Organisation génomique de l’activité transcriptionnelle du récepteur aux oestrogènes – GORGONES

Si les cellules d?un même organisme portent la même information génétique, leur identité phénotypique est générée par une expression génique différentielle. Ces programmes de régulation du transcriptome cellulaire utilisent, en plus de l?information génétique, des paramètres épigénétiques portés par des composants que l?on pensait jusqu?à récemment n?être que des éléments architecturaux du génome dans le noyau. Des modifications post-traductionnelles des histones ou bien la méthylation de l?ADN, par exemple, sont des marques épigénétiques qui constituent un niveau supplémentaire d?information : l?épigénome. Le recrutement dynamique de machineries enzymatiques mettant en place ces modifications et de protéines capables d?interpréter de telles marques permettent à l?épigénome de coordonner dans l?espace et le temps l?expression du génome. Ces mécanismes sont notamment illustrés par les recrutements cycliques et combinatoires de complexes de transcription, observés lors de la régulation de gènes dont l?expression est contrôlée par les hormones ?strogéniques via le récepteur des ?strogènes (ER). Des variations du recrutement de cofacteurs et/ou de leur dynamique en fonction du promoteur sont des paramètres importants permettant une adaptation au signal ?strogénique. Les mécanismes sous-jacents à ces variations restent cependant peu compris, notamment en ce qui concerne les liens existant entre les dynamiques de recrutements de cofacteurs transcriptionnels, l?épigénome et l?organisation chromatinienne. Dans ce contexte, nous proposons ici d?analyser les mécanismes gouvernant la dynamique de la structure chromatinienne durant la régulation de la transcription, dans le cadre de gènes régulés par les ?strogènes, isolés ou bien regroupés sous forme de clusters de gènes. En utilisant, entre autres, la technique d?immunoprécipitation de chromatine (ChIP), nous allons examiner la corrélation existant entre la structure et l?organisation des promoteurs (éléments en cis, structure de la chromatine, inclusion du gène dans un cluster) et les recrutements spécifiques de cofacteurs transcriptionnels. Les expériences proposées au sein de ce projet permettront (i) d?identifier les processus promoteur- spécifiques impliqués dans la régulation de la transcription par ER; et (ii) de considérer les liens entre ces activités et la structure chromatinienne de gènes isolés ou regroupés en cluster.