Signature structurale à l’échelle de la molécule unique de glycosaminoglycanes par détection nanopore: vers un outil de séquençage glycosaminoglycomique – GAGS-NANOSENSOR

Le projet vise à fournir la première méthode analytique de séquençage des polysaccharides bioactifs glycosaminoglycanes à l’échelle de la molécule unique en utilisant la détection par nanopores, avec des applications dans la recherche biologique et physiopathologique, en particulier pour le diagnostic et l'identification de biomarqueurs glucidiques. Compte tenu des rôles biologiques centraux des GAG et de l'attention croissante accordée à ces cibles pharmacologiques prometteuses, la demande est forte pour des méthodes capables de lire les séquences d'oligosaccharides des GAG, en particulier celles qui sont spécifiquement impliquées dans des situations pathologiques. Les méthodes basées sur les nanopores sont prometteuses pour déchiffrer des informations codées dans un polymère linéaire comme illustré par les applications déjà opérationnelles de séquençage de l’ADN et des protéines, cependant l'analyse des nanopores à une seule molécule reste comparativement beaucoup moins appliquée aux glucides, en particulier aux polysaccharides GAG bioactifs. Notre objectif dans le projet GAGs-nanosensor est d'ouvrir ce domaine encore inexploré des nanopores appliqués aux GAGs, et pour la première fois de mettre en place une méthode de profilage et de séquençage à base de nanopores pour ces glucides bioactifs. À cette fin, différents nanopores protéiques seront évalués et des bibliothèques uniques d'oligosaccharides de GAG sulfatés seront produites par synthèse chimique et par voie biosynthétique microbienne. Une base de données de signatures de nanopores de référence sera établie grâce au criblage par nanopores de ces bibliothèques de GAG couvriantla plus grande diversité moléculaire trouvée dans les GAG. Le manque d'outils d’analyse structurale dédiés aux glucides est identifié par la communauté scientifique internationale comme un facteur limitant des glycosciences. Une telle méthode de séquençage par nanopores répond à cette demande et sera utile dans la conception de composés actifs glucidiques dérivés de GAG comme outils pharmacologiques ou à usage thérapeutique.