Role des modifications de l'ARN dans la différenciation et la fonction des cellules T CD4 – RNAMethylTcell

Les lymphocytes T CD4 sont très efficaces pour protéger notre organisme contre de nombreux dangers endogènes ou exogènes, dont les cellules tumorales, les virus, les bactéries et les parasites. Leur efficacité provient au moins en partie de leur capacité à adapter leur phénotype et leur fonction à la menace. Les lymphocytes T mobilisent ainsi des programmes d'expression génique distincts qui coordonnent l'acquisition de phénotypes et de fonctions spécifiques adaptés au danger. Les lymphocytes T CD4 naïfs sont ainsi capables de se différencier en populations distinctes de lymphocytes « Thelper » (Th): les Th1, Th2, Th17 et Treg. L'interaction des facteurs de transcription et des mécanismes épigénétiques ont un rôle causal dans la régulation des programmes d'expression des gènes des lymphocytes Th. Des résultats préliminaires de notre équipe et l’émergence de données de la littérature suggèrent un nouveau mécanisme régulateur impliqué dans le contrôle de la différenciation et de la fonction des lymphocytes Th : les modifications épitranscriptomiques, c’est-à-dire les modifications chimiques et dynamiques des transcrits. Il s’agit d’un nouveau mécanisme fondamental et conservé impliqué dans le contrôle de la différenciation et de l'homéostasie cellulaire. Plus de la moitié des modifications de l’ARN ont déjà été associés à des maladies chez l’Homme, en particulier auto-immunes. Alors que plusieurs études ont caractérisé un rôle essentiel des modifications épitranscriptomiques dans la régulation de différents aspects du système immunitaire, le rôle de la majorité des acteurs épitranscriptomiques dans les lymphocytes Th reste encore mal connu. Récemment, une nouvelle méthode permettant une détection précise (au niveau de la base unique) des modifications de l’ARN dans les transcrits natifs et basée sur le séquençage de troisième génération (Oxford Nanopore Technologies) a émergé. L'objectif principal de ce projet est de comprendre le rôle respectif des enzymes liées aux modifications de l’ARN dans les populations de lymphocytes Th en combinant des approches in vitro et in vivo ainsi que du séquençage sur Nanopore. Une meilleure compréhension des mécanismes de contrôle de l'expression des gènes par les régulations épitranscriptomique dans les lymphocytes Th pourrait à terme nous permettre de mieux comprendre la physiopathologie des maladies auto-immunes et d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques.