Recombinaison entre poliovirus et entérovirus humain de l'espèce C - un nouveau modèle d'évolution et d'émergence – RecPolioCoxEmerge

Un faible taux de couverture vaccinale avec le vaccin polio oral (OPV) permet la circulation et la dérive génétique des souches atténuées du vaccin favorisant ainsi l'émergence de souches pathogènes dérivées du vaccin (cVDPVs). Ces cVDPVs ont causé ces dernières années des épidémies de poliomyélite paralytique dans dix pays en voie de développement, notamment à Madagascar en 2002 et 2005. Il est important de pouvoir prévoir et prévenir ces épidémies iatrogènes. Curieusement la plupart des cVDPVs sont des souches recombinantes entre poliovirus (PV) et d'autres entérovirus proches, probablement des coxsackievirus A (CAV). Nos études ont permis de mettre en évidence la co-circulation à Madagascar de PV et de nombreux sérotypes et génotypes de CAV ainsi que leur évolution par recombinaison génétique permettant ainsi l'émergence de nouvelles souches pathogènes recombinantes (cVDPVs). Les particularités de ce milieu constitue un nouveau modèle d'écosystème, d'évolution et d'émergence virale, illustrant comment un agent pathogène viral majeur peut émerger d'une population virale dense et diversifiée.