Projets financés
Coordination du Contrôle de l’Expression des Gènes en Réponse aux Nutriments – CoCoNut
Une question fondamentale en biologie est de comprendre comment une cellule répond aux fluctuations de son environnement en modulant l'expression des gènes. L'expression des gènes peut être régulée à plusieurs niveaux et beaucoup de travaux ont contribué à la compréhension individuelle de chaque éta
Modifications des extrémités 3' des ARNm par addition de nucléotides: impact sur la traduction et la dégradation des ARNm chez Arabidopsis thaliana – 3'modRN
La stabilité des ARNm et la traduction sont deux étapes clés cibles de la régulation de l'expression des gènes, qui sont massivement reprogrammées au cours de transitions développementales ou d'acclimatation aux stress. L'objectif principal du projet 3'modRN est de déterminer l'impact de l'uridylati
Impact de l'achitecture nucléaire sur la longévité – DNA-Life
Malgré l'importance et le caractère ubiquitaire de la quiescence, cet état qui peut varier en fonction de l'histoire de la cellule (O'Farrell 2011) est encore compris. Fait intéressant, la levure bourgeonnante peut atteindre différents états quiescents en fonction des conditions qui induisent la sor
Régulation épigénétique du développement : vers une modélisation mathématique prédictive du repliement tridimensionnel du génome et de la mémoire cellulaire – EpiDevoMath
Toutes les cellules d’un organisme multicellulaire ont le même génome mais sont pourtant fortement spécialisées. La régulation épigénétique assure la transmission de cette information non génétique, de sorte qu’une même séquence ADN peut induire différents états fonctionnels stables. Des travaux réc
Bases moleculaires de la programmation post-méiotique du genome male – EpiSperm3
Ce programme suit deux autres programmes de recherche soutenus par l'ANR, EpiSperm1 et EpiSperm2. Il comporte 3 Workpackages (WP) qui visent à démanteler les bases moléculaires de l'éviction des histones sui se produit au cours des stades tardifs de la spermatogenèse. Ces WP considèrent le rôle des
Identification des mécanismes moléculaires régulateurs du programme spatio-temporel de la réplication – OriMolMech
La duplication exacte des génomes vertébrés à chaque phase S du cycle cellulaire est sous le contrôle d’un programme spatio-temporel qui régule à la fois le positionnement et le moment de déclenchement d’environ 100 000 points de départ appelés origines de réplication. Des cartographies génomiques d
Adaptation par ARN régulateurs chez Staphylococcus aureus – sRNA-FIT
Staphylococcus aureus est responsable de nombreuses pathologies humaines et animales dont les traitements sont souvent rendus difficiles par l’émergence de souches multi-résistantes aux antibiotiques. Notre projet vise à caractériser des ARN régulateurs (ARNrég) de S. aureus impactant sa virulence e
Role de condensine dans la répression de l'expression génique – GeneSilencingByCondensin
Enjeu 1 : Identifier la voie dans laquelle condensine régule les gènes. Etat : achevé. Nous avons découvert que condensine préserve l’expression génique en promouvant la stabilité du génome en mitose. L’aneuploïdie causée par une déficience de condensine en mitose altère l’expression du génome, vr
Décryptage du rôle des modifications des histones dans la stabilité et identité de la lignée germinale – GermChromatin
Le génome des cellules germinales est programmé pour produire des gamètes et transmettre aux embryons la capacité à se différencier en tous les types cellulaires après fécondation. Pour maintenir l'identité des cellules germinales et assurer la survie des espèces, il est crucial d'empêcher l'activat
Génétique & physiopathologie de l'hyperplasie macronodulaire des surrénales – GP-PMAH
Le syndrome de Cushing endogène (SC) résulte d'une production excessive de cortisol et provoque une morbi-mortalité élevée due aux complications cardio-vasculaires, le diabète, les troubles psychiatriques, l'ostéoporose et les infections. L’hyperplasie macronodulaire des surrénales (PMAH: Primary
