Modélisation intégrative de la structure et de la dynamique des protéines avec la cryo-EM – EMMI

L’objectif de ma recherche est de comprendre les mécanismes par lesquels les machines macromoléculaires remplissent leurs fonctions grâce à une caractérisation complète de leurs structures, thermodynamique et dynamique. Ces informations peuvent être fournies de manière efficace en termes d'ensembles structuraux, qui peuvent être déterminés par des méthodes intégratives combinant des approches expérimentales et informatiques. Pour atteindre cette fin, mon programme comporte trois objectifs spécifiques: i) développer une approche intégrative pour modéliser la structure et la dynamique des systèmes macromoléculaires à l'aide de la cryo-microscopie électronique et d'autres données disponibles; ii) utiliser cette approche pour révéler le rôle fonctionnel de la dynamique du pilus dans le système de sécrétion de type 2; iii) distribuer cette approche à la communauté au sein d’un module du logiciel open-source PLUMED, spécifiquement dédié à la biologie intégrative structurale et dynamique.