Impact d'une exposition aux bêta-lactamines sur les bêta-lactamases intestinales caractérisées phénotypiquement – BLA-IMPACT

Le microbiote intestinal est au cœur du phénomène de résistance aux antibiotiques. Néanmoins, l'impact des antibiotiques sur le microbiote intestinal reste mal décrit, principalement en raison de l'absence de caractérisation phénotypique des mécanismes de résistance des bactéries intestinales. Nous proposons ici d'étudier l'impact de différentes bêta-lactamines (ceftriaxone, pipéracilline-tazobactam et ceftazidime-avibactam, avec ou sans adsorbant à base de charbon à délivrance colique) sur le microbiote intestinal de volontaires sains, en nous appuyant sur la mesure des concentrations fécales en antibiotiques, des analyses métagénomiques (combinant long-reads et short-reads), la caractérisation du phénotype, des modèles d'évolution in vitro et sur des analyses de données longitudinales. Dans l'ensemble, BLA-IMPACT aidera à connecter les données phénotypiques et métagénomiques indispensables pour comprendre l'évolution du microbiote intestinal sous antibiotiques.