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– EPIMOBILE

Résumé de soumission

Nous avons démontré récemment au moyen d?une population unique de lignées recombinantes « épigénétiques » (epiRILs) chez la plante de référence Arabidopsis thaliana que de multiples changements d?états de méthylation de l?ADN le long du génome peuvent être transmis de manière stable pendant au moins huit générations en absence de sélection. Nous avons également montré que ces lignées, presque isogéniques, présentent une proportion importante de variation héritable pour deux trais quantitatifs mesurés, le temps à la floraison et la hauteur des plantes à maturité. Nous souhaitons dorénavant identifier les locus et la nature des changements moléculaires (changement de séquence ou de méthylation) qui sous-tendent à ces locus la variation phénotypique héritable observée. Compte tenu de l?implication essentielle de la méthylation de l?ADN dans la préservation de l?intégrité du génome, notamment au travers de son rôle de répression de l?activité des éléments transposables, nous proposons d?effectuer le séquençage du génome d?un nombre important d?epiRILs au moyen des technologies de nouvelle génération, afin de déterminer le spectre complet des changements de séquences induits par les altérations de méthylation à l?origine de la construction des epiRILs. Cette analyse sera couplée à celle des polymorphismes de méthylation effectuée sur ces mêmes epiRILs dans le cadre d?un projet en cours afin de fournir des données solides sur le type et la fréquence des changements de séquence associés en cis à ces polymorphismes. Ces données de séquence donneront notamment une indication précise du nombre et de l?identité des éléments transposables mobilisés en réponse aux altérations de méthylation. Une analyse bioinformatique poussée des éléments mobiles et non-mobiles sera entreprise et sera complétée par des tests génétiques et moléculaires afin d?identifier les déterminants de la mobilisation des éléments transposables du génome d?Arabidopsis. Ce projet donnera enfin pour la première fois une liste de QTL générés au travers d?altérations profondes de la méthylation de l?ADN, pour lesquels la cause de la variation sera identifiée (changement de séquence et/out de méthylation).

Coordination du projet

L'auteur de ce résumé est le coordinateur du projet, qui est responsable du contenu de ce résumé. L'ANR décline par conséquent toute responsabilité quant à son contenu.

Partenaire

Aide de l'ANR 0 euros
Début et durée du projet scientifique : - 0 Mois

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