Identification, Architecture, Evolution et Adaptation d'un complexe membranaire du T6SS unique chez Bacteroidetes – CAMELEON

Le phylum Bacteroidetes est un membre dominant du microbiote intestinal humain, où il joue un rôle clé dans la régulation de sa composition et le maintien d'une bonne santé. Beaucoup de ces bactéries abritent un système de sécrétion de type VI (T6SSiii) qui délivre des effecteurs protéiques à d'autres bactéries. Cela permet aux commensaux de supplanter les autres bactéries, y compris les agents pathogènes. Le T6SS ressemble à un harpon à l'échelle nanométrique qui est rapidement éjecté pour délivrer des toxines dans les cellules de proie. Les T6SSi des protéobactéries accomplissent cet exploit en faisant passer l'aiguille T6SS à travers un complexe membranaire (MC). Une mine d'informations structurales à haute résolution est déjà disponible pour le T6SSi. Paradoxalement, on sait peu de choses sur le très répandu le T6SSiii des Bacteroidetes qui domine le microbiome humain. Remarquablement, le T6SSiii ne possède pas les protéines homologues qui assemblent le MC déjà caractérisé du T6SSi, ce qui signifie que nous ignorons de nombreux aspects clés de sa fonction. Nous avons identifié 5 nouveaux gènes codant pour un T6SSiii MC unique aux Bacteroidetes. Nous utiliserons la bactériologie, la biologie structurale et la bioinformatique pour découvrir l'évolution et la structure du T6SSiii MC, ainsi que son adaptation moléculaire au reste du T6SS. Les objectifs de notre projet sont les suivants : (1) Quelle est la composition et l'architecture unique du T6SSiii MC des Bacteroidetes? ; (2) Comment le MC spécifique de Bacteroidetes interagit-il avec le complexe de plateforme qui lui est conservé ? Et (3) comment de T6SSiii MC a-t-il émergé et évolué ? Nos études et les percées structurales qui l’accompagneront vont faciliter la comparaison avec le T6SS MC protéobactérien et offriront un aperçu unique de l'évolution convergente macromoléculaire et structurale profonde.