Recherche de facteurs contrôlant l'assemblage de granules ARN par crible génomique – RNAGRIMP
In vivo, les ARNms s’associent à des protéines régulatrices pour former des particules ribonucléoprotéiques (RNP) qui contrôlent leur destinée et sont remodelées en réponse à des signaux développementaux ou environnementaux. Différents types de RNPs cytoplasmiques ont été définies en fonction de leu
Séquençage multi-échelle d'ADN génomique répété G/C riche par manipulation en molecule unique en pinces magnétiques – Museq
La plupart des techniques de séquençage d’ADN contiennent une étape d’amplification via une polymerase. Cette étape a plusieurs conséquences. La première est que l’information épigénétique portée par des bases modifiées dans l’échantillon de départ est perdue. Il existe des méthodes pour contourner
La fonction des protéines BTG dans la prolifération et la différenciation cellulaire, et dans la dégradation des ARN messagers – BTG2mRNA
Le contrôle de la dégradation des ARNm est un mécanisme important qui contribue à la régulation de l'expression des gènes. Chez les eucaryotes, l’élimination de la queue poly-A des ARNm constitue l’étape initiale de ce processus. Cette étape a un rôle critique car les ARNm désadénylés ne sont plus t
Régulation transcriptionnelle par séquestration nucléolaire – NucleoReg
Pour comprendre les mécanismes impliqués dans cette nouvelle voie de régulation, je développerai deux approches complémentaires : 1. La cartographie des domaines associés au nucléole (NADs) à l'échelle d'une population de cellules / tissus / organisme dans des conditions standards ou particulière
Dynamique de la reméthylation de l'ADN chez les eucaryotes – REMETH
1-La méthylation de l'ADN: une marque épigénétique essentielle chez les mammifères. La méthylation est une marque épigénétique abondante de l'ADN chez les vertébrés. Elle se produit sur les cytosines des dinucléotides CpG, qui sont notamment présents dans les régions appelées îlots CpG qui colocali
Explorer la face cachée de la recombinaison – DaSiRe
La recombinaison méiotique est un élément clé de notre biologie. En assurant une ségrégation correcte des chromosomes et en maintenant l’intégrité génomique, elle joue un rôle essentiel dans notre fécondité et notre adaptation. La recombinaison a également une fonction essentielle sur le plan évolut
Rôle de la méthylation des lysines dans les interactions hôte-pathogene – PATHO-METHYLOME
Les interactions entre deux génomes eucaryotes représentent un exemple fascinant de coévolution au travers de relations hôte-parasite. En effet, il s’agit ici de deux génomes, deux épigénome et deux systèmescellulaires vivant et évoluant ensemble. Notre projet se concentre sur les interactions entre
Aspects moléculaires de la régulation des ARNm par les piRNAs et les RNA binding protéines chez la drosophile – ControlbypiRNA
Les régulations post-transcriptionnelles sont essentielles dans de nombreux processus biologiques. Un mécanisme majeur de régulation post-transcriptionnelle implique les variations cytoplasmiques des queues poly(A) des ARNm, qui affectent leur stabilité et leur traduction. Ces régulations sont essen
DBA-MULTIGENES: identification et caractérisation de gènes candidats pour la découverte de nouveaux mécanismes physiopathologiques à l'origine de l'anémie de Blackfan-Diamond. – DBA-MULTIGENES
L'anémie de Blackfan-Diamond (ABD) est une érythroblastopénie congénitale rare avec une incidence de 7 à 12/million de naissances vivantes, caractérisée par une absence ou moins de 5% de précurseurs érythroïdes au sein d'une moelle normocellulaire. Dans 40% des cas, les patients présentent des malfo
Méthodes de peignage moléculaire à haut débit pour une cartographie rapide de la réplication du génome humain – LIGHTCOMB
La cartographie des origines de réplication et de la progression des fourches de réplication dans les génomes animaux reste une des questions les plus difficiles de la biologie moléculaire moderne. Bien que les méthodes génomiques permettent désormais de cartographier la position des origines ou la