Bases génétiques et mécanistiques de l'échappement des virus influenza à des facteurs de restriction, interféron-induits, ciblant les ribonucléoprotéines virales – Flu-vRNP-Escape

Le porc est un creuset de mélange pour les virus influenza de type A (IAV) hmains, aviaires et porcins. Il peut devenir un hôte intermédiaire pour l’émergence et la préadaptation à l'homme de nouveaux IAVs, avec un potentiel zoonotique ou pandémique. Une surveillance étroite des IAV porcins, couplée à l’identification des déterminants majeurs d’adaptation à l’homme, est donc nécessaire.
Parmi les facteurs de restriction des transmissions inter-espèces des IAV, les protéines humaines MxA et BTN3A3 ciblent les ribonucléoprotéines virales (vRNP). Les mécanismes moléculaires qui déterminent la sensibilité ou la résistance des IAV animaux à ces facteurs restent largement méconnus. Dans le cas de MxA, les recherches sont entravées par la difficulté à caractériser des structures oligomériques vRNP-MxA. Pour la surmonter, le projet FluRNP-Escape s'appuie sur les travaux récents des deux partenaires, qui ont conduit à la purification de deux types de structures d’oligomères de NP liés à l'ARN. Des monomères ou trimères de NP, ou ces structures “vRNP-like”, seront assemblées en complexes macromoléculaires avec MxA, son homologue porcin swMx1, ou BTN3A3. et seront caractérisées par des approches biochimiques et structurales. En parallèle, un criblage mutationnel sera effectué pour identifier les mutations, dans le contexte d’une NP dérivée d'un IAV porcin, qui permettent l’échappement à MxA, swMx1, et/ou BTN3A3. Un IAV recombinant “single-cycle” sera utilisé afin d’assurer des conditions de biosécurité adaptées. Un sous-ensemble de mutants de la NP seront caractérisés dans des tests cellulaires et in vitro. Les approches biochimiques, structurales et génétiques s'enrichiront mutuellement. Dans son ensemble, le projet contribuera à améliorer la surveillance des IAV porcins potentiellement zoonotiques, à mieux comprendre le mécanisme d'action de facteurs de restriction ciblant les vRNP des IAV, et à envisager de nouvelles stratégies antivirales.