Caracterisation des foyers de traduction: de nouvelles structures qui organisement finement le cytoplasme – TRANSFACT

La plupart des ARNm se distribuent de manière aléatoire dans le cytoplasme, mais certains se localisent dans des zones spécifiques. La localisation de l'ARN est liée au métabolisme de l'ARN (par exemple pour du stockage); ou au métabolisme des protéines, pour synthétiser une protéine localement. La traduction locale est impliquée dans de nombreux processus cellulaires, mais aucune étude systématique n’a été réalisée sur des cellules humaines. Nous avons récemment effectué un crible de localisation et avons trouvé de nombreux ARNm traduits localement. Une classe fascinante correspond à des usines de traduction, où une espèce d’ARNm est traduite dans des foyers contenant plusieurs molécules d’ARN, tandis que la protéine mature s'accumule ailleurs. Dans un cas, nous avons montré que cela était utilisé pour dégrader la protéine de manière co-traductionnelle, ce qui montre que les usines de traduction révèlent de nouveaux mécanismes pour réguler l'expression des gènes. L'extrapolation de nos données à l'échelle du génôme conduit à l'hypothèse fascinante qu'une cellule humaine typique pourrait contenir des centaines de telles usines de traduction, créant ainsi une compartimentation fine de l'appareil de traduction dans le cytoplasme. Notre projet abordera cette hypothèse et il a deux objectifs. Nous allons d’abord caractériser les usines de traduction connues afin de déterminer leurs fonctions et leur mécanisme d’assemblage. Nous utiliserons ici les méthodes traditionnelles de biochimie et de biologie moléculaire. Ensuite, nous réaliserons des cribles à grande échelle pour découvrir de nouvelles usines de traduction et ainsi avoir une vision globale de ce phénomène à l’échelle génomique. Pour cela, nous utiliserons et développerons des techniques puissantes basées sur smFISH à haut-débit, combiné à la vision par ordinateur et à de nouveaux outils d'analyse computationnelle. Notre projet générera ainsi des jeux de données très riches et ils devrait apporter de nombreuses découvertes éclairant l'organisation de la traduction dans le cytoplasme.