– Sexychrom

Chez les organismes sexués, la fusion des gamètes rassemble deux noyaux à la configuration chromatinienne distincte, dictée par les spécificités des gamétogenèses femelle et mâle. Les premières étapes du développement de l'embryon, et l'acquisition de la totipotence, s' accompagnent d'un remodelage global de la chromatine, durant lequel les différences épigénétiques entre chromosomes parentaux sont soit maintenues, soit effacées, et potentiellement soumises à la sélection naturelle. Ces processus de re-programmation conduisent à l'activation coordonnée de l'expression des génomes maternel et paternel. Cette dynamique est bien décrite chez différents modéles animaux, et commence a être appréhendée chez les plantes. Par ailleurs, le niveau de conservation de ces mécanismes entre plantes et animaux reste largement inexploré. Dans ce projet, nous proposons d'étudier chez les plantes les mécanismes épigénétiques associés à la mise en place de l'activité transcriptionnelle dans les produits de la fécondation, l'embryon et l'albumen, en utilisant l'espèce modèle Arabidopsis thaliana. Dans une première phase du projet, par des approches cellulaires, nous décrirons les profils de marqueurs de l'activation de la transcription (forme active de la RNA polymerase II, modifications post-traductionelles des histones associées à la transcription) et de l'hétérochromatine (associée à l'inactivation de l'expression génique), avant et après la fécondation. L'étude parallèle de mutants affectés dans les régulateurs connus de la chromatine chez Arabidopsis fournira une dissection mécanistique des processus en jeu. Nous analyserons de plus les dynamiques de condensation et decondensation des génomes parentaux via l'observation in vivo de fusions histones ::proteines fluorescentes, notre objectif étant de déterminer par une analyse génétique le rôle potentiel des histones chaperones contrôlant l'assemblage des nucleosomes au cours de ces étapes du développement. La deuxième phase du projet s'intéresse au contrôle de l'activité transcriptionelle dans le développement précoce de l'embryon et de l'albumen. Nous abordons la question du rôle respectif de la transcription de novo et des transcrits maternels « déposés » avant fécondation durant les premières divisions des produits de la fécondation par une approche RNAi ciblant l'activité RNA polymerase II. Par ailleurs, pour évaluer l'activité respective des génomes maternel et paternel au cours du développement précoce, nous proposons une approche de profiling par pyroséquencage permettant de distinguer l'origine parentale des gènes exprimés à ce stade.