– Chor-Evo-Net
Les réseaux de régulation génique sont au coeur du programme transcriptionnel. Les noeuds de ces réseaux sont les gènes codant pour les facteurs de transcription et les signaux de communication cellulaire. Leurs arêtes sont les relations de régulation directe qui lient ces gènes par le biais de leurs séquences cis-régulatrices. Les travaux sur des micro-organismes simples ont révélé que l'analyse de l'architecture des réseaux constitue est un moyen puissant pour comprendre comment l'information génétique encodée par le génome est transformée en un jeu de règles opérationnelles orchestrant les processus cellulaires, une logique qui ne peut pas être appréhendée par l'analyse de gènes individuels. L'extension de ces analyses aux métazoaires constitue un formidable défi du fait de la complexité génomique de ces organismes, de la plus grande sophistication de leur mécanismes de régulation transcriptionnelle, et de leur organisation multicellulaire. Néanmoins le déchiffrage partiel de réseaux de régulation régissant le développement de la Drosophile, des oursins, du Xénope et des ascidies a été récement rapporté. Bien que ces réseaux soient encore très incomplets, leur analyse initiale a révélé quelques principes structurels généraux qui distinguent les réseaux développementaux des métazoaires de ceux plus simples des micro-organismes. Des analyses comparatives ont également indiquées que les changements dans l'architecture des réseaux jouaient un role primordial dans l'évolution des formes animales. Il a été en particulier suggéré, mais pas robustement démontré, que des régions spécifiques fortement connexes des réseaux de régulation appelés kernels sont fortement conservés et pourraient être responsables de la stabilité évolutives de traits spécifiques à un phylum, tels que le plan du corps. Le but de ce projet est de reconstruire et d'analyser mathématiquement le réseau de régulation transcriptionnel régissant le développement embryonniare de l'ascidie Ciona intestinalis, qui partage avec les vertébrés son plan du corps larvaire. Puis, nous utiliserons ce réseau comme base pour analyser , par comparaison avec un poisson téléostéen, le niveau de conservation du programme développemental des chordés et sa relation avec la connexité locale des réseaux de régulation. Par cette approche nous espérons identifier quelques uns des mécanismes clés qui ont conduits à l'émergence des chordés.
Coordination du projet
Organisme de recherche
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Partenariat
Aide de l'ANR 740 000 euros
Début et durée du projet scientifique :
- 48 Mois