Projets financés
Dynamiques de transmission intra-communautaire des Entérobactéries multirésistantes – HOME
A ce jour, la dynamique de transmission des Entérobactéries multirésistantes (MDR-E, dont les Entérobactéries productrices de Beta-Lactamase à Spectre Etendu et de Carbapénémases) a été principalement étudiée en milieu hospitalier. Plusieurs études suggèrent cependant que les MDR-E diffusent largem
Evaluer et controler les risques sanitaires associés à l'émergence du CWD en Europe – EU-CWD
La maladie du dépérissement chronique (CWD) est une maladie à prions extrêmement contagieuse des cervidés. En l’espace de 15 ans, elle a envahi l’ensemble des Etats-Unis et le Canada. Elle menace à présent l’existence à long terme des populations de cervidés sur ce continent. De nombreuses incertitu
Comprendre l'évolution de la résistance aux antimicrobiens chez les vibrios environnementaux – RESISTE
L’ostréiculture repose sur des programmes de sélection génétique qui requièrent un traitement des géniteurs par les antibiotiques dans les écloseries. Nos résultats suggèrent que l’antibiorésistance est fréquente chez des vibrios environnementaux. Ils suggèrent également que les huîtres agissent com
Compétition & facilitation entre parasites : moteurs de l’évolution de la virulence ? – EVOLVIR
La théorie prédit que les co-infections parasitaires jouent un rôle majeur dans l’épidémiologie et l’évolution de la virulence des parasites. Au sein d’un hôte, il est prédit que la compétition entre parasites (pour l’accès aux ressources, ou par l’intermédiaire du système immunitaire) va sélectionn
Dynamique spatio-temporelle des populations virales associées au riz en Afrique de l'Ouest – SPADYVA
Au cours de ce projet, nous avons établi une cartographie spatio-temporelle de la diversité virale associée à une culture majeure en Afrique de l’Ouest/Centrale qui a subi des changements radicaux au cours du siècle dernier. Ainsi, grâce à une approche intégrative et multidisciplinaire utilisant les
Evolution des pathogènes co-infectant le riz – EVCOPAR
Les agents pathogènes partagent leur plante hôte avec une multitude d’autres microbes, dont certains d’entre eux sont également pathogènes. Ainsi, on parle d’infection multiple, ou co-infection, lorsqu’une même plante hôte est infectée par plusieurs espèces, ou génotypes, d’agents pathogènes. Ce phé
Contrôler l’antibiorésistance à l’hôpital : modélisation holistique et éco-évolutive de la dissé-mination des gènes de résistance pour optimiser les stratégies de lutte – ResisTrack
Notre objectif principal est d'étudier un éventail d'interventions d’antibiogouvernance et d’hygiène pour identifier des stratégies optimales et comprendre comment les gènes d’antibiorésistance (ARG) se propagent dans les hôpitaux. A l’aide de simulations in silico des populations bactériennes, le
Identification à haut débit des progéniteurs de résistance aux antibiotiques dans des écosystèmes interactifs : PRE-EMPT – PRE-EMPT
L'émergence mondiale de bactéries multirésistantes aux antibiotiques repose sur la capacité d’éléments génétiques mobiles (EGM) à propager les gènes de résistance (ARG), et sur la capacité de dissémination de certains clones. Les preuves de l'origine environnementale de la résistance aux antimicrobi
Usines de réplication virales et défense de l'hôte – dsRNA-Targets
Les virus détournent la machinerie moléculaire des cellules hôtes pour mener à bien leur cycle de réplication, processus fréquemment associé à la production d'ARN double brin (ARNdb). Notre projet a l’ambition de démêler les mécanismes moléculaires impliqués dans la détection des ARNdb et d'identifi
Dissémination et évolution des Intégrons de Résistance : effets du mode de vie en biofilm et du stress antibiotique – DIVIN
L’organisation mondiale de la santé a déclaré que l’antibiorésistance était l’un des plus grands dangers pour la santé humaine moderne. Les intégrons de résistance sont des structures de faible cout, permettant aux bactéries de s’adapter rapidement à la pression antibiotique grâce à l’acquisition, a
Caractérisation du rôle des VBNC et cellules persisters dans la résistance de Cryptococcus neoformans aux antifongiques – CRYPERS
Les cellules « viable but non culturable » (VBNC) sont des cellules qui ne sont plus capable de croître mais peuvent être réactivé par certains stimuli. Au cours de la génération des VBNC, des cellules cultivables persistantes et minoritaires ont été observées. Les cellules persisters sont classiqu
Impact d'une exposition aux bêta-lactamines sur les bêta-lactamases intestinales caractérisées phénotypiquement – BLA-IMPACT
Le microbiote intestinal est au cœur du phénomène de résistance aux antibiotiques. Néanmoins, l'impact des antibiotiques sur le microbiote intestinal reste mal décrit, principalement en raison de l'absence de caractérisation phénotypique des mécanismes de résistance des bactéries intestinales. Nous
Dynamique chromosomique chez Salmonella lors d'une Infection – SaDI
Salmonella est l’un des agents pathogènes alimentaires les plus répandus dans le monde. Sa pathogénicité réside dans un groupe de gènes formant des îlots de pathogénicité qui lui permettent de survivre et de se répliquer tout au long du cycle infectieux. Les facteurs (par ex. les NAPs) impliqués dan
Adaptation génétique et histoire évolutive de Plasmodium vivax en Amérique Genetic adaptation of parasites to new environments : Plasmodium vivax in Americas – GENAD
Plasmodium vivax, agent du paludisme caractérisé par une succession d'événements de colonisation, est un modèle intéressant pour étudier comment les pathogènes s'adaptent à de nouveaux environnements. Dans les Amériques, deux événements de colonisation se sont produits pour P. vivax: l'un lorsque P.
Un panel de lignées consanguines pour démêler les facteurs génétiques et non génétiques du microbiote et de la capacité vectorielle d'Aedes aegypti – PILGRIM
Aedes aegypti est le principal moustique vecteur de plusieurs arbovirus d'importance médicale. Sa capacité vectorielle est influencée par de nombreux facteurs génétiques et environnementaux, notamment le microbiote. Démêler les déterminants génétiques et non génétiques du microbiote et de la capacit
Marqueurs de la persistance intracellulaire de Listeria monocytogenes – PERMALI
Listeria monocytogenes est un contaminant alimentaire bactérien provoquant une zoonose dangereuse, la listériose. Les mécanismes de virulence de ce pathogène ont été abondamment étudiés, mais son portage asymptomatique chez l’hôte est peu compris. Nous avons découvert une phase de persistance intrac