méiose. Troisièmement, nous profiterons du fait que le MSUD est une partie du programme méiotique directement observable, pour détecter et analyser l’appariement présupposé d’ADN double brins homologues par microscopie. L’ensemble de ces études permettront d’obtenir une nouvelle vision mécanistique qui reste à ce jour inaccessible par la mise en œuvre d’autres systèmes expérimentaux. Ainsi, ce projet propulsera notre groupe junior en première ligne du domaine émergeant qu’est la reconnaissance de l’ADN homologue indépendant de la recombinaison.