Rôle des Treg exprimant TNFR2 ou 4-1BB dans les maladies inflammatoires – TRINDI

Le but de notre projet est de mieux comprendre les mécanismes de suppression des lymphocytes T régulateurs Foxp3 (Tregs) dans certaines maladies inflammatoires comme la sclérose en plaques, la colite ou les cancers. Pour cela, nous utiliserons des souris génétiquement modifiées dans lesquelles l’expression des molécules de co-stimulation TNFR2 et 4-1BB, ainsi que le facteur de transcription Eomes, seront éliminées spécifiquement dans les Tregs suite à l’administration d’une pro-drogue. Nos résultats montrent que l’ablation du TNFR2 dans les Tregs (souris TNFR2?Treg) n’a pas d’effet à l’état basal mais conduit à une forte augmentation de l’inflammation dans les modèles de sclérose en plaques, de colite ou de cancers, avec aggravation des symptômes pour les deux premières maladies et rejet tumoral pour la troisième, ce qui indique une altération de la fonction des Tregs en conditions inflammatoires. Dans une 1ère partie du projet, nous caractériserons les Tregs des tissus enflammés dans ces trois pathologies chez les souris TNFR2?Treg et témoins par une approche de séquençage ARN sur cellules uniques (scRNA-Seq) et de cytométrie de flux. Ce travail devrait permettre de caractériser de nouvelles sous-populations de Tregs jouant un rôle prépondérant et spécifique dans le contrôle de ces maladies. Nous étudierons également le rôle spécifique de 4-1BB exprimé par les Tregs dans ces maladies. Sur la base de données préliminaires suggérant un rôle spécifique d’Eomes dans les Tregs, la 2ème partie du projet sera consacrée à l’étude de cette molécule dans la capacité des Tregs à contrôler les mêmes maladies inflammatoires. Pour cela, nous utiliserons des souris dans lesquelles les Tregs seront déficients pour Eomes et/ou TNFR2. La 3ème partie sera consacrée à l’étude des effets des Tregs sur les cellules immunes cibles dans les tissus enflammés dans les trois modèles pathologiques induits chez les souris TNFR2?Treg. Là encore, nous utiliserons des approches de scRNA-Seq et de cytométrie en flux. Nous apporterons une attention particulière à Eomes, cette fois-ci pour son rôle dans les lymphocytes T conventionnels, par des approches génétiques d’ablation et de surexpression. Dans la dernière partie du projet, nous étudierons les modes d’action des agonistes et antagonistes du TNFR2 et de 4-1BB qui présentent un effet thérapeutique dans les maladies auto-immunes et/ou les cancers (déjà testées dans des essais cliniques d’immunothérapies) et dont le mode d’action est encore mal compris. Grâce à nos modèles d’ablation conditionnelle du TNFR2 ou de 4-1BB dans les Tregs, nous pourrons déterminer si ces molécules agissent par effet direct sur les Tregs.
Notre projet s’intéresse donc à plusieurs aspects de la biologie des Tregs dans les maladies inflammatoires. Grâce à des analyses sur cellules uniques, nous pensons pouvoir identifier les sous-populations de Tregs dans les tissus enflammés qui joueraient un rôle prépondérant dans le contrôle de ces maladies. Nous pourrions savoir si les mêmes sous-populations contrôlent différentes maladies inflammatoires et des cancers. Nous pourrons également améliorer notre compréhension du rôle joué par le TNFR2 et 4-1BB dans la biologie des Tregs et mieux comprendre le rôle joué par Eomes exprimé par les Tregs et les lymphocytes T conventionnels dans ces maladies. Nous devrions aussi améliorer nos connaissances sur l’effet suppresseur des Tregs sur les autres cellules immunes dans les tissus enflammés. Enfin, nous déterminerons si l’action thérapeutique des agonistes du TNFR2 et de 4-1BB passe par un effet direct sur les Tregs. Globalement, ce projet devrait permettre de mieux comprendre comment les Tregs régulent ces maladies inflammatoires, ce qui pourrait ouvrir la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques pour ces pathologies.