Une étude multi-échelle des changements architecturaux et de dynamique du nucléoïde induits par le stress – NUC-STRESS

La capacité de survie d'un organisme dépend, du moins en partie, de sa capacité à percevoir et à répondre à des changements soudains dans son environnement. Cela est particulièrement vrai pour les bactéries, qui ont conçu un large éventail de stratégies pour répondre au stress, y compris la capacité de rapidement remodeler et compacter leur nucléoïde, notamment pour protéger leur patrimoine génétique. Avec les préoccupations sociétales croissantes que sont la résistance aux antibiotiques et la menace d’une libération de micro-organismes potentiellement pathogènes dans l'environnement suite au réchauffement climatique, il existe un besoin urgent de mieux comprendre les mécanismes universels de la réponse au stress chez les bactéries. L'objectif du projet NUC-STRESS est de mettre en lumière les mécanismes responsables des changements remarquables dans l'organisation des nucléoïdes induits par le stress chez les bactéries. Pour atteindre cet objectif, nous proposons de mettre en œuvre une approche interdisciplinaire et multi-échelle pour caractériser la structure et la dynamique du nucléoïde de l'organisme le plus résistant aux rayonnements sur terre, Deinococcus radiodurans, dans des conditions de croissance normales et en réponse aux rayonnements UV et ionisants. De par sa grande taille et son exceptionnelle résistance aux rayonnements, D. radiodurans est particulièrement bien adaptée à cette étude, qui combine des analyses à l'échelle du génome avec des approches de microscopie optique et électronique et de biologie structurale intégrée. S'appuyant sur des données préliminaires solides, le consortium composé de quatre partenaires hautement complémentaires, unira ses forces et son expertise dans des techniques in vitro, in vivo et in silico pour faire de ce projet un succès.