Dysfonction d'organe persistantes après infection à SARS-CoV-2 – MOD-CoV

Justification.
L'infection par le SARS-CoV-2 est apparue en Chine en décembre 2019 et s'est rapidement répandue dans le monde entier. On estime que plus de 160 000 sujets ont été infectés en France à ce jour, et qu'environ 2/3 des sujets infectés ont dû être hospitalisés. Certaines études récentes ont mis en évidence l'apparition de réactions inflammatoires à moyen terme d'une gravité inhabituelle chez des sujets séropositifs pour le SARS-CoV-2 asymptomatiques à la phase aiguë de l'infection. Cela suggère la survenue de manifestations atypiques et inconnues dans les suites de l'infection.

Objectifs.
Les objectifs de notre projet sont (i) de décrire les médicaments, les procédures et dispositifs médicaux utilisés et leur évolution, avant et après une infection par le SARS-CoV-2 nécessitant une hospitalisation, et (ii) d'identifier les troubles organiques à moyen terme (12 mois) chez les sujets infectés par le SARS-CoV-2, en utilisant les bases de données médico-administratives.

Méthodes.
Nous réaliserons une étude de cohorte dans la base de Système National des Données de Santé. Dans un premier temps, nous constituerons une cohorte de sujets hospitalisés entre janvier et juin 2020 pour infection par le SARS-CoV-2 déclarée comme diagnostic principal ou associé, en utilisant les instructions de codage de l'ATIH pour la base de données du PMSI. Le remboursement des médicaments et l'utilisation de dispositifs médicaux, ainsi que la survenue de complications à moyen terme seront analysés sur une période d’observation s’étendant de 12 mois avant à 12 mois après la date de la première hospitalisation. Ces observations chez les sujets infectés par le SARS-CoV-2 seront comparées à celles de différents groupes contrôle : des sujets non hospitalisés au cours de la même période, et des sujets présentant une infection virale des voies respiratoires inférieures non due au SARS-CoV-2, ayant entraîné une hospitalisation, d'abord au cours d'une période ne chevauchant pas l'épidémie de COVID-19, puis au cours de la même période que les sujets infectés par le SARS-CoV-2. Les médicaments, procédures et dispositifs médicaux d'intérêt seront classés par domaine thérapeutique et identifiés par les codes ATC, les codes de procédures CCAM et les codes LPP dans la base de données DCIR. Les principaux troubles organiques étudiés seront les troubles cardiovasculaires, les troubles respiratoires, les maladies rénales chroniques, les troubles du système nerveux central et les troubles psychiatriques.

Résultats attendus.
Notre projet permettra d'identifier des troubles organiques persistants potentiels à moyen terme, requérant un suivi médical. De plus, en caractérisant mieux les troubles à moyen terme observés chez les sujets COVID-19, notre projet permettra d'anticiper la charge future de l'épidémie de COVID-19 sur le système de santé.

Consortium.
Ce projet sera mené en collaboration avec le CIC-EC 1425 (Hôpital Bichat, Paris), qui possède une expertise en méthodologie et statistiques des études cliniques dans les domaines des maladies infectieuses et émergentes, et EPI-PHARE, qui réalise, pilote et coordonne des études pharmaco-épidémiologiques en utilisant des données complexes et massives du Système National de Données de Santé français